35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_4199 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_4199  hypothetical protein  100 
 
 		 340 aa  708    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3861  hypothetical protein  75.62 
 
 		 319 aa  501  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0197504 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06218  hypothetical protein  25.68 
 
 		 326 aa  95.9  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0376  hypothetical protein  25.86 
 
 		 330 aa  94.4  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2234  AAA ATPase  25.1 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.389055  decreased coverage  0.000860852 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4686  TniB family protein  26.07 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.60041  normal  0.0211663 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2266  hypothetical protein  24.36 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0124  putative NTP-binding protein TniB  24.41 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6544  hypothetical protein  23.05 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2351  hypothetical protein  24.84 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363942 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0016  AAA ATPase  23.57 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2504  transposon transposition helper protein C, putative  26.99 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.059168  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4580  TniB  26.26 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0203  TniB family protein  23.68 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000461538 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0188  urease, alpha subunit  24.34 
 
 		 293 aa  53.1  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0057  transposition helper protein  24.56 
 
 		 296 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1174  transposition protein TniB  25.15 
 
 		 302 aa  52.8  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0157  transposition protein TniB  23.6 
 
 		 286 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4721  AAA ATPase  21.48 
 
 		 327 aa  50.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.895386  normal  0.068339 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4973  NTP-binding protein TniB  22.98 
 
 		 302 aa  49.7  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899984  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4044  NTP-binding protein TniB  22.98 
 
 		 302 aa  49.7  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160827  normal  0.440608 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3009  hypothetical protein  22.98 
 
 		 302 aa  49.7  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00246617 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2132  TniB family protein  29.93 
 
 		 203 aa  48.9  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.521965  normal  0.0287257 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3578  TniB family protein  26.92 
 
 		 308 aa  48.9  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06977  hypothetical protein  28.48 
 
 		 196 aa  48.5  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0017  hypothetical protein  23.39 
 
 		 335 aa  48.5  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1982  AAA ATPase  24.39 
 
 		 382 aa  47.8  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.135129 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1703  hypothetical protein  22.68 
 
 		 322 aa  46.6  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0247  AAA ATPase  20.54 
 
 		 562 aa  46.2  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.472515 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3259  TniB family protein  21.99 
 
 		 289 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.112641 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4904  TniB  21.99 
 
 		 289 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0029  transposition helper protein  34.38 
 
 		 311 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1658  ATP-binding protein  23.59 
 
 		 371 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1630  hypothetical protein  24.58 
 
 		 313 aa  43.9  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1646  TniB  24.4 
 
 		 300 aa  43.1  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>