216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_4166 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_4166  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 
156 aa  312  1e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4238  biopolymer transport protein ExbD/TolR  98.72 
 
 
156 aa  308  2e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4372  biopolymer transport protein ExbD/TolR  96.79 
 
 
156 aa  303  5e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0439  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.6 
 
 
132 aa  89  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.29268  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1847  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.21 
 
 
130 aa  85.5  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.730316  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0453  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.3 
 
 
134 aa  77.4  6e-14  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00775346  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2278  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.06 
 
 
141 aa  71.6  4e-12  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0502314  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1369  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.77 
 
 
133 aa  64.3  7e-10  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0438  biopolymer ExbD/TolR family transporter  33.87 
 
 
137 aa  63.9  8e-10  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.744335  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1063  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.1 
 
 
135 aa  62.8  2e-09  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0915  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.25 
 
 
140 aa  61.6  4e-09  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.574244  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2151  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.59 
 
 
140 aa  61.2  5e-09  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0691787  normal  0.335965 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2674  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
140 aa  61.2  5e-09  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4088  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.59 
 
 
140 aa  60.8  7e-09  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.091049  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03432  Biopolymer transport protein  27.05 
 
 
135 aa  60.1  1e-08  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1730  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.82 
 
 
132 aa  59.3  2e-08  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3973  biopolymer transport exbD protein  27.73 
 
 
136 aa  59.3  2e-08  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3753  biopolymer transport exbD protein  28.57 
 
 
133 aa  57.4  7e-08  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.677985  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3869  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.42 
 
 
136 aa  57.4  7e-08  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1852  biopolymer transport exbD protein  32.8 
 
 
136 aa  57  9e-08  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142679  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2277  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32 
 
 
139 aa  56.2  1e-07  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0227736  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00634  biopolymer transport protein  25.78 
 
 
135 aa  56.2  1e-07  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0455  biopolymer transport protein (ExbD2)  30.77 
 
 
134 aa  56.6  1e-07  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0057258  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1151  TonB system transport protein ExbD2  33.08 
 
 
134 aa  55.8  2e-07  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.717092  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0609  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.01 
 
 
136 aa  55.5  3e-07  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000633887  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1435  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.19 
 
 
137 aa  55.1  4e-07  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.559612  normal  0.665441 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3760  TonB system transport protein ExbD  33.9 
 
 
139 aa  53.9  8e-07  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0355  branched-chain amino acid aminotransferase I  29.31 
 
 
134 aa  53.9  8e-07  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00931363  normal  0.438435 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0646  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.14 
 
 
134 aa  53.5  1e-06  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419547  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1656  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.76 
 
 
142 aa  53.5  1e-06  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.310193  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3597  TonB system transport protein ExbD  34.75 
 
 
139 aa  53.1  1e-06  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0486  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  27.14 
 
 
134 aa  53.5  1e-06  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244667  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2155  biopolymer transport protein (ExbD2)  26.12 
 
 
136 aa  53.5  1e-06  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2129  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.04 
 
 
128 aa  53.5  1e-06  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.027285  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0560  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.02 
 
 
137 aa  52.8  2e-06  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.326497 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2891  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.87 
 
 
135 aa  52.8  2e-06  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140985 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.97 
 
 
140 aa  52.8  2e-06  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.364458  normal  0.851984 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5124  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.5 
 
 
141 aa  52.4  2e-06  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2817  biopolymer transport protein (ExbD2)  31.03 
 
 
135 aa  52.8  2e-06  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276974  hitchhiker  1.82227e-06 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0592  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.03 
 
 
141 aa  52.8  2e-06  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.127488 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0575  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.06 
 
 
143 aa  52.4  3e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523101  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0671  ExbD/TolR family protein  32.23 
 
 
156 aa  51.6  4e-06  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045773  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0114  TonB system transport protein ExbD2  26.92 
 
 
134 aa  51.6  4e-06  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.23 
 
 
156 aa  51.6  4e-06  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0663066  normal  0.292388 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0273  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.41 
 
 
136 aa  51.6  4e-06  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1370  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.75 
 
 
140 aa  51.6  4e-06  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3381  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.82 
 
 
143 aa  51.2  5e-06  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  1.13024e-06 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5556  biopolymer transport protein ExbD  34.17 
 
 
142 aa  51.2  5e-06  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2155  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.2 
 
 
134 aa  51.2  5e-06  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1522  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.03 
 
