163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_4189 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_4189  restriction modification system DNA specificity domain protein  100 
 
 		 401 aa  831    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1452  restriction modification system DNA specificity domain  34.42 
 
 		 392 aa  216  5e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0462219  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03610  type I site-specific deoxyribonuclease  34.2 
 
 		 360 aa  170  4e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1060  restriction modification system DNA specificity subunit  29.48 
 
 		 397 aa  156  7e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0844  restriction endonuclease S subunits-like protein  30.46 
 
 		 386 aa  152  7e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1526  restriction endonuclease S subunits-like  32.79 
 
 		 386 aa  140  4.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3569  restriction modification system DNA specificity domain  30.07 
 
 		 395 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185936  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2277  restriction modification system DNA specificity domain protein  33.67 
 
 		 433 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.200455  hitchhiker  0.00000677276 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0735  restriction modification system DNA specificity subunit  28.11 
 
 		 392 aa  133  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2893  restriction modification system DNA specificity domain protein  33.89 
 
 		 237 aa  130  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3382  restriction modification system DNA specificity subunit  36.32 
 
 		 485 aa  129  9.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0387  restriction modification system DNA specificity domain  34.34 
 
 		 435 aa  127  5e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0681662  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1805  restriction modification system DNA specificity domain protein  45.07 
 
 		 423 aa  126  8.000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.745604  normal  0.535567 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0804  restriction modification system DNA specificity subunit  29.64 
 
 		 368 aa  125  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.526121  normal  0.427419 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3515  restriction modification system DNA specificity domain  36.71 
 
 		 514 aa  123  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3180  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.2 
 
 		 390 aa  123  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0080  restriction modification system DNA specificity subunit  38.18 
 
 		 392 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1791  restriction modification system DNA specificity subunit  37.95 
 
 		 419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1087  restriction modification system DNA specificity subunit  31.96 
 
 		 437 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0762586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2852  restriction endonuclease S subunits-like protein  32.34 
 
 		 412 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0584008 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1093  restriction modification system DNA specificity subunit  28.4 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.614941  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0900  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.95 
 
 		 471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.963501 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1095  restriction modification system DNA specificity subunit  37.5 
 
 		 180 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0307222  normal  0.460019 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3109  restriction modification system DNA specificity subunit  31.03 
 
 		 426 aa  108  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2028  restriction modification system DNA specificity subunit  25.4 
 
 		 391 aa  107  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000400239 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4012  restriction modification system DNA specificity subunit  24.86 
 
 		 436 aa  105  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.848484  normal  0.567977 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2598  type I restriction-modification enzyme, S subunit  29.46 
 
 		 417 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0133376  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2097  restriction modification system DNA specificity subunit  25.32 
 
 		 393 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2875  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.73 
 
 		 390 aa  104  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2180  restriction modification system DNA specificity subunit  36.05 
 
 		 405 aa  102  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2421  restriction modification system DNA specificity subunit  23.53 
 
 		 402 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.318068 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0599  type I restriction-modification system, S subunit  35 
 
 		 458 aa  99.4  9e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3055  restriction modification system DNA specificity subunit  32 
 
 		 411 aa  96.3  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.363566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3199  restriction modification system DNA specificity subunit  25.89 
 
 		 400 aa  95.5  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0727  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.47 
 
 		 400 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0968972 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1037  restriction modification system DNA specificity domain  29.93 
 
 		 364 aa  95.1  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0890662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0515  type I restriction-modification system (specificity subunit)  27.13 
 
 		 263 aa  94.4  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1170  restriction modification system DNA specificity subunit  25.2 
 
 		 402 aa  93.6  6e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.249165  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3358  restriction modification system DNA specificity subunit  26.71 
 
 		 429 aa  92.4  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0521612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5859  putative type I restriction-modification system, S subunit  36.94 
 
 		 584 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3297  restriction modification system DNA specificity subunit  26.91 
 
 		 430 aa  91.3  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489204 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4714  restriction modification system DNA specificity domain  26.06 
 
 		 380 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.232226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3010  restriction endonuclease S subunits-like protein  24.22 
 
 		 388 aa  90.5  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.116402  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0501  restriction modification system DNA specificity subunit  35.88 
 
 		 612 aa  89.7  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.435558 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4139  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.38 
 
 		 238 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1398  restriction modification system DNA specificity subunit  28.57 
 
 		 557 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1027  restriction modification system DNA specificity subunit  23.29 
 
 		 420 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1502  restriction modification system DNA specificity domain  26.47 
 
 		 393 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1778  type I restriction-modification system specificity subunit  25.2 
 
