More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_0016 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0017  amidohydrolase  88.71 
 
 
1049 aa  798    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0016  WD40 domain-containing protein  100 
 
 
445 aa  914    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  97.04 
 
 
1062 aa  887    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  97.49 
 
 
1062 aa  887    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  78.21 
 
 
1065 aa  734    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  78.67 
 
 
1067 aa  731    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  77.17 
 
 
1069 aa  724    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  78.78 
 
 
1081 aa  727    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  90.89 
 
 
1062 aa  839    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  93.17 
 
 
1062 aa  857    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  90.21 
 
 
1062 aa  835    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  78.21 
 
 
1060 aa  732    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  80.69 
 
 
1066 aa  752    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  89.75 
 
 
1062 aa  832    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  98.18 
 
 
1062 aa  893    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  76.48 
 
 
1062 aa  714    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  61.06 
 
 
1071 aa  533  1e-150  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  55.71 
 
 
1138 aa  503  1e-141  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1098  amidohydrolase  50.61 
 
 
1078 aa  455  1e-127  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  47.66 
 
 
1062 aa  439  9.999999999999999e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  49.87 
 
 
1084 aa  409  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0466  amidohydrolase  47.23 
 
 
1113 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.83396  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03499  amidohydrolase  44.32 
 
 
1111 aa  394  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1803  amidohydrolase  30.05 
 
 
1052 aa  151  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000234818 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  31.25 
 
 
1005 aa  147  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  29.41 
 
 
1059 aa  130  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  29.38 
 
 
1042 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  29.06 
 
 
1040 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  28.27 
 
 
1042 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  26.89 
 
 
1014 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5049  amidohydrolase  26.51 
 
 
1031 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424824  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  27.82 
 
 
1097 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  27.14 
 
 
1010 aa  97.8  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  27.22 
 
 
1090 aa  92.4  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  25.38 
 
 
1082 aa  83.6  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  25.54 
 
 
717 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  25.2 
 
 
1067 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  27.38 
 
 
419 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6483  peptidase S41  26.3 
 
 
1125 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0089  tricorn protease  24.21 
 
 
1084 aa  80.1  0.00000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000582269  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  31.69 
 
 
432 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5623  WD40 domain protein beta Propeller  29.53 
 
 
956 aa  79.7  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.101899 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  29.2 
 
 
427 aa  79.3  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0926  peptidase S41  23.2 
 
 
1075 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5294  peptidase S41  29.27 
 
 
1167 aa  79  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  29.53 
 
 
427 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6416  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  28.51 
 
 
362 aa  79  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2750  peptidase S41  25.2 
 
 
1076 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.956539  normal  0.394913 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.77 
 
 
446 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  31.79 
 
 
426 aa  78.2  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.74 
 
 
446 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  29.74 
 
 
446 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  33.33 
 
 
403 aa  77.8  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  31.87 
 
 
445 aa  77.4  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  34.5 
 
 
567 aa  76.6  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0857  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.83 
 
 
670 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  28.77 
 
 
572 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.65 
 
 
430 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0144  translocation protein TolB  30.5 
 
 
442 aa  75.9  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  30.65 
 
 
435 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0859  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  26.13 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  28.05 
 
 
428 aa  74.3  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  32.03 
 
 
436 aa  73.9  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0769  translocation protein TolB  26.21 
 
 
431 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103724  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  31.89 
 
 
425 aa  73.2  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0677  translocation protein TolB  26.21 
 
 
431 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0800  translocation protein TolB  26.21 
 
 
431 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665253  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0694  translocation protein TolB  26.21 
 
 
431 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125399  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  32.68 
 
 
450 aa  72  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  31.76 
 
 
446 aa  72.4  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  27.01 
 
 
428 aa  72  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  31.85 
 
 
461 aa  72  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  30.48 
 
 
445 aa  71.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4234  transcriptional regulatory protein-like  25.26 
 
 
469 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0629  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  26.25 
 
 
1028 aa  71.2  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3889  translocation protein TolB  26.21 
 
 
431 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53422  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  26.99 
 
 
440 aa  70.5  0.00000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1949  translocation protein TolB  26.91 
 
 
433 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2081  translocation protein TolB  26.91 
 
 
433 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  31.21 
 
 
429 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal 
 
 
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  26.99 
 
 
437 aa  70.9  0.00000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2661  translocation protein TolB  26.91 
 
 
431 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3256  translocation protein TolB  26.91 
 
 
463 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0827  translocation protein TolB  26.91 
 
 
463 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.42 
 
 
407 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0317  translocation protein TolB  25.81 
 
 
431 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0520547  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  30 
 
 
437 aa  70.5  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3241  translocation protein TolB  26.91 
 
 
430 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.786429  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3203  translocation protein TolB  26.91 
 
 
430 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95129  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3933  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  26.15 
 
 
298 aa  70.1  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0249  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  34.87 
 
 
497 aa  69.7  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  34.22 
 
 
316 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  25.75 
 
 
969 aa  68.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  25.81 
 
 
431 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  28.57 
 
 
430 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  30.07 
 
 
434 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  32.74 
 
 
441 aa  69.7  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  30.48 
 
 
415 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2178  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  25.26 
 
 
292 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  29.41 
 
 
444 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>