More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3331 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1028  TonB-dependent receptor  97.69 
 
 		 861 aa  1712    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.518933  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02748  putative TonB-dependent outer membrane receptor  48.43 
 
 		 856 aa  776    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2931  TonB-dependent receptor  77.14 
 
 		 870 aa  1323    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000063349  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2180  TonB-dependent receptor  64.66 
 
 		 869 aa  1107    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3081  TonB-dependent receptor  80.28 
 
 		 857 aa  1447    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0959  TonB-dependent receptor  97 
 
 		 858 aa  1694    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02745  putative TonB-dependent outer membrane receptor  43.22 
 
 		 1015 aa  669    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1061  TonB-dependent receptor  97 
 
 		 867 aa  1717    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3096  TonB-dependent receptor  81.2 
 
 		 851 aa  1437    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3992  TonB-dependent receptor plug  52.35 
 
 		 877 aa  883    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  0.249271 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3331  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 867 aa  1763    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2896  putative TonB-dependent outer membrane receptor  52.83 
 
 		 867 aa  828    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000792676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2417  TonB-dependent receptor, plug  37.5 
 
 		 823 aa  535  1e-150  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01460  TonB-dependent receptor, putative  36.68 
 
 		 864 aa  523  1e-147  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1723  TonB-dependent receptor  35.34 
 
 		 868 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00128023  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1378  TonB-dependent receptor  33.12 
 
 		 872 aa  415  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.571563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3801  TonB-dependent receptor  33.93 
 
 		 800 aa  409  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2718  TonB-dependent receptor  31.94 
 
 		 803 aa  405  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000743296 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3884  TonB-dependent receptor  32.76 
 
 		 797 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000140414  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02222  putative TonB-dependent receptor  33.82 
 
 		 853 aa  391  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3715  TonB-dependent receptor  32.34 
 
 		 812 aa  390  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000223353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0517  TonB-dependent receptor  32.57 
 
 		 817 aa  390  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.069894  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0430  TonB-dependent receptor  32 
 
 		 797 aa  389  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000261093  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0442  TonB-dependent receptor  31.89 
 
 		 797 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126161  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3540  TonB-dependent receptor  32.11 
 
 		 812 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000560682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0415  TonB-dependent receptor  32.15 
 
 		 812 aa  388  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0145049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3139  TonB-dependent receptor  31.43 
 
 		 795 aa  362  1e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0252363  normal  0.788798 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2484  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.83 
 
 		 800 aa  361  3e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104897  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0702  TonB-dependent receptor  30.6 
 
 		 948 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.861146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01941  TonB-dependent outer membrane receptor  31.32 
 
 		 784 aa  352  1e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1342  ferric enterobactin receptor  29.75 
 
 		 793 aa  350  8e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127602  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1277  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 793 aa  348  3e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0868326  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3218  putative TonB-dependent receptor for Fe  31.02 
 
 		 848 aa  340  5.9999999999999996e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3152  TonB-dependent receptor  30.96 
 
 		 811 aa  340  9e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1412  TonB-dependent receptor  31.31 
 
 		 847 aa  340  9.999999999999999e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2818  TonB-dependent receptor  30.5 
 
 		 853 aa  338  1.9999999999999998e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141379  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01938  TonB-dependent outer membrane Receptor  31.39 
 
 		 799 aa  338  1.9999999999999998e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2289  outer membrane protein  30.17 
 
 		 870 aa  337  7.999999999999999e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000176254  unclonable  0.000000033388 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2657  TonB-dependent receptor plug  32.17 
 
 		 811 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0512157  normal  0.824086 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3011  TonB-dependent sideophore receptor, putative  29.94 
 
 		 821 aa  324  4e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659574  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  30.65 
 
 		 874 aa  323  6e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  30.13 
 
 		 918 aa  322  1.9999999999999998e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2892  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  29.82 
 
 		 815 aa  321  3e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2342  TonB-dependent receptor  31.24 
 
 		 795 aa  320  9e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3349  TonB-dependent receptor  30.22 
 
 		 815 aa  318  3e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3580  TonB-dependent receptor  32.19 
 
 		 835 aa  316  9.999999999999999e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2509  TonB-dependent receptor  31 
 
 		 803 aa  310  1.0000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2621  TonB-dependent receptor  30.76 
 
 		 871 aa  309  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 924 aa  304  6.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2507  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 		 842 aa  301  3e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3441  TonB-dependent receptor  37.04 
 
 		 843 aa  291  5.0000000000000004e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00117935  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 947 aa  284  6.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1693  TonB-dependent receptor  29.46 
 
 		 858 aa  273  1e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2586  TonB-dependent receptor plug  28.93 
 
 		 924 aa  262  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427488  normal  0.0373084 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0349  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 850 aa  248  4.9999999999999997e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 887 aa  247  8e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0456  TonB-dependent receptor  31.96 
 
 		 797 aa  240  9e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000941597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1934  TonB-dependent receptor plug  29.15 
 
 		 813 aa  239  1e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 987 aa  230  8e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01939  TonB-dependent outer membrane receptor  33.65 
 
 		 795 aa  226  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2160  TonB-dependent receptor, plug  32.28 
 
 		 797 aa  226  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00475664  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1344  ferric enterobactin receptor  31.23 
 
 		 788 aa  218  4e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  unclonable  0.00000000120084  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0932  TonB-dependent receptor, plug  30.61 
 
 		 840 aa  217  9e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2290  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  33.26 
 
 		 800 aa  214  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569019 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1279  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 		 788 aa  213  7.999999999999999e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.0000000456142  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30590  putative outer membrane receptor protein  31.73 
 
 		 884 aa  208  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.507511 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0935  TonB-dependent receptor, plug  29.12 
 
 		 961 aa  206  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1708  TonB-dependent receptor  30.27 
 
 		 817 aa  202  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  31.19 
 
 		 883 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7322  TonB-dependent receptor  30.66 
 
 		 804 aa  197  8.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04865  TonB-dependent outer membrane Receptor  30.02 
 
 		 811 aa  189  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0393  putative TonB-dependent siderophore receptor  31.91 
 
 		 847 aa  189  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2607  TonB-dependent siderophore receptor, putative  37.83 
 
 		 832 aa  177  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0816697  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0399  putative TonB-dependent siderophore receptor  29.68 
 
 		 818 aa  177  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1490  TonB-dependent receptor, plug  28.12 
 
 		 948 aa  176  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21630  TonB-dependent siderophore receptor  28.17 
 
 		 833 aa  174  9e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176382  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  35.33 
 
 		 933 aa  172  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0915  TonB-dependent receptor plug  29.43 
 
 		 842 aa  169  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2592  TonB-dependent receptor plug  28.89 
 
 		 885 aa  164  9e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 842 aa  151  5e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 843 aa  151  6e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  26.42 
 
 		 853 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  26.42 
 
 		 853 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 855 aa  146  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2031  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 849 aa  146  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  26.31 
 
 		 853 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 853 aa  145  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  25.16 
 
 		 839 aa  145  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 841 aa  145  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1586  TonB-dependent receptor plug  35.34 
 
 		 816 aa  138  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  24.97 
 
 		 853 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0516  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 909 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0428705 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 855 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2260  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 852 aa  132  4.0000000000000003e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  24.95 
 
 		 867 aa  131  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 838 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 867 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  25.05 
 
 		 867 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  24.95 
 
 		 867 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2276  TonB-dependent receptor plug  25.45 
 
 		 873 aa  122  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>