More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3421 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.35 
 
 
893 aa  760    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.56 
 
 
688 aa  656    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.9 
 
 
886 aa  705    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00220  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.02 
 
 
906 aa  642    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0797991 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0988  formate dehydrogenase, alpha subunit  83.48 
 
 
1428 aa  2494    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.67 
 
 
900 aa  712    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.19 
 
 
901 aa  742    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  46.97 
 
 
695 aa  642    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0871  formate dehydrogenase, alpha subunit  97.82 
 
 
1425 aa  2883    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.510403  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.5 
 
 
893 aa  746    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.68 
 
 
900 aa  709    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3051  formate dehydrogenase, alpha subunit  86.41 
 
 
1424 aa  2550    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.99 
 
 
688 aa  659    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  48.48 
 
 
899 aa  763    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.68 
 
 
898 aa  687    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  48.36 
 
 
689 aa  667    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  67.23 
 
 
1410 aa  1994    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25280  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.26 
 
 
911 aa  639    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0556633 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.14 
 
 
688 aa  655    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  66.76 
 
 
1440 aa  2007    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.21 
 
 
893 aa  713    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  69.15 
 
 
1440 aa  2066    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  48.42 
 
 
687 aa  659    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0398  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  59.38 
 
 
1385 aa  1694    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.07 
 
 
687 aa  652    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3421  formate dehydrogenase, alpha subunit  100 
 
 
1425 aa  2962    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0825  formate dehydrogenase, alpha subunit  83.95 
 
 
1432 aa  2496    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00541451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3198  formate dehydrogenase, alpha subunit  84.09 
 
 
1432 aa  2505    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.554904 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  68.45 
 
 
1406 aa  2029    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.65 
 
 
917 aa  763    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001399  formate dehydrogenase-O major subunit  58.99 
 
 
1387 aa  1643    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.06 
 
 
879 aa  739    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06362  oxidoreductase  58.79 
 
 
1412 aa  1683    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0937  formate dehydrogenase, alpha subunit  67.27 
 
 
1426 aa  1957    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.137872  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.01 
 
 
920 aa  654    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3616  formate dehydrogenase, alpha subunit  97.61 
 
 
1421 aa  2896    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3493  formate dehydrogenase, alpha subunit  97.61 
 
 
1425 aa  2876    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.06 
 
 
686 aa  650    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0413343  normal  0.361775 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.46 
 
 
905 aa  663    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3298  formate dehydrogenase, alpha subunit  83.74 
 
 
1432 aa  2494    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.42 
 
 
904 aa  743    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.39 
 
 
677 aa  622  1e-176  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.06 
 
 
674 aa  619  1e-175  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2249  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.47 
 
 
903 aa  614  9.999999999999999e-175  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.580662  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.89 
 
 
674 aa  611  1e-173  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.6 
 
 
674 aa  610  1e-173  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.17 
 
 
674 aa  607  9.999999999999999e-173  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.95 
 
 
676 aa  600  1e-170  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4651  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.62 
 
 
937 aa  600  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2805  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.37 
 
 
945 aa  600  1e-170  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2513  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.6 
 
 
927 aa  602  1e-170  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0190469  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.09 
 
 
676 aa  602  1e-170  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8358  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.17 
 
 
988 aa  597  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5226  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.17 
 
 
988 aa  596  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24763  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.09 
 
 
676 aa  598  1e-169  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2902  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.71 
 
 
984 aa  596  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679741  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3012  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  38.59 
 
 
984 aa  595  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.467116  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3266  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.58 
 
 
988 aa  595  1e-168  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271284  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2964  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.59 
 
 
984 aa  595  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0450  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.47 
 
 
984 aa  593  1e-167  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.858013  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0967  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.47 
 
 
984 aa  593  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2595  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.47 
 
 
984 aa  593  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.619743  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0180  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.47 
 
 
984 aa  593  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1391  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.7 
 
 
947 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.16 
 
 
689 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  43.1 
 
 
745 aa  585  1.0000000000000001e-165  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1622  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.32 
 
 
984 aa  586  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.437101  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3926  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.05 
 
 
924 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0293  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.8 
 
 
989 aa  582  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2058  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.78 
 
 
967 aa  580  1e-164  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.896651  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1282  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.12 
 
 
933 aa  581  1e-164  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.402771 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.85 
 
 
688 aa  580  1e-164  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4160  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.56 
 
 
1110 aa  577  1.0000000000000001e-163  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.129392  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4746  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.5 
 
 
1111 aa  577  1.0000000000000001e-163  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.879601  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6171  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.07 
 
 
989 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.796652 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0619  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.04 
 
 
956 aa  575  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.961077  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4119  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.98 
 
 
754 aa  573  1.0000000000000001e-162  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0720  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.32 
 
 
949 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.11 
 
 
925 aa  572  1e-161  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4144  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.96 
 
 
983 aa  571  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110494  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2383  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.2 
 
 
959 aa  573  1e-161  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0997  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.81 
 
 
953 aa  572  1e-161  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0255  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.17 
 
 
952 aa  570  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0971632  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3710  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  36.63 
 
 
977 aa  570  1e-161  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.749683  normal  0.699855 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2366  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.84 
 
 
983 aa  570  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.739285 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4582  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.31 
 
 
989 aa  569  1e-160  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.656955 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4024  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.04 
 
 
966 aa  569  1e-160  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0389  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.46 
 
 
944 aa  567  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5043  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.31 
 
 
989 aa  569  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.331865  normal  0.361747 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0735  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.49 
 
 
952 aa  567  1e-160  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1038  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.26 
 
 
1130 aa  569  1e-160  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0552  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.84 
 
 
983 aa  568  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.918724  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2427  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.18 
 
 
929 aa  568  1e-160  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0990  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.84 
 
 
983 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.656443 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0895  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.72 
 
 
983 aa  567  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.99873  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1031  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.84 
 
 
983 aa  568  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52357  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0337  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.98 
 
 
955 aa  568  1e-160  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1109  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.1 
 
 
963 aa  564  1.0000000000000001e-159  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.612386  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2823  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.58 
 
 
949 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.156592  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4097  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.47 
 
 
959 aa  565  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>