More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3949 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3949  isocitrate lyase family protein  100 
 
 		 284 aa  586  1e-166  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4025  isocitrate lyase family protein  99.3 
 
 		 284 aa  580  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4144  isocitrate lyase family protein  99.65 
 
 		 284 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4051  isocitrate lyase family protein  98.59 
 
 		 287 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1054  isocitrate lyase family protein  61.92 
 
 		 282 aa  359  3e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138813  normal  0.876203 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2154  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  41.13 
 
 		 289 aa  250  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.908949 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5990  2,3-dimethylmalate lyase  44.12 
 
 		 292 aa  247  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0792782 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1933  isocitrate lyase family protein  45.22 
 
 		 299 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1130  2,3-dimethylmalate lyase  42.86 
 
 		 287 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1702  methylisocitrate lyase  41.45 
 
 		 304 aa  240  2e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0394396 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0781  methylisocitrate lyase  40.36 
 
 		 311 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0806  isocitrate lyase family protein  43.38 
 
 		 287 aa  234  8e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0689  methylisocitrate lyase  45.85 
 
 		 292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3767  2,3-dimethylmalate lyase  44.87 
 
 		 289 aa  234  1.0000000000000001e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0624  2,3-dimethylmalate lyase  40.36 
 
 		 306 aa  233  3e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0101  methylisocitrate lyase  41.79 
 
 		 308 aa  229  5e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.248963  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1916  isocitrate lyase family protein  41.97 
 
 		 287 aa  226  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0326533 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0279  2,3-dimethylmalate lyase  41.18 
 
 		 274 aa  226  4e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.577564  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7954  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  38.6 
 
 		 288 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0396  methylisocitrate lyase  40.86 
 
 		 285 aa  223  3e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0696555  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4291  2,3-dimethylmalate lyase  39.25 
 
 		 295 aa  222  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.268229 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0783  methylisocitrate lyase  40.73 
 
 		 312 aa  222  4.9999999999999996e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.649003 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3629  2-methylisocitrate lyase  40.88 
 
 		 292 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0108  methylisocitrate lyase  40.14 
 
 		 302 aa  221  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0279515  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0345  2-methylisocitrate lyase  40.51 
 
 		 292 aa  219  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3825  2-methylisocitrate lyase  40.51 
 
 		 292 aa  220  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0315  2-methylisocitrate lyase  40.51 
 
 		 292 aa  220  3e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1657  2,3-dimethylmalate lyase  41.13 
 
 		 306 aa  218  7.999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.106264  normal  0.68628 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4474  2,3-dimethylmalate lyase  38.16 
 
 		 294 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.787404  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4841  2,3-dimethylmalate lyase  41.64 
 
 		 284 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4047  2-methylisocitrate lyase  39.78 
 
 		 292 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3945  2-methylisocitrate lyase  39.78 
 
 		 292 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0461  2,3-dimethylmalate lyase  39.35 
 
 		 301 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1203  2,3-dimethylmalate lyase  39.18 
 
 		 293 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00337991  normal  0.996052 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4021  2-methylisocitrate lyase  39.78 
 
 		 292 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4140  2-methylisocitrate lyase  39.78 
 
 		 292 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5405  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  39.18 
 
 		 293 aa  216  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00321329  normal  0.260192 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3644  2-methylisocitrate lyase  39.78 
 
 		 292 aa  216  4e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5166  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  37.59 
 
 		 292 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.919323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0800  methylisocitrate lyase  40.84 
 
 		 307 aa  213  3.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0629223  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2479  methylisocitrate lyase  40 
 
 		 304 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0974909  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2378  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  38.99 
 
 		 302 aa  211  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.628231  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2158  methylisocitrate lyase  38.99 
 
 		 302 aa  211  9e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081733  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1614  2,3-dimethylmalate lyase  38.19 
 
 		 295 aa  211  9e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.863287  normal  0.36405 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1820  2-methylisocitrate lyase  39.57 
 
 		 292 aa  211  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3294  2-methylisocitrate lyase  40.77 
 
 		 294 aa  210  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.203078 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14150  methylisocitrate lyase  38.95 
 
 		 312 aa  209  3e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4757  2,3-dimethylmalate lyase  38.52 
 
 		 287 aa  209  4e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000491467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1726  methylisocitrate lyase  39.64 
 
