125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3205 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3205  protein of unknown function DUF861 cupin_3  100 
 
 
121 aa  252  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1090  hypothetical protein  98.35 
 
 
121 aa  249  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00838125  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1184  protein of unknown function DUF861 cupin_3  98.35 
 
 
121 aa  249  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.831048  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1150  protein of unknown function DUF861 cupin_3  98.35 
 
 
121 aa  248  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00929773  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1082  protein of unknown function DUF861, cupin_3  95.87 
 
 
121 aa  243  8e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000597126  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2929  protein of unknown function DUF861, cupin_3  81.82 
 
 
121 aa  217  5e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000538599  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3011  protein of unknown function DUF861, cupin_3  81.82 
 
 
121 aa  217  5e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253622  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3501  hypothetical protein  80.99 
 
 
124 aa  213  7e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3108  protein of unknown function DUF861, cupin_3  82.35 
 
 
119 aa  213  8e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.312601  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0934  protein of unknown function DUF861 cupin_3  59.66 
 
 
128 aa  167  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0150231  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2651  hypothetical protein  61.67 
 
 
121 aa  166  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000014442  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3024  protein of unknown function DUF861, cupin_3  60.68 
 
 
124 aa  165  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00331954  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0964  protein of unknown function DUF861, cupin_3  59.5 
 
 
121 aa  165  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.179543  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5189  protein of unknown function DUF861, cupin_3  57.98 
 
 
119 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322269  normal  0.130139 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1112  protein of unknown function DUF861 cupin_3  58.97 
 
 
120 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143177  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5279  hypothetical protein  57.98 
 
 
119 aa  161  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5331  protein of unknown function DUF861 cupin_3  57.14 
 
 
119 aa  160  6e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.038012 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0191  protein of unknown function DUF861 cupin_3  57.14 
 
 
119 aa  160  7e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000184292 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6090  hypothetical protein  57.14 
 
 
120 aa  157  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70170  hypothetical protein  56.3 
 
 
120 aa  156  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0236  protein of unknown function DUF861, cupin_3  57.14 
 
 
119 aa  156  9e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0091  hypothetical protein  53.78 
 
 
121 aa  154  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0226  hypothetical protein  53.85 
 
 
122 aa  154  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1042  protein of unknown function DUF861, cupin_3  55.46 
 
 
127 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0284329  normal  0.382411 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5535  hypothetical protein  52.1 
 
 
120 aa  144  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.110951  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6639  protein of unknown function DUF861 cupin_3  51.26 
 
 
120 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7526  hypothetical protein  47.9 
 
 
126 aa  130  9e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190702  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7677  hypothetical protein  46.02 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207566  normal  0.173721 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6071  protein of unknown function DUF861, cupin_3  44.64 
 
 
126 aa  120  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.045392  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3903  protein of unknown function DUF861 cupin_3  42.61 
 
 
120 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.845476  normal  0.334564 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4020  protein of unknown function DUF861 cupin_3  42.24 
 
 
123 aa  118  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3725  protein of unknown function DUF861 cupin_3  41.38 
 
 
123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2281  protein of unknown function DUF861 cupin_3  48.25 
 
 
117 aa  114  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.309355  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1908  hypothetical protein  37.07 
 
 
123 aa  95.9  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.346716 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3449  protein of unknown function DUF861, cupin_3  46.3 
 
 
113 aa  94.7  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1755  hypothetical protein  38.94 
 
 
113 aa  87.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385601  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0401  protein of unknown function DUF861, cupin_3  38.94 
 
 
113 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2491  protein of unknown function DUF861 cupin_3  43.43 
 
 
115 aa  84  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415528  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4007  hypothetical protein  38.78 
 
 
128 aa  82  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1693  hypothetical protein  37.61 
 
 
114 aa  81.3  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0868  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.34 
 
 
113 aa  81.3  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.470118  normal  0.846065 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0821  hypothetical protein  35.77 
 
