34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_4187 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_4187  hypothetical protein  100 
 
 
410 aa  853    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3855  hypothetical protein  88.78 
 
 
410 aa  745    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0189615 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06211  hypothetical protein  23.7 
 
 
394 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5058  hypothetical protein  20.68 
 
 
363 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.863034  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0030  hypothetical protein  33.73 
 
 
628 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3049  hypothetical protein  30.83 
 
 
397 aa  62.4  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.356075 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3152  hypothetical protein  22.05 
 
 
313 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5216  hypothetical protein  22.05 
 
 
313 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.204329 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4392  hypothetical protein  34.12 
 
 
344 aa  57.4  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.537919  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06982  hypothetical protein  27.46 
 
 
183 aa  57.4  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0217  hypothetical protein  36.92 
 
 
433 aa  55.1  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.289698  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0018  hypothetical protein  26.35 
 
 
605 aa  55.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1592  hypothetical protein  38.24 
 
 
378 aa  54.3  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.350355  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0695  hypothetical protein  38.24 
 
 
378 aa  54.3  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.513596  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2128  hypothetical protein  31.65 
 
 
331 aa  53.1  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0161775 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2503  hypothetical protein  31.65 
 
 
342 aa  52.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0880  hypothetical protein  31.82 
 
 
568 aa  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.889726  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0123  hypothetical protein  35.05 
 
 
366 aa  51.2  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3186  hypothetical protein  35.23 
 
 
425 aa  50.4  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.174056  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4722  hypothetical protein  31.88 
 
 
694 aa  50.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224738  normal  0.0942649 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2233  hypothetical protein  38.46 
 
 
453 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100569  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6545  hypothetical protein  27.16 
 
 
322 aa  46.6  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.329804 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0018  hypothetical protein  28.89 
 
 
567 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4978  hypothetical protein  32.94 
 
 
357 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760749 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1645  hypothetical protein  27.1 
 
 
342 aa  46.2  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2605  hypothetical protein  23.68 
 
 
661 aa  45.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250599  normal  0.12756 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0189  hypothetical protein  36.67 
 
 
307 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1348  hypothetical protein  30.65 
 
 
472 aa  44.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1224  hypothetical protein  30.65 
 
 
472 aa  44.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2646  hypothetical protein  30.65 
 
 
497 aa  44.3  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.676397  normal  0.0791481 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2173  hypothetical protein  30.65 
 
 
497 aa  44.3  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0687306  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1578  hypothetical protein  27 
 
 
356 aa  44.3  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.223334  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2522  hypothetical protein  32.94 
 
 
357 aa  43.9  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716097  normal  0.197177 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0375  hypothetical protein  27.38 
 
 
488 aa  43.9  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>