127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_4108 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_4601  tryptophan-specific transport protein  92.75 
 
 
414 aa  771    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4108  aromatic amino acid transporter  100 
 
 
418 aa  827    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3513  aromatic amino acid transport protein  81.53 
 
 
417 aa  686    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3787  aromatic amino acid transporter  94.02 
 
 
418 aa  788    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3860  aromatic amino acid transporter  93.78 
 
 
418 aa  786    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0262  aromatic amino acid transporter  82.06 
 
 
418 aa  683    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3987  aromatic amino acid transporter  93.54 
 
 
418 aa  785    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0158  aromatic amino acid transporter  99.28 
 
 
418 aa  822    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3531  aromatic amino acid transporter  79.62 
 
 
418 aa  659    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3778  aromatic amino acid transporter  93.54 
 
 
418 aa  788    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4176  aromatic amino acid transporter  99.52 
 
 
418 aa  825    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0202  aromatic amino acid transporter  80.34 
 
 
418 aa  663    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3995  aromatic amino acid transporter  79.62 
 
 
418 aa  656    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4307  aromatic amino acid transporter  99.76 
 
 
418 aa  827    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0182  aromatic amino acid transporter  80.1 
 
 
418 aa  677    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3479  aromatic amino acid transport protein  78.47 
 
 
418 aa  633  1e-180  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71710  tryptophan permease  60.34 
 
 
417 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.268423  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6222  tryptophan permease  61.43 
 
 
467 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1031  aromatic amino acid transporter  55.5 
 
 
425 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3466  tryptophan permease  58.91 
 
 
414 aa  445  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3466  tryptophan permease  58.66 
 
 
414 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3598  tryptophan permease  59.43 
 
 
414 aa  443  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0157208 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4480  tryptophan permease  58.66 
 
 
414 aa  443  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3457  tryptophan permease  58.66 
 
 
414 aa  442  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.813995 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03028  tryptophan transporter of high affinity  58.4 
 
 
414 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0544  aromatic amino acid transporter  58.66 
 
 
414 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02979  hypothetical protein  58.4 
 
 
414 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3353  tryptophan permease  58.4 
 
 
414 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3643  tryptophan permease  58.4 
 
 
414 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2776  aromatic amino acid transporter  53.85 
 
 
414 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0537  tryptophan permease  58.4 
 
 
414 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0411186 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3611  tryptophan permease  58.4 
 
 
414 aa  440  9.999999999999999e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3535  tryptophan permease  58.4 
 
 
414 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3572  tryptophan permease  58.4 
 
 
414 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3634  tryptophan permease  58.14 
 
 
414 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2697  tryptophan-specific transport protein  53.61 
 
 
414 aa  435  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0991  tryptophan permease  55.06 
 
 
424 aa  431  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3236  aromatic amino acid transporter  53.9 
 
 
414 aa  434  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000036044 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1511  tryptophan-specific transport protein  53.61 
 
 
412 aa  432  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0755  tryptophan permease  55.16 
 
 
424 aa  431  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1562  tryptophan-specific transport protein  51.83 
 
 
416 aa  403  1e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000304843  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0097  aromatic amino acid transporter  50.71 
 
 
419 aa  402  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.103921  normal  0.507347 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03593  tryptophan transporter of low affinity  46.49 
 
 
415 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03537  hypothetical protein  46.49 
 
 
415 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3923  tryptophan permease TnaB  46.49 
 
 
415 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4218  tryptophan permease TnaB  46.49 
 
 
415 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4258  aromatic amino acid transporter  46.39 
 
 
415 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5140  tryptophan permease TnaB  46.63 
 
 
415 aa  356  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.406172 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4285  tryptophan permease TnaB  46 
 
 
415 aa  356  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4213  tryptophan permease TnaB  46.39 
 
 
413 aa  351  1e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1135  aromatic amino acid transporter  46.27 
 
 
409 aa  351  2e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.55679  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0800  tryptophan permease  44.94 
 
 
409 aa  311  1e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.121788  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1118  tryptophan-specific transport protein  43.81 
 
 
411 aa  294  2e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1034  tyrosine-specific transport protein  37.5 
 
 
403 aa  252  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311327  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1736  aromatic amino acid transporter  37.5 
 
