14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_0008 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_0008  monoheme cytochrome c, putative  100 
 
 
127 aa  265  1e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0008  monoheme cytochrome c, putative  97.64 
 
 
127 aa  258  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0100224 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0008  monoheme cytochrome c, putative  92.91 
 
 
127 aa  247  5e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000351615 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0716  monoheme cytochrome c, putative  84.21 
 
 
127 aa  200  5e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0980  hypothetical protein  59.48 
 
 
129 aa  153  8e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00330636  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1174  hypothetical protein  52.94 
 
 
126 aa  142  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000759972 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2873  hypothetical protein  43.62 
 
 
131 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3623  hypothetical protein  36.73 
 
 
135 aa  79.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.599999  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6938  hypothetical protein  43.02 
 
 
183 aa  74.3  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0030  hypothetical protein  35.19 
 
 
113 aa  70.9  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.593403  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0004  hypothetical protein  34.26 
 
 
113 aa  70.1  0.000000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.408251  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0008  hypothetical protein  35.85 
 
 
111 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3243  hypothetical protein  31.25 
 
 
131 aa  63.5  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984975  normal  0.679111 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2982  hypothetical protein  36.92 
 
 
116 aa  49.7  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>