 		 302 aa  209  4e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1524  methylisocitrate lyase  39.01 
 
 		 301 aa  209  5e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000427671 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2452  methylisocitrate lyase  38.63 
 
 		 302 aa  209  5e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.344607  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3008  methylisocitrate lyase  38.63 
 
 		 302 aa  209  5e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.62358 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0256  putative methylisocitrate lyase  36.92 
 
 		 288 aa  208  6e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.764901 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2127  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  38.63 
 
 		 302 aa  208  6e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2113  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  38.63 
 
 		 302 aa  208  6e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2369  methylisocitrate lyase  38.63 
 
 		 302 aa  208  6e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2317  methylisocitrate lyase  38.63 
 
 		 302 aa  209  6e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3496  methylisocitrate lyase  38.57 
 
 		 314 aa  208  9e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.146967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12030  methylisocitrate lyase  38.21 
 
 		 312 aa  208  9e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.55917  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2190  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  38.63 
 
 		 302 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2350  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  38.63 
 
 		 302 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3861  2-methylisocitrate lyase  41.15 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3975  2-methylisocitrate lyase  41.15 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.583072 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2822  2-methylisocitrate lyase  39.5 
 
 		 296 aa  206  5e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1419  2-methylisocitrate lyase  38.85 
 
 		 292 aa  205  7e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0661  2,3-dimethylmalate lyase  36.75 
 
 		 310 aa  204  9e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.428755 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0864  2,3-dimethylmalate lyase  38.71 
 
 		 289 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000979692  hitchhiker  0.000000949403 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2499  2-methylisocitrate lyase  38.3 
 
 		 292 aa  204  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.741837  normal  0.047618 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03370  2-methylisocitrate lyase  41.56 
 
 		 291 aa  204  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2111  2-methylisocitrate lyase  39.54 
 
 		 292 aa  204  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.12913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2322  2-methylisocitrate lyase  39.16 
 
 		 292 aa  204  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2605  2-methylisocitrate lyase  41.73 
 
 		 293 aa  202  4e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221019  hitchhiker  0.000512853 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0204  2,3-dimethylmalate lyase  38.55 
 
 		 325 aa  202  5e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1632  2,3-dimethylmalate lyase  36.94 
 
 		 286 aa  202  6e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.171622 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2082  2,3-dimethylmalate lyase  36.94 
 
 		 286 aa  202  7e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218009  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0397  2-methylisocitrate lyase  39.78 
 
 		 296 aa  202  7e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0568  methylisocitrate lyase  39.5 
 
 		 298 aa  201  8e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1664  2-methylisocitrate lyase  39.54 
 
 		 292 aa  201  8e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2513  2,3-dimethylmalate lyase  36.62 
 
 		 293 aa  201  8e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0356  2-methylisocitrate lyase  39.42 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00286  2-methylisocitrate lyase  39.42 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0509  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  39.92 
 
 		 289 aa  201  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0363  2-methylisocitrate lyase  40.54 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00290  hypothetical protein  39.42 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3293  2-methylisocitrate lyase  39.78 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1857  2-methylisocitrate lyase  39.16 
 
 		 292 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1524  2,3-dimethylmalate lyase  37.94 
 
 		 301 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0403  2-methylisocitrate lyase  39.42 
 
 		 296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3275  methylisocitrate lyase  39.42 
 
 		 296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0925  2-methylisocitrate lyase  39.62 
 
 		 292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4268  2,3-dimethylmalate lyase  37.81 
 
 		 291 aa  199  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.485286  normal  0.877406 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0952  2-methylisocitrate lyase  39.1 
 
 		 298 aa  200  3e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2775  2,3-dimethylmalate lyase  38.63 
 
 		 287 aa  198  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0071  2-methylisocitrate lyase  40.84 
 
 		 296 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0122  2-methylisocitrate lyase  39.05 
 
 		 298 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.528863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0865  2-methylisocitrate lyase  39.92 
 
 		 299 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.698029  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2080  2-methylisocitrate lyase  40.29 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.734153  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1177  2-methylisocitrate lyase  41.31 
 
 		 290 aa  196  3e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.984478  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0819  2-methylisocitrate lyase  41.31 
 
 		 290 aa  196  3e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.445655  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2400  2-methylisocitrate lyase  40.31 
 
 		 311 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.951557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>