 
149 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.79703  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0042  hypothetical protein  39.45 
 
 
120 aa  77  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.358454 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1330  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.59 
 
 
117 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335699  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1243  protein of unknown function DUF861 cupin_3  41.49 
 
 
117 aa  72.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.385254  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0745  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.4 
 
 
121 aa  70.1  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4423  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.78 
 
 
118 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.728084  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2474  hypothetical protein  37.78 
 
 
114 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2907  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.17 
 
 
117 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186093  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28380  hypothetical protein  37.78 
 
 
114 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1428  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.46 
 
 
127 aa  67  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1826  hypothetical protein  33.02 
 
 
119 aa  67.4  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.756996  normal  0.856699 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5000  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.05 
 
 
118 aa  67  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.883571  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2742  hypothetical protein  38.3 
 
 
119 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3011  protein of unknown function DUF861, cupin_3  38.3 
 
 
119 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0453  protein of unknown function DUF861, cupin_3  37.78 
 
 
114 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0932  protein of unknown function DUF861, cupin_3  37.78 
 
 
114 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5674  hypothetical protein  34.31 
 
 
118 aa  65.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0894  protein of unknown function DUF861 cupin_3  37.36 
 
 
114 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5603  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.32 
 
 
117 aa  64.3  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.919827  normal  0.384238 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5027  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.32 
 
 
117 aa  64.3  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.838844 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3027  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.17 
 
 
119 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0697  hypothetical protein  37.5 
 
 
114 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.895833  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4028  hypothetical protein  36.67 
 
 
114 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1516  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.25 
 
 
123 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0807  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.67 
 
 
114 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4665  hypothetical protein  35.56 
 
 
114 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.777876  normal  0.983259 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0796  protein of unknown function DUF861, cupin_3  36.67 
 
 
114 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4529  protein of unknown function DUF861, cupin_3  35.56 
 
 
114 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.241247  normal  0.339292 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0856  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.36 
 
 
114 aa  63.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4660  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.56 
 
 
114 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.894659  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0771  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.56 
 
 
114 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356795  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3163  protein of unknown function DUF861, cupin_3  36.36 
 
 
115 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230079  normal  0.0805493 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4966  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.26 
 
 
117 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0418481 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0909  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.67 
 
 
116 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3856  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.26 
 
 
120 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19750  hypothetical protein  31.11 
 
 
114 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3083  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.54 
 
 
296 aa  58.5  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0397869 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1701  hypothetical protein  31.11 
 
 
114 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.127325  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0904  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.51 
 
 
113 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.7582  normal  0.40632 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4304  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.51 
 
 
113 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.631594  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7505  hypothetical protein  32.26 
 
 
117 aa  53.9  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5197  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.25 
 
 
114 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0874  hypothetical protein  30.14 
 
 
113 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0771767  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2785  hypothetical protein  39.62 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0047  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.94 
 
 
119 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0918  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.14 
 
 
113 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0754701  normal  0.435909 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2183  protein of unknown function DUF861, cupin_3  29.06 
 
 
252 aa  52  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.488823  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39730  hypothetical protein  34.29 
 
 
115 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2676  hypothetical protein  31.08 
 
 
114 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0142789 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1305  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.76 
 
 
91 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2618  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.29 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.813991  normal  0.532352 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1533  protein of unknown function DUF861, cupin_3  35.94 
 
 
91 aa  48.5  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000391778  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4606  protein of unknown function DUF861, cupin_3  29.17 
 
 
124 aa  47.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2687  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.32 
 
 
240 aa  47.4  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3842  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.53 
 
 
127 aa  47.4  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.656555  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0290  protein of unknown function DUF861, cupin_3  23.89 
 
 
227 aa  47  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.774685 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1631  protein of unknown function DUF861, cupin_3  35.82 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1704  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.82 
 
 
89 aa  46.6  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1386  cupin superfamily protein  34.38 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.101999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>