More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_4307 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4483  TonB-dependent siderophore receptor  70.8 
 
 		 712 aa  1033    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000188322  hitchhiker  0.0000171512 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4959  TonB-dependent receptor  52.08 
 
 		 706 aa  741    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4743  TonB-dependent receptor, putative  90.87 
 
 		 690 aa  1297    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4236  TonB-dependent siderophore receptor  70.65 
 
 		 710 aa  1054    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000695536  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4894  TonB-dependent siderophore receptor  71.87 
 
 		 714 aa  1070    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142345  normal  0.811526 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4363  TonB-dependent siderophore receptor  99.72 
 
 		 706 aa  1451    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000323777  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4307  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 706 aa  1454    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000234699  hitchhiker  0.000000000225287 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4504  TonB-dependent siderophore receptor  91.36 
 
 		 703 aa  1332    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000141313  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3953  TonB-dependent siderophore receptor  87.82 
 
 		 701 aa  1285    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000731032  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4127  TonB-dependent siderophore receptor  85.51 
 
 		 702 aa  1258    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00050238  normal  0.542591 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3841  TonB-dependent siderophore receptor  73.57 
 
 		 712 aa  1051    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000249714  hitchhiker  0.000312087 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3641  TonB-dependent receptor, putative  64.23 
 
 		 697 aa  941    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000783326  normal  0.0764781 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4362  TonB-dependent siderophore receptor  98.3 
 
 		 706 aa  1434    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000023504  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3922  TonB-dependent siderophore receptor  83.57 
 
 		 709 aa  1228    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000715438  normal  0.0397715 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4014  TonB-dependent siderophore receptor  83.15 
 
 		 709 aa  1220    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00017833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4042  TonB-dependent siderophore receptor  82.15 
 
 		 697 aa  1217    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.296308  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06761  hypothetical protein  44.88 
 
 		 690 aa  574  1.0000000000000001e-162  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000849  putative ferrichrome-iron receptor  43.27 
 
 		 699 aa  560  1e-158  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.744816  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0110  TonB dependent receptor  40.11 
 
 		 693 aa  509  1e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1814  putative putative ferrichrome-iron receptor  36.94 
 
 		 693 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  30.64 
 
 		 770 aa  263  8e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  30.64 
 
 		 710 aa  263  8e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  30.27 
 
 		 710 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  28.23 
 
 		 706 aa  224  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  28.23 
 
 		 706 aa  224  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  28.55 
 
 		 738 aa  213  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  26.63 
 
 		 757 aa  213  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  26.96 
 
 		 709 aa  212  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  28.43 
 
 		 694 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  28.08 
 
 		 749 aa  208  3e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1590  TonB-dependent siderophore receptor  28.39 
 
 		 737 aa  208  3e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1443  TonB-dependent siderophore receptor  26.75 
 
 		 743 aa  208  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281605  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  27.82 
 
 		 742 aa  206  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  27.27 
 
 		 695 aa  206  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  27.94 
 
 		 748 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  27.94 
 
 		 748 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  27.66 
 
 		 724 aa  205  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  28.38 
 
 		 715 aa  206  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  28.09 
 
 		 742 aa  204  4e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  28.19 
 
 		 850 aa  204  6e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  27.18 
 
 		 708 aa  204  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  26.42 
 
 		 708 aa  204  6e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  26.8 
 
 		 721 aa  202  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2514  TonB-dependent siderophore receptor  27.96 
 
 		 726 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  26.69 
 
 		 703 aa  201  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  26.7 
 
 		 796 aa  201  5e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  26.31 
 
 		 707 aa  201  5e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  27.16 
 
 		 719 aa  200  9e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  27.72 
 
 		 740 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0715  TonB-dependent siderophore receptor  26.77 
 
 		 698 aa  198  3e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  25.75 
 
 		 860 aa  198  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 795 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  26.66 
 
 		 796 aa  197  7e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  26.57 
 
 		 726 aa  197  7e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  26.95 
 
 		 710 aa  197  7e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  28.11 
 
 		 713 aa  197  8.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  26.57 
 
 		 796 aa  196  9e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 795 aa  196  9e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  26.64 
 
 		 711 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  26.32 
 
 		 796 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  27.92 
 
 		 709 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  25.45 
 
 		 707 aa  195  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  26.37 
 
 		 792 aa  194  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  28.15 
 
 		 708 aa  194  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  27.91 
 
 		 713 aa  194  5e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  27.06 
 
 		 743 aa  192  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  26.01 
 
 		 726 aa  192  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  27.23 
 
 		 696 aa  191  5e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  26.84 
 
 		 696 aa  190  7e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.44 
 
 		 711 aa  190  9e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  27.25 
 
 		 689 aa  190  9e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  28.09 
 
 		 809 aa  188  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0802  TonB-dependent siderophore receptor  26.34 
 
 		 764 aa  188  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  28.03 
 
 		 817 aa  187  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  27.59 
 
 		 862 aa  187  5e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  26.69 
 
 		 815 aa  187  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1933  TonB-dependent siderophore receptor  26.7 
 
 		 863 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57776  hitchhiker  0.00557515 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  26.65 
 
 		 710 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  27.13 
 
 		 864 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5420  TonB-dependent siderophore receptor  27.32 
 
 		 743 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00589363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4504  TonB-dependent siderophore receptor  26.37 
 
 		 858 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198405  normal  0.487097 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  27.12 
 
 		 713 aa  186  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1057  TonB-dependent siderophore receptor  27.15 
 
 		 719 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12330  TonB-dependent siderophore receptor  27.13 
 
 		 769 aa  184  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  27.06 
 
 		 791 aa  184  7e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1610  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.55 
 
 		 724 aa  184  7e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1361  TonB-dependent siderophore receptor  26.39 
 
 		 855 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586931  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0879  TonB-dependent siderophore receptor  26.39 
 
 		 855 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.136442  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  27.06 
 
 		 791 aa  183  9.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0391  TonB-dependent siderophore receptor  27.15 
 
 		 712 aa  183  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.196206  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3576  TonB-dependent siderophore receptor  27.06 
 
 		 743 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0391438 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 715 aa  181  5.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1381  TonB-dependent siderophore receptor  25.14 
 
 		 742 aa  181  5.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00176773  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  27.66 
 
 		 779 aa  180  8e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  25.43 
 
 		 843 aa  180  9e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  26.67 
 
 		 701 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  27.58 
 
 		 708 aa  179  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  25.21 
 
 		 812 aa  179  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  27.44 
 
 		 738 aa  180  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5036  TonB-dependent siderophore receptor  27.21 
 
 		 751 aa  179  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.549683 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>