 		 419 aa  84.7  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.926504  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6044  type I restriction-modification system subunit S  34.44 
 
 		 547 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.061065  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1674  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.76 
 
 		 477 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1131  restriction modification system DNA specificity subunit  23.62 
 
 		 413 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02074  HsdS polypeptide, part of CfrA family  41.9 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2409  restriction modification system DNA specificity subunit  27.83 
 
 		 442 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2726  restriction modification system DNA specificity subunit  25.55 
 
 		 500 aa  77  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2869  type I restriction-modification system, S subunit  30.49 
 
 		 448 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0947716  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3540  restriction modification system DNA specificity subunit  22.07 
 
 		 387 aa  74.3  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2226  restriction modification system DNA specificity subunit  25.09 
 
 		 451 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.890862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4810  putative type I restriction-modification system specificity subunit  22.74 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3227  restriction modification system DNA specificity subunit  29.52 
 
 		 575 aa  71.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1015  restriction modification system DNA specificity subunit  24.86 
 
 		 575 aa  70.9  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6260  restriction modification system DNA specificity domain protein  33.33 
 
 		 441 aa  70.1  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0086  restriction modification system DNA specificity protein  27.32 
 
 		 538 aa  67.8  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4240  Restriction endonuclease S subunits-like protein  22.96 
 
 		 436 aa  68.2  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2904  restriction modification system DNA specificity subunit  22.65 
 
 		 425 aa  66.6  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0390  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.77 
 
 		 642 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000219621 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0745  restriction modification system DNA specificity domain  21.61 
 
 		 411 aa  66.2  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.189202  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04450  restriction modification system DNA specificity domain protein  34.26 
 
 		 422 aa  63.9  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3649  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.81 
 
 		 464 aa  62  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0268  restriction endonuclease S subunits  20.48 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.277222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0287  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.47 
 
 		 429 aa  59.7  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1496  restriction modification system DNA specificity domain protein  32.17 
 
 		 427 aa  59.7  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.136919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0334  restriction modification system DNA specificity domain  25.6 
 
 		 430 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.284396 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1433  restriction modification system DNA specificity subunit  23.1 
 
 		 372 aa  59.3  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0076  type I restriction-modification system subunit S  21.99 
 
 		 464 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3246  hypothetical protein  32.03 
 
 		 454 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1360  restriction modification system DNA specificity subunit  26.29 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.502069 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0845  restriction modification system DNA specificity domain protein  20.4 
 
 		 495 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31571e-19 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1357  restriction modification system DNA specificity domain  23.64 
 
 		 425 aa  58.5  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0971497  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3793  restriction modification system DNA specificity subunit  23.43 
 
 		 425 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3989  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.53 
 
 		 456 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0737122 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0508  restriction modification system DNA specificity subunit  25.12 
 
 		 511 aa  57  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0854  restriction modification system DNA specificity subunit  26.24 
 
 		 595 aa  57  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221182  normal  0.0643125 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1144  restriction modification system DNA specificity subunit  21.43 
 
 		 473 aa  56.6  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1911  hypothetical protein  29.29 
 
 		 453 aa  56.2  0.0000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.568524  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1941  restriction endonuclease S subunits-like  19.81 
 
 		 451 aa  55.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0182546  normal  0.0682578 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2093  restriction modification system DNA specificity subunit  22.96 
 
 		 477 aa  55.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2391  restriction modification system DNA specificity subunit  22.19 
 
 		 374 aa  55.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164769  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0545  hypothetical protein  26.49 
 
 		 701 aa  54.7  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2665  type I restriction-modification system specificity subunit  21.52 
 
 		 446 aa  54.7  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0650221  normal  0.332066 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0198  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.7 
 
 		 386 aa  54.7  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.719886  decreased coverage  0.000218103 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2689  restriction modification system DNA specificity subunit  34 
 
 		 290 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.841682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0227  restriction modification system DNA specificity domain  21.73 
 
 		 395 aa  54.3  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3777  restriction endonuclease S subunits-like protein  20 
 
 		 419 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3850  restriction endonuclease S subunits-like protein  20 
 
 		 419 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0382  type I restriction-modification system, S subunit  22.09 
 
 		 439 aa  53.5  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2249  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.75 
 
 		 384 aa  53.5  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3443  restriction modification system DNA specificity domain protein  20.82 
 
 		 445 aa  53.5  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2214  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.03 
 
 		 457 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4778  restriction modification system DNA specificity subunit  22.55 
 
 		 415 aa  53.5  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16943  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>