 
122 aa  51.2  5e-06  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0346  biopolymer transport protein ExbD  32.2 
 
 
141 aa  51.2  6e-06  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0902  TonB system transport protein ExbD3  27.91 
 
 
134 aa  50.8  7e-06  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000845  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.58 
 
 
134 aa  50.8  7e-06  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0874  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.16 
 
 
135 aa  50.4  9e-06  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3522  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.74 
 
 
133 aa  50.1  1e-05  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1012  TonB system transport protein  30.16 
 
 
135 aa  49.7  1e-05  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0389  biopolymer transport protein ExbD  33.05 
 
 
141 aa  50.1  1e-05  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.627769  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1827  TonB system transport protein ExbD2  26.23 
 
 
134 aa  50.1  1e-05  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2484  putative TonB system transport protein ExbD2  28.93 
 
 
137 aa  49.3  2e-05  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  7.78685e-11  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3309  TonB system transport protein ExbD  33.33 
 
 
141 aa  49.3  2e-05  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537817  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1618  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.09 
 
 
136 aa  49.3  2e-05  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272583  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0573  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.95 
 
 
139 aa  49.7  2e-05  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.234389  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2977  TolR protein  30.83 
 
 
144 aa  49.7  2e-05  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1486  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  28.81 
 
 
131 aa  49.3  2e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1613  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.29 
 
 
142 aa  49.7  2e-05  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.921592  normal  0.194939 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1201  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.81 
 
 
131 aa  49.3  2e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102813 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4176  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30 
 
 
142 aa  48.9  2e-05  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0268987  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0546  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.2 
 
 
152 aa  48.5  3e-05  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00922706  normal  0.113975 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1742  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.61 
 
 
141 aa  48.9  3e-05  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0350  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.29 
 
 
130 aa  48.9  3e-05  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.902002  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1656  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.78 
 
 
151 aa  48.5  3e-05  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.05 
 
 
134 aa  48.9  3e-05  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00138445  hitchhiker  1.06541e-06 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2024  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.82 
 
 
155 aa  48.5  3e-05  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.34025 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2531  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.05 
 
 
134 aa  48.9  3e-05  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.103764  unclonable  2.46582e-05 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2461  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.05 
 
 
134 aa  48.9  3e-05  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.086318  hitchhiker  4.63213e-07 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0600  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.07 
 
 
135 aa  48.9  3e-05  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1520  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.05 
 
 
134 aa  48.9  3e-05  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0204  biopolymer transport protein ExbD  31.36 
 
 
141 aa  48.5  3e-05  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2454  biopolymer ExbD/TolR family transporter  31.25 
 
 
176 aa  48.1  4e-05  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1230  biopolymer ExbD/TolR family transporter  31.25 
 
 
176 aa  48.1  4e-05  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0371  biopolymer ExbD/TolR family transporter  31.25 
 
 
176 aa  48.1  4e-05  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2641  biopolymer ExbD/TolR family transporter  31.25 
 
 
176 aa  48.1  4e-05  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2987  biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.83 
 
 
133 aa  48.1  4e-05  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.369399  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0150  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.5 
 
 
149 aa  48.5  4e-05  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000194485  hitchhiker  0.00605756 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06757  hypothetical protein  25.21 
 
 
134 aa  48.1  5e-05  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0185  ferric siderophore transport system,innermembrane protein E  33.06 
 
 
131 aa  47.8  5e-05  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.224438  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1981  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.75 
 
 
157 aa  47.8  5e-05  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0594702  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0068  TonB system transport protein ExbD  31.36 
 
 
141 aa  48.1  5e-05  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2066  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.93 
 
 
135 aa  47.8  6e-05  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3453  biopolymer ExbD/TolR family transporter  31.25 
 
 
176 aa  47.8  6e-05  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.83 
 
 
134 aa  47.4  7e-05  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00147196  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1210  biopolymer ExbD/TolR family transporter  29.41 
 
 
178 aa  47.4  8e-05  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2300  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  27.5 
 
 
124 aa  47.4  9e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.562465  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1247  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.59 
 
 
140 aa  47  9e-05  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1943  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.5 
 
 
129 aa  47  9e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0506  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30 
 
 
148 aa  47.4  9e-05  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.492419 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0506  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.73 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529067  hitchhiker  0.000695312 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1736  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.06 
 
 
139 aa  47  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109286  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1628  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.23 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0400  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.69 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.376121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>