 
403 aa  249  4e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000018039  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1276  tyrosine-specific transport protein  37.5 
 
 
403 aa  249  4e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00001928  hitchhiker  0.0000367731 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01875  tyrosine transporter  37.5 
 
 
403 aa  249  7e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0104717  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01864  hypothetical protein  37.5 
 
 
403 aa  249  7e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00693993  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2005  tyrosine-specific transport protein  37.5 
 
 
403 aa  249  7e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000529329  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2140  tyrosine-specific transport protein  37.5 
 
 
403 aa  249  7e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000592969  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1729  aromatic amino acid transporter  37.5 
 
 
403 aa  249  7e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000563721  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2647  tyrosine-specific transport protein  37.5 
 
 
403 aa  249  8e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.588852  hitchhiker  0.0000000318595 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2092  tyrosine-specific transport protein  37.92 
 
 
422 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0842051  hitchhiker  0.0000739999 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1184  tyrosine-specific transport protein  37.4 
 
 
422 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.135204  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1118  aromatic amino acid transporter  37.81 
 
 
402 aa  242  7e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1307  tyrosine-specific transport protein  37.66 
 
 
422 aa  242  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000107929 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2099  tyrosine-specific transport protein  37.66 
 
 
422 aa  242  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  1.23753e-19 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2152  tyrosine-specific transport protein  37.66 
 
 
422 aa  242  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000242218 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0526  aromatic amino acid transporter  34.34 
 
 
400 aa  236  6e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.560578  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2774  tyrosine-specific transport protein  37.78 
 
 
402 aa  236  7e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1318  tyrosine-specific transport protein  37.78 
 
 
402 aa  236  7e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2853  aromatic amino acid transporter  37.78 
 
 
402 aa  236  7e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3197  aromatic amino acid transporter  37.59 
 
 
402 aa  236  8e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2426  aromatic amino acid transporter  34.84 
 
 
395 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.392601  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1925  aromatic amino acid transporter  34.84 
 
 
395 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00166231  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2433  aromatic amino acid transporter  34.59 
 
 
395 aa  229  7e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.485869  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2544  aromatic amino acid transporter  34.59 
 
 
395 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.487399  decreased coverage  0.00912111 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2186  aromatic amino acid transporter  34.34 
 
 
395 aa  228  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.338137  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1846  aromatic amino acid transporter  35.28 
 
 
395 aa  227  3e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.510263 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2185  aromatic amino acid transporter  35.28 
 
 
395 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135373  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3276  aromatic amino acid transporter  37.59 
 
 
402 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1792  aromatic amino acid transporter  35.03 
 
 
395 aa  224  3e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2065  tyrosine-specific transport protein  34.77 
 
 
395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4434  aromatic amino acid transporter  35.59 
 
 
400 aa  220  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2489  aromatic amino acid transporter  36.3 
 
 
425 aa  218  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0511  putative tyrosine-specific transport protein  33.73 
 
 
400 aa  217  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0712  tyrosine-specific transport protein  34.9 
 
 
400 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3298  tyrosine-specific transport protein  36.29 
 
 
388 aa  208  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3188  aromatic amino acid permease  33.08 
 
 
395 aa  206  5e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497864  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0574  aromatic amino acid permease  33.95 
 
 
400 aa  203  5e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0641  aromatic amino acid permease  33.61 
 
 
399 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003573  tyrosine-specific transport protein  31.97 
 
 
380 aa  199  9e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3878  aromatic amino acid permease  32.57 
 
 
391 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00957771  hitchhiker  0.00000285867 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0780  tyrosine-specific transport protein  33.75 
 
 
403 aa  196  8.000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000892482  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3938  aromatic amino acid permease  32.66 
 
 
392 aa  193  5e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176846  normal  0.472237 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0916  aromatic amino acid permease  34.93 
 
 
395 aa  189  7e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3465  aromatic amino acid permease  32.64 
 
 
391 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.230898  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1774  tyrosine-specific transport protein (tyrosine permease)  31.89 
 
 
390 aa  189  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02530  hypothetical protein  32.53 
 
 
361 aa  188  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3588  aromatic amino acid permease  32.38 
 
 
391 aa  186  7e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.281237  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>