133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_4258 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_4258  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  441  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000918531  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0086  hypothetical protein  99.54 
 
 
219 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.084364  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4313  hypothetical protein  99.54 
 
 
219 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000298941  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4453  hypothetical protein  99.54 
 
 
219 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00367803  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3875  hypothetical protein  91.78 
 
 
219 aa  393  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0609678  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4715  hypothetical protein  90.87 
 
 
219 aa  385  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3870  hypothetical protein  90.78 
 
 
217 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000480386  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3963  hypothetical protein  90.78 
 
 
217 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000681461  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4073  hypothetical protein  90.78 
 
 
217 aa  382  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000180741  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0128  hypothetical protein  81.28 
 
 
221 aa  369  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.517941  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4090  hypothetical protein  79.26 
 
 
219 aa  363  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0091  hypothetical protein  81.11 
 
 
223 aa  365  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000285366  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3914  hypothetical protein  79.72 
 
 
226 aa  362  2e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0574416  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0214  hypothetical protein  81.9 
 
 
219 aa  361  5.0000000000000005e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3679  hypothetical protein  78.54 
 
 
222 aa  360  7.0000000000000005e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000848067  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0128  hypothetical protein  77.42 
 
 
219 aa  348  4e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00134236  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2628  hypothetical protein  75.46 
 
 
219 aa  337  9.999999999999999e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.916509 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00342  hypothetical protein  62.1 
 
 
224 aa  276  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002094  putative preQ0 transporter  61.64 
 
 
245 aa  274  6e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2279  hypothetical protein  62.33 
 
 
223 aa  272  2.0000000000000002e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1936  hypothetical protein  62.2 
 
 
224 aa  266  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0191  hypothetical protein  60 
 
 
227 aa  263  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0226  hypothetical protein  60.47 
 
 
221 aa  261  4.999999999999999e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0050  hypothetical protein  59.72 
 
 
216 aa  256  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0091  hypothetical protein  59.81 
 
 
225 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2745  hypothetical protein  63.4 
 
 
222 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0268522  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2235  hypothetical protein  63.4 
 
 
222 aa  251  5.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.638695  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0086  hypothetical protein  59.81 
 
 
225 aa  250  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.106131  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3755  hypothetical protein  59.33 
 
 
221 aa  249  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4791  hypothetical protein  59.33 
 
 
221 aa  249  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0231  hypothetical protein  57.08 
 
 
222 aa  248  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3987  hypothetical protein  57.08 
 
 
222 aa  248  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0569  hypothetical protein  57.08 
 
 
222 aa  248  5e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3848  hypothetical protein  58.85 
 
 
221 aa  248  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3891  hypothetical protein  58.85 
 
 
221 aa  248  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3781  hypothetical protein  58.85 
 
 
221 aa  248  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3951  hypothetical protein  58.85 
 
 
221 aa  248  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03320  conserved inner membrane protein  58.85 
 
 
221 aa  248  7e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0244  conserved hypothetical protein  58.85 
 
 
221 aa  248  7e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3670  hypothetical protein  58.85 
 
 
221 aa  248  7e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3953  hypothetical protein  58.85 
 
 
221 aa  248  7e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03273  hypothetical protein  58.85 
 
 
221 aa  248  7e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3851  hypothetical protein  58.85 
 
 
221 aa  248  7e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3771  hypothetical protein  58.85 
 
 
246 aa  247  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0204  hypothetical protein  60.29 
 
 
221 aa  247  9e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.114304 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0245  hypothetical protein  58.85 
 
 
221 aa  246  1e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00140  hypothetical protein  57.28 
 
 
217 aa  246  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3883  hypothetical protein  59.33 
 
 
223 aa  246  3e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3878  hypothetical protein  57.42 
 
 
221 aa  243  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0922175 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0541  hypothetical protein  53.74 
 
 
236 aa  241  6e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0013  hypothetical protein  57.21 
 
