More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_0015 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  80.63 
 
 		 1069 aa  1038    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  62.6 
 
 		 1071 aa  801    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0017  amidohydrolase  91.3 
 
 		 1049 aa  1157    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  99 
 
 		 1062 aa  1228    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03499  amidohydrolase  53.92 
 
 		 1111 aa  658    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0015  amidohydrolase  100 
 
 		 598 aa  1243    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  82.97 
 
 		 1067 aa  1046    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  98.49 
 
 		 1062 aa  1223    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  81.09 
 
 		 1081 aa  1044    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  83.92 
 
 		 1065 aa  1052    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  99.33 
 
 		 1062 aa  1232    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  92.47 
 
 		 1062 aa  1166    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  92.47 
 
 		 1062 aa  1167    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  82.78 
 
 		 1060 aa  1055    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  80.4 
 
 		 1066 aa  1017    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  92.31 
 
 		 1062 aa  1169    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  81.56 
 
 		 1062 aa  1041    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  95.15 
 
 		 1062 aa  1190    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0466  amidohydrolase  50.25 
 
 		 1113 aa  622  1e-177  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.83396  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  49.09 
 
 		 1138 aa  612  9.999999999999999e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  45.02 
 
 		 1084 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  43.85 
 
 		 1062 aa  530  1e-149  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1098  amidohydrolase  43.56 
 
 		 1078 aa  527  1e-148  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1803  amidohydrolase  29.28 
 
 		 1052 aa  230  6e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000234818 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  24.8 
 
 		 1005 aa  118  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  23.78 
 
 		 1059 aa  108  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  25.05 
 
 		 1014 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  24.24 
 
 		 1042 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  24.19 
 
 		 1040 aa  104  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  24.57 
 
 		 1042 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5176  amidohydrolase  25.68 
 
 		 686 aa  100  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.167618  normal  0.830849 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  22.72 
 
 		 1010 aa  92.8  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0535  amidohydrolase family protein  22.39 
 
 		 672 aa  91.3  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0618  amidohydrolase  23.49 
 
 		 496 aa  90.1  9e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210154 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  25.85 
 
 		 433 aa  90.1  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  24.94 
 
 		 420 aa  88.6  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  23.88 
 
 		 430 aa  86.3  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2365  amidohydrolase  25.8 
 
 		 470 aa  84.3  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  23.57 
 
 		 407 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1790  amidohydrolase  25.35 
 
 		 440 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  25.12 
 
 		 407 aa  82.8  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  24.45 
 
 		 438 aa  82.8  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  25.3 
 
 		 413 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1275  amidohydrolase  24 
 
 		 415 aa  82  0.00000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3987  amidohydrolase  25.38 
 
 		 435 aa  81.3  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  25.06 
 
 		 413 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2416  amidohydrolase  24.1 
 
 		 702 aa  80.1  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0066037  normal  0.0385776 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1105  amidohydrolase  22.25 
 
 		 478 aa  79.7  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  25.24 
 
 		 423 aa  79.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  24.26 
 
 		 437 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  24.52 
 
 		 459 aa  78.6  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  24.64 
 
 		 444 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5049  amidohydrolase  23.54 
 
 		 1031 aa  77.8  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424824  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  25.3 
 
 		 413 aa  76.6  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2556  amidohydrolase  23.93 
 
 		 483 aa  75.9  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  24.09 
 
 		 443 aa  75.5  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1597  amidohydrolase  24.17 
 
 		 477 aa  74.7  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.080388  normal  0.526129 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  23.8 
 
 		 426 aa  74.3  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  24.76 
 
 		 425 aa  73.6  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  23.33 
 
 		 455 aa  73.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2932  amidohydrolase  22.41 
 
 		 431 aa  72  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2093  amidohydrolase  25.96 
 
 		 568 aa  71.6  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.351411  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  23.93 
 
 		 433 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2881  amidohydrolase  23.56 
 
 		 819 aa  70.5  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  24.15 
 
 		 421 aa  68.2  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2410  amidohydrolase  36.54 
 
 		 438 aa  68.2  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0002152  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  23.22 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3072  amidohydrolase  50 
 
 		 388 aa  67.4  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120887  normal  0.513246 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  22.41 
 
 		 407 aa  67.4  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  24.62 
 
 		 409 aa  67  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  24.62 
 
 		 409 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  24.62 
 
 		 409 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  32.37 
 
 		 444 aa  65.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3381  amidohydrolase  34.65 
 
 		 455 aa  66.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.571146 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3211  amidohydrolase  22.57 
 
 		 680 aa  66.2  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0258  amidohydrolase  23.19 
 
 		 441 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0639139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0971  amidohydrolase 3  28.43 
 
 		 666 aa  65.1  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.59323  normal  0.0406107 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  34.74 
 
 		 470 aa  64.7  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3085  amidohydrolase family protein  42.47 
 
 		 694 aa  64.7  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  25.8 
 
 		 432 aa  64.3  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  23.02 
 
 		 440 aa  64.3  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0482  amidohydrolase  44.93 
 
 		 383 aa  64.3  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129466  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  23.97 
 
 		 411 aa  63.9  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0417  amidohydrolase  25.99 
 
 		 483 aa  63.9  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  23.94 
 
 		 416 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  30.77 
 
 		 419 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  27.69 
 
 		 430 aa  62  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3741  amidohydrolase  33.63 
 
 		 386 aa  61.6  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00788915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0268  amidohydrolase  28.67 
 
 		 451 aa  61.2  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.863034  normal  0.27554 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  34.48 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  42.86 
 
 		 405 aa  60.8  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0915842 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  24.64 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2344  amidohydrolase  26.92 
 
 		 485 aa  60.5  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.684912  normal  0.818181 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  21.18 
 
 		 401 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5309  amidohydrolase  30.25 
 
 		 543 aa  60.1  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.700694  normal  0.749654 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  35.71 
 
 		 434 aa  59.3  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  26.18 
 
 		 436 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  31.3 
 
 		 405 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1872  hypothetical protein  42.86 
 
 		 381 aa  59.3  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.267326  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  40.28 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>