114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3033 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3033  hypothetical protein  100 
 
 
234 aa  471  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.501077  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1327  hypothetical protein  99.57 
 
 
239 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1317  hypothetical protein  99.57 
 
 
239 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1353  hypothetical protein  99.15 
 
 
239 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1117  hypothetical protein  67.24 
 
 
234 aa  325  5e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1005  hypothetical protein  64.22 
 
 
234 aa  318  6e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.433057  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1194  hypothetical protein  64.66 
 
 
234 aa  314  8e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.0000261256 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1944  hypothetical protein  65.96 
 
 
235 aa  311  3.9999999999999997e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137324  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1336  hypothetical protein  58.97 
 
 
234 aa  283  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0717  hypothetical protein  53.21 
 
 
267 aa  274  9e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000102421  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4008  hypothetical protein  58.3 
 
 
239 aa  267  1e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02644  putative periplasmic protein  50.64 
 
 
240 aa  224  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4680  hypothetical protein  35.53 
 
 
221 aa  96.3  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.467996  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2652  hypothetical protein  35.41 
 
 
242 aa  94.4  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000484219  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0478  hypothetical protein  45.08 
 
 
229 aa  87  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2028  hypothetical protein  31.09 
 
 
234 aa  79.7  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2041  hypothetical protein  31.11 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0564933  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0294  hypothetical protein  31.38 
 
 
223 aa  79.7  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0547  hypothetical protein  48.39 
 
 
230 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3483  hypothetical protein  48.39 
 
 
230 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0546  hypothetical protein  48.39 
 
 
230 aa  79  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3025  hypothetical protein  31.14 
 
 
240 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00392442  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0595  putative transmembrane protein  32.93 
 
 
234 aa  77.8  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812754  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1111  hypothetical protein  47.96 
 
 
240 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0309164  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3326  hypothetical protein  45.16 
 
 
230 aa  77  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0599  hypothetical protein  45.45 
 
 
230 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0194  hypothetical protein  42.86 
 
 
245 aa  76.6  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.743567 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3079  hypothetical protein  36.25 
 
 
256 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1183  hypothetical protein  32.71 
 
 
240 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3155  hypothetical protein  44.33 
 
 
245 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.751817  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3206  hypothetical protein  32.71 
 
 
240 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1089  hypothetical protein  32.71 
 
 
240 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0210765  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1149  hypothetical protein  32.71 
 
 
240 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0395177  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4694  hypothetical protein  27.34 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4047  hypothetical protein  26.95 
 
 
248 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02514  hypothetical protein  36.67 
 
 
227 aa  75.5  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3838  hypothetical protein  26.95 
 
 
248 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3931  hypothetical protein  26.95 
 
 
248 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0506  hypothetical protein  29.48 
 
 
230 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255853  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1750  hypothetical protein  27.1 
 
 
219 aa  74.3  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.034244  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3265  putative transmembrane protein  35.04 
 
 
268 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3818  hypothetical protein  29.48 
 
 
230 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3944  hypothetical protein  29.48 
 
 
230 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.291724  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3762  hypothetical protein  29.48 
 
 
230 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.852713 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3587  hypothetical protein  35.77 
 
 
268 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00011907  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0547  hypothetical protein  46.24 
 
 
230 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1989  hypothetical protein  29.08 
 
 
249 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0926044  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0429  hypothetical protein  34.31 
 
 
230 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3732  hypothetical protein  34.65 
 
 
230 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.817538  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46580  hypothetical protein  29.37 
 
 
252 aa  73.2  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1081  hypothetical protein  33.18 
 
 
240 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000020952  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3575  hypothetical protein  40.15 
 
 
219 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.580348  hitchhiker  0.00969465 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3552  hypothetical protein  28.57 
 
 
244 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2602  hypothetical protein  36.59 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.245239  normal  0.167948 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1041  hypothetical protein  43.69 
 
 
239 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0114575  normal  0.584816 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3533  hypothetical protein  40.19 
 
 
228 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2231  hypothetical protein  40.95 
 
 
280 aa  69.3  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0933  hypothetical protein  43.69 
 
 
244 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.281157  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3159  hypothetical protein  28.69 
 
 
229 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3109  hypothetical protein  41.84 
 
 
240 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052504  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4388  hypothetical protein  28.12 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4354  hypothetical protein  35.34 
 
 
229 aa  67  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4213  hypothetical protein  28.12 
 
 
245 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0660  hypothetical protein  32.91 
 
 
241 aa  66.6  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3012  hypothetical protein  41.84 
 
 
240 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0896353  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0128  hypothetical protein  28.12 
 
 
248 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0130  hypothetical protein  27.68 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0341016  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3348  hypothetical protein  29.02 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00245935  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0151  hypothetical protein  27.68 
 
 
252 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2930  hypothetical protein  40.82 
 
 
240 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617689  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4252  hypothetical protein  27.68 
 
 
248 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0239  hypothetical protein  34.48 
 
 
256 aa  63.9  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00504  hypothetical protein  31.52 
 
 
273 aa  63.9  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3379  putative transmembrane protein  30.77 
 
 
269 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0341  signal peptide protein  29.89 
 
 
268 aa  62.8  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3502  hypothetical protein  37.39 
 
 
280 aa  62.4  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0216  signal peptide protein  33.91 
 
 
271 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000480093 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0197  hypothetical protein  33.91 
 
 
271 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.680563 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0030  hypothetical protein  27.68 
 
 
251 aa  62  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00621032  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0162  hypothetical protein  33.9 
 
 
243 aa  62  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.844011 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0963  hypothetical protein  39.81 
 
 
239 aa  61.6  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151638  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0180  hypothetical protein  33.9 
 
 
243 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223462  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2403  hypothetical protein  41.35 
 
 
220 aa  59.7  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0239  hypothetical protein  34.17 
 
 
266 aa  59.3  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220267  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0301  hypothetical protein  39.86 
 
 
243 aa  59.3  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2962  hypothetical protein  36.36 
 
 
265 aa  58.5  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0182  hypothetical protein  34.42 
 
 
265 aa  57  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.56754  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1084  hypothetical protein  41.3 
 
 
272 aa  57  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0585166  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3711  hypothetical protein  32 
 
 
235 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.167645  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0290  hypothetical protein  29.41 
 
 
265 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1829  hypothetical protein  25.76 
 
 
253 aa  56.2  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0805  hypothetical protein  43.9 
 
 
231 aa  55.5  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.201838  normal  0.0153835 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0274  hypothetical protein  35.42 
 
 
232 aa  55.1  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5922  hypothetical protein  41.86 
 
 
287 aa  55.1  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0052  hypothetical protein  39.13 
 
 
257 aa  54.7  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0060351  normal  0.567667 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5833  hypothetical protein  35.88 
 
 
298 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1890  hypothetical protein  31.33 
 
 
225 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2512  hypothetical protein  32.14 
 
 
263 aa  52.8  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0104508  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1482  hypothetical protein  27.72 
 
 
232 aa  52  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3758  hypothetical protein  27.81 
 
 
241 aa  51.6  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>