More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_4273 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4687  UDP-glucose 6-dehydrogenase  85.79 
 
 		 387 aa  682    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0071  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  98.71 
 
 		 387 aa  780    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4273  nucleotide sugar dehydrogenase  100 
 
 		 387 aa  793    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4328  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  98.19 
 
 		 387 aa  778    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4468  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  97.93 
 
 		 387 aa  776    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3885  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  83.98 
 
 		 409 aa  673    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3978  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  84.75 
 
 		 409 aa  678    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4088  phosphoglycerate mutase  84.5 
 
 		 409 aa  675    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1418  UDP-glucose 6-dehydrogenase  73.97 
 
 		 388 aa  599  1e-170  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1330  UDP-glucose 6-dehydrogenase  71.65 
 
 		 388 aa  591  1e-168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.143594  decreased coverage  0.000414466 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1202  nucleotide sugar dehydrogenase  72.68 
 
 		 389 aa  590  1e-167  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.988641  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001761  UDP-glucose dehydrogenase  70.88 
 
 		 388 aa  587  1e-167  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1572  nucleotide sugar dehydrogenase  71.39 
 
 		 388 aa  590  1e-167  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1387  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  72.94 
 
 		 388 aa  588  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.496605  hitchhiker  0.0000966488 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3019  nucleotide sugar dehydrogenase  71.39 
 
 		 397 aa  589  1e-167  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0876853 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1629  nucleotide sugar dehydrogenase  70.1 
 
 		 388 aa  581  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00733567  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1614  nucleotide sugar dehydrogenase  70.36 
 
 		 388 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.812894 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1032  UDP-glucose 6-dehydrogenase  70.36 
 
 		 388 aa  581  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.366892 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2115  DNA gyrase, subunit A  71.39 
 
 		 388 aa  581  1.0000000000000001e-165  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.539484 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0800  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  70.8 
 
 		 391 aa  582  1.0000000000000001e-165  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0919  nucleotide sugar dehydrogenase  70.62 
 
 		 388 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00213667  normal  0.147124 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01930  UDP-glucose 6-dehydrogenase  70.1 
 
 		 388 aa  580  1e-164  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.586017  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2961  UDP-glucose 6-dehydrogenase  69.85 
 
 		 388 aa  578  1e-164  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000204361 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01916  hypothetical protein  70.1 
 
 		 388 aa  580  1e-164  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656876  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2319  UDP-glucose 6-dehydrogenase  70.1 
 
 		 388 aa  579  1e-164  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1373  UDP-glucose 6-dehydrogenase  70.62 
 
 		 388 aa  580  1e-164  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00706  nucleotide sugar dehydrogenase  69.59 
 
 		 388 aa  580  1e-164  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1795  nucleotide sugar dehydrogenase  68.56 
 
 		 389 aa  574  1.0000000000000001e-163  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00992  nucleotide sugar dehydrogenase  70.54 
 
 		 395 aa  576  1.0000000000000001e-163  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000137814  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2178  UDP-glucose 6-dehydrogenase  68.81 
 
 		 388 aa  571  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112663  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2418  udp-glucose 6-dehydrogenase  70.1 
 
 		 388 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233828 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2259  udp-glucose 6-dehydrogenase  70.1 
 
 		 388 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.389868  normal  0.025931 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2641  UDP-glucose 6-dehydrogenase  69.33 
 
 		 388 aa  573  1.0000000000000001e-162  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2205  udp-glucose 6-dehydrogenase  70.1 
 
 		 388 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.638468  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2306  udp-glucose 6-dehydrogenase  69.85 
 
 		 388 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0255325 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2849  nucleotide sugar dehydrogenase  70.62 
 
 		 388 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1203  UDP-glucose 6-dehydrogenase  69.33 
 
 		 388 aa  570  1e-161  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.699954  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  69.59 
 
 		 388 aa  568  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0186642 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2929  nucleotide sugar dehydrogenase  69.59 
 
 		 388 aa  558  1e-158  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0591  UDP-glucose 6-dehydrogenase  67.53 
 
 		 388 aa  560  1e-158  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1510  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  67.95 
 
 		 390 aa  557  1e-158  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1968  UDP-glucose 6-dehydrogenase  67.01 
 
