239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3635 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3817  extracellular solute-binding protein  99.1 
 
 		 335 aa  694    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.890047 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0744  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  90.15 
 
 		 335 aa  642    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3347  extracellular solute-binding protein  92.54 
 
 		 335 aa  653    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0606  extracellular solute-binding protein  91.94 
 
 		 335 aa  649    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3693  extracellular solute-binding protein  99.1 
 
 		 335 aa  692    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0002551  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3517  extracellular solute-binding protein  92.54 
 
 		 335 aa  652    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3635  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 335 aa  699    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.84257 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3227  extracellular solute-binding protein  89.55 
 
 		 335 aa  629  1e-179  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0636  extracellular solute-binding protein  74.33 
 
 		 335 aa  531  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.632135  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0996  extracellular solute-binding protein  73.13 
 
 		 335 aa  524  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000369263 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0666  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  74.03 
 
 		 335 aa  518  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0053906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0861  extracellular solute-binding protein  72.24 
 
 		 335 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0945  extracellular solute-binding protein  70.45 
 
 		 335 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.248074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0844  extracellular solute-binding protein  69.85 
 
 		 335 aa  509  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.680673  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3007  ABC iron(III) transporter periplasmic binding protein  61.49 
 
 		 339 aa  454  1e-127  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.050744  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2588  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  64.69 
 
 		 337 aa  452  1.0000000000000001e-126  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0601  extracellular solute-binding protein  97.67 
 
 		 215 aa  441  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0137  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  61.42 
 
 		 352 aa  440  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000186976  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03435  hypothetical protein  58.46 
 
 		 337 aa  433  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002574  ferric iron ABC transporter iron-binding protein  57.86 
 
 		 337 aa  426  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000722094  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1012  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  58.68 
 
 		 335 aa  417  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.676586  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0783  periplasmic iron-binding protein  58.64 
 
 		 338 aa  408  1e-113  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.27536  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1092  extracellular solute-binding protein  59.75 
 
 		 337 aa  404  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000221625  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0170  extracellular solute-binding protein  53.12 
 
 		 349 aa  376  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0769  extracellular solute-binding protein  52.41 
 
 		 347 aa  370  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.302389  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0327  extracellular solute-binding protein  52.38 
 
 		 346 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0824216 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2913  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic substrate-binding protein  52.08 
 
 		 336 aa  349  4e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1557  extracellular solute-binding protein  51.76 
 
 		 336 aa  347  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.456805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1108  extracellular solute-binding protein  49.84 
 
 		 336 aa  342  4e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122481  normal  0.048242 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4631  extracellular solute-binding protein family 1  48.58 
 
 		 336 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.464324  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3947  extracellular solute-binding protein  48.59 
 
 		 338 aa  332  6e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000383863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6369  extracellular solute-binding protein family 1  48.36 
 
 		 345 aa  326  3e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.290821  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1439  extracellular solute-binding protein  47.32 
 
 		 337 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1463  extracellular solute-binding protein  47.95 
 
 		 338 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5861  extracellular solute-binding protein  47.55 
 
 		 345 aa  320  3e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0700  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  46.85 
 
 		 338 aa  312  3.9999999999999997e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0655  putative iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  46.85 
 
 		 380 aa  311  9e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0688  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  47.17 
 
 		 351 aa  309  4e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.163198  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0464  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  47.17 
 
 		 351 aa  309  4e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224989  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2093  extracellular solute-binding protein  46.42 
 
 		 347 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3764  extracellular solute-binding protein  46.42 
 
 		 362 aa  308  6.999999999999999e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1777  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein, putative  47.17 
 
 		 351 aa  308  9e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.476301  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1511  ABC transporter, substrate binding protein  47.17 
 
 		 351 aa  308  9e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1382  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  47.17 
 
 		 351 aa  308  9e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.560702  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1378  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  47.17 
 
 		 351 aa  308  9e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215691  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1182  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  47.17 
 
 		 351 aa  308  9e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1346  extracellular solute-binding protein family 1  45.4 
 
 		 349 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0473337  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3699  extracellular solute-binding protein family 1  46.44 
 
 		 354 aa  306  3e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2856  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein, putative  46.54 
 
 		 347 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.143151  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2989  extracellular solute-binding protein family 1  46.88 
 
 		 348 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4447  extracellular solute-binding protein  47.45 
 