 
218 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4070  hypothetical protein  56.94 
 
 
222 aa  236  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0322  hypothetical protein  46.03 
 
 
225 aa  187  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0305  hypothetical protein  45.5 
 
 
225 aa  186  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2014  hypothetical protein  36.99 
 
 
223 aa  105  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.736236  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1938  hypothetical protein  36.99 
 
 
223 aa  105  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0917  hypothetical protein  36.07 
 
 
216 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4043  hypothetical protein  34.82 
 
 
210 aa  102  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2665  hypothetical protein  41.61 
 
 
210 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0023  hypothetical protein  43.45 
 
 
208 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3340  hypothetical protein  42.76 
 
 
207 aa  98.2  7e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3880  hypothetical protein  36.74 
 
 
211 aa  98.2  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0764274 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3587  hypothetical protein  36.28 
 
 
211 aa  96.3  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.492046  normal  0.202587 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0027  hypothetical protein  32.47 
 
 
208 aa  95.5  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2296  hypothetical protein  33.99 
 
 
181 aa  93.2  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0878915  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2662  hypothetical protein  32.67 
 
 
204 aa  92  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0078  hypothetical protein  32.04 
 
 
220 aa  91.7  8e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2557  hypothetical protein  31.84 
 
 
212 aa  91.3  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.216899  normal  0.863189 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3073  hypothetical protein  41.22 
 
 
208 aa  89.7  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1365  hypothetical protein  42.36 
 
 
208 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0033  hypothetical protein  42.36 
 
 
208 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1418  hypothetical protein  34.29 
 
 
189 aa  85.5  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0352  hypothetical protein  34.02 
 
 
186 aa  85.1  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal  0.803247 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0543  hypothetical protein  33.16 
 
 
235 aa  65.9  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0144  hypothetical protein  28.4 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.852907  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1009  hypothetical protein  28.38 
 
 
234 aa  60.8  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.562517  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2724  hypothetical protein  26.98 
 
 
263 aa  59.7  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.965151  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1492  hypothetical protein  27.52 
 
 
234 aa  59.3  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1521  hypothetical protein  27.52 
 
 
234 aa  59.3  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0569  hypothetical protein  30.77 
 
 
229 aa  58.5  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0021  hypothetical protein  28.57 
 
 
235 aa  58.5  0.00000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1833  hypothetical protein  33.33 
 
 
228 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.037542  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0995  hypothetical protein  30.13 
 
 
262 aa  57  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0193892  normal  0.140843 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1607  hypothetical protein  26.79 
 
 
219 aa  55.5  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.387519  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2753  hypothetical protein  28.4 
 
 
225 aa  55.1  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1915  hypothetical protein  29.38 
 
 
266 aa  54.3  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0512  conserved integral membrane protein  29.21 
 
 
236 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965465 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2415  hypothetical protein  27.71 
 
 
234 aa  54.7  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000066201  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1113  hypothetical protein  28.1 
 
 
228 aa  53.9  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0290  hypothetical protein  29.1 
 
 
218 aa  53.1  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0238  hypothetical protein  26.06 
 
 
230 aa  51.6  0.000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.911643 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2053  hypothetical protein  26.88 
 
 
214 aa  51.2  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00670  ATP synthase subunit 6/subunit A  25.15 
 
 
262 aa  51.2  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0239  hypothetical protein  21.74 
 
 
233 aa  50.8  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.661071 
 
 
-
 
NC_002936  DET0425  hypothetical protein  29.84 
 
 
219 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.325475  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0480  hypothetical protein  29.23 
 
 
244 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.758585  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04860  hypothetical protein  28.18 
 
 
231 aa  50.4  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.412432  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2677  hypothetical protein  30.28 
 
 
257 aa  50.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3003  hypothetical protein  27.84 
 
 
223 aa  50.1  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0401  hypothetical protein  29.03 
 
 
219 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.851057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>