 		 389 aa  560  1e-158  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2679  nucleotide sugar dehydrogenase  67.27 
 
 		 388 aa  558  1e-158  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1349  nucleotide sugar dehydrogenase  68.3 
 
 		 388 aa  551  1e-156  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0720  UDP-glucose 6-dehydrogenase  66.49 
 
 		 388 aa  552  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875671  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3483  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  66.24 
 
 		 389 aa  538  9.999999999999999e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.956099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2850  nucleotide sugar dehydrogenase  64.95 
 
 		 388 aa  531  1e-150  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.217055  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1563  UDP-glucose 6-dehydrogenase  64.69 
 
 		 397 aa  524  1e-147  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.03127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3861  UDP-glucose 6-dehydrogenase  63.9 
 
 		 398 aa  513  1e-144  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0444005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1067  UDP-glucose 6-dehydrogenase  63.24 
 
 		 391 aa  508  1e-143  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.575864  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1498  nucleotide sugar dehydrogenase  60.77 
 
 		 389 aa  496  1e-139  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1256  transcriptional regulator, XRE family  58.58 
 
 		 491 aa  487  1e-136  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1737  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.73 
 
 		 388 aa  465  9.999999999999999e-131  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0900  hypothetical protein  57.18 
 
 		 397 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0374108 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0275  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase, dimerisation  53.3 
 
 		 422 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0309187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0150  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.15 
 
 		 372 aa  403  1e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0958685  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0592  nucleotide sugar dehydrogenase  47.67 
 
 		 389 aa  363  2e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.887508 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0568  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  47.67 
 
 		 389 aa  363  2e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00339328  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0599  nucleotide sugar dehydrogenase  47.67 
 
 		 389 aa  363  2e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  31.92 
 
 		 427 aa  167  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7670  nucleotide sugar dehydrogenase  30.6 
 
 		 439 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.888609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1130  nucleotide sugar dehydrogenase  32.28 
 
 		 453 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.62 
 
 		 451 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1764  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.93 
 
 		 425 aa  161  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.796911  normal  0.409605 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  28.61 
 
 		 466 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1513  nucleotide sugar dehydrogenase  32.58 
 
 		 437 aa  159  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2750  nucleotide sugar dehydrogenase  29.74 
 
 		 475 aa  159  8e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.92 
 
 		 456 aa  158  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2024  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  28.89 
 
 		 450 aa  159  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1853  nucleotide sugar dehydrogenase  30.11 
 
 		 441 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5366  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.64 
 
 		 456 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5049  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.45 
 
 		 462 aa  156  7e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.61 
 
 		 460 aa  156  7e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2277  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.16 
 
 		 451 aa  155  9e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00280919  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4879  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.45 
 
 		 462 aa  155  9e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5434  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.45 
 
 		 441 aa  155  9e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4894  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.45 
 
 		 462 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3344  nucleotide sugar dehydrogenase  30.29 
 
 		 457 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5290  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.45 
 
 		 456 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000221682 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.92 
 
 		 442 aa  155  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1145  nucleotide sugar dehydrogenase  29.56 
 
 		 444 aa  155  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.91161  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.7 
 
 		 437 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0603  nucleotide sugar dehydrogenase  31.93 
 
 		 441 aa  155  2e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0685216  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.42 
 
 		 436 aa  154  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0210  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.36 
 
 		 453 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2042  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.22 
 
 		 445 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  30.81 
 
 		 435 aa  154  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4614  nucleotide sugar dehydrogenase  29.48 
 
 		 431 aa  154  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  30.17 
 
 		 437 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4994  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.81 
 
 		 456 aa  153  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3078  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.21 
 
 		 426 aa  153  5e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.455066  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  30.17 
 
 		 437 aa  153  5e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  29.09 
 
 		 440 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1350  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.02 
 
 		 441 aa  152  1e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000563405 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5321  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.73 
 
 		 441 aa  151  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0618  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  30.9 
 
 		 434 aa  151  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0769  nucleotide sugar dehydrogenase  30.9 
 
 		 434 aa  151  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2477  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.45 
 
 		 471 aa  151  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0541405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5638  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.86 
 
 		 441 aa  151  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000154055 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1284  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  29.28 
 
 		 439 aa  150  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.583067 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>