 		 337 aa  305  6e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.181234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1093  extracellular solute-binding protein  46.23 
 
 		 347 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0730  extracellular solute-binding protein  45.91 
 
 		 347 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1210  extracellular solute-binding protein  45.91 
 
 		 347 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13233  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4318  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  45.6 
 
 		 347 aa  300  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434511  normal  0.628753 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1183  extracellular solute-binding protein  45.79 
 
 		 347 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0923795  normal  0.478437 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3824  extracellular solute-binding protein  45.76 
 
 		 338 aa  300  2e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1093  extracellular solute-binding protein  45.91 
 
 		 347 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.762259  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6288  extracellular solute-binding protein  42.69 
 
 		 341 aa  298  1e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0570  extracellular solute-binding protein  45.22 
 
 		 341 aa  296  5e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0579  extracellular solute-binding protein family 1  45.54 
 
 		 341 aa  295  7e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0543  extracellular solute-binding protein family 1  42.18 
 
 		 341 aa  288  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0299  extracellular solute-binding protein family 1  45.03 
 
 		 345 aa  285  5.999999999999999e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0978527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1529  extracellular solute-binding protein  46.95 
 
 		 355 aa  281  8.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014925  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0455  extracellular solute-binding protein  43.99 
 
 		 345 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2574  extracellular solute-binding protein  41.4 
 
 		 339 aa  265  8e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232421 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1596  extracellular solute-binding protein  40.55 
 
 		 351 aa  261  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.924744  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0549  extracellular solute-binding protein  40.58 
 
 		 341 aa  249  4e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429047  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0812  extracellular solute-binding protein  99.16 
 
 		 136 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0732  extracellular solute-binding protein  39.1 
 
 		 337 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.23005  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3844  extracellular solute-binding protein  40.12 
 
 		 347 aa  245  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1188  extracellular solute-binding protein  38.39 
 
 		 335 aa  244  9.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1547  ABC iron transporter, periplasmic binding protein  39.06 
 
 		 374 aa  240  2e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231784  normal  0.33336 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2758  extracellular solute-binding protein  39.71 
 
 		 347 aa  240  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181201  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1728  extracellular solute-binding protein  38.75 
 
 		 374 aa  240  2.9999999999999997e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.224389  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2587  extracellular solute-binding protein family 1  39.71 
 
 		 337 aa  239  4e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1200  extracellular solute-binding protein  39.82 
 
 		 337 aa  238  9e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1526  ABC transporter, periplasmic binding protein  41.46 
 
 		 334 aa  238  1e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0990  ABC transporter, iron binding protein  39.75 
 
 		 349 aa  237  2e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.599077 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2866  extracellular solute-binding protein  40.06 
 
 		 351 aa  237  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1371  putative iron binding protein component of ABC iron transporter  43.65 
 
 		 347 aa  236  3e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5021  extracellular solute-binding protein  36.96 
 
 		 333 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3754  extracellular solute-binding protein  39.37 
 
 		 355 aa  236  6e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1443  extracellular solute-binding protein family 1  39.03 
 
 		 365 aa  235  9e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3092  extracellular solute-binding protein  39.88 
 
 		 352 aa  235  9e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00849212  normal  0.375383 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1469  extracellular solute-binding protein family 1  39.03 
 
 		 365 aa  235  9e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1181  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  39.88 
 
 		 347 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0582814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1056  extracellular solute-binding protein  40.76 
 
 		 337 aa  233  3e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.835874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68900  putative binding protein component of ABC iron transporter  38.24 
 
 		 332 aa  233  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.940616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0179  extracellular solute-binding protein  42.41 
 
 		 341 aa  233  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405977  normal  0.1363 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  37.72 
 
 		 349 aa  232  7.000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5196  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  36.34 
 
 		 333 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5962  putative iron ABC transporter binding protein subunit  37.62 
 
 		 332 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.22448  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0897  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  38.65 
 
 		 341 aa  230  3e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5256  extracellular solute-binding protein  36.34 
 
 		 333 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5103  extracellular solute-binding protein  36.02 
 
 		 333 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0189  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  40.63 
 
 		 334 aa  229  4e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1409  iron transport system substrate-binding protein  38.02 
 
 		 340 aa  229  5e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47300  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  37.34 
 
 		 334 aa  229  6e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0189  putative iron-binding protein  38.84 
 
 		 346 aa  227  2e-58  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.120226  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>