39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3740 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3740  ABC-3 protein  100 
 
 		 266 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3923  ABC-3 protein  98.87 
 
 		 266 aa  510  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00893533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3797  ABC-3 protein  98.87 
 
 		 266 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.48799  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0528  ABC-3 protein  98.5 
 
 		 266 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000497802  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3309  ABC-3 protein  86.74 
 
 		 262 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.224275  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0567  ABC-3 protein  90.87 
 
 		 255 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3462  ABC-3 protein  90.87 
 
 		 259 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0568  ABC-3 protein  90.87 
 
 		 255 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0566  ABC 3 transport family protein  90.08 
 
 		 259 aa  441  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3515  ABC-3 protein  78.66 
 
 		 261 aa  391  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4332  ABC-3 protein  73.58 
 
 		 265 aa  382  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.364125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0618  ABC-3 protein  78.21 
 
 		 286 aa  384  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.087201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3140  ABC 3 transport family protein  78.8 
 
 		 251 aa  369  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0449  ABC-3 protein  81.63 
 
 		 263 aa  367  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.856508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0529  hypothetical protein  75.1 
 
 		 263 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00670346  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3714  ABC-3 protein  78.23 
 
 		 263 aa  347  1e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0390511  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000604  zinc ABC transporter permease protein ZnuB  40.65 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000103291  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06464  hypothetical protein  41.15 
 
 		 264 aa  171  7.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2539  zinc/manganese transport system permease protein  50.66 
 
 		 256 aa  144  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.421777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1547  ABC-3 protein  34 
 
 		 249 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000363711  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0050  putative manganese transport system permease protein  35.27 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2782  ABC-3 protein  35.29 
 
 		 466 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2421  ABC Mn2+/Zn2+ transporter,inner membrane subunit  30.29 
 
 		 276 aa  53.1  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1444  hypothetical protein  32 
 
 		 239 aa  48.9  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00097924  normal  0.0494808 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0177  cation ABC transporter, permease protein  29.03 
 
 		 267 aa  47.8  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0220  zinc ABC transporter, permease protein  41.03 
 
 		 125 aa  47  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  29.69 
 
 		 274 aa  46.2  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  30.71 
 
 		 272 aa  45.8  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  28.91 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0153  cation ABC transporter, permease protein  27.42 
 
 		 267 aa  44.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  26.64 
 
 		 272 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  26.64 
 
 		 272 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  31.25 
 
 		 272 aa  43.5  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2716  ABC-3 protein  39.73 
 
 		 271 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1913  ABC-3 protein  27.23 
 
 		 280 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1710  ABC-3 protein  30.61 
 
 		 273 aa  43.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.793327  normal  0.78687 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0136  cation ABC transporter, permease protein  27.84 
 
 		 267 aa  42.7  0.006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.032132  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  38.89 
 
 		 277 aa  42.7  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2382  ABC-3 protein  38.36 
 
 		 271 aa  42.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.502952  normal  0.42152 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>