58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2963 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2963  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
421 aa  833  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  1.21972e-05  normal  0.284618 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0981  hypothetical protein  57.53 
 
 
415 aa  465  1e-130  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1438  major facilitator transporter  59.01 
 
 
415 aa  455  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3505  major facilitator transporter  50 
 
 
412 aa  377  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1824  major facilitator transporter  50.38 
 
 
415 aa  363  3e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1433  transporter, MFS superfamily  45.48 
 
 
420 aa  341  1e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.811642  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1261  major facilitator transporter  45.16 
 
 
406 aa  329  5e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0306  major facilitator transporter  48.03 
 
 
409 aa  322  8e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.338859  normal  0.158126 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  27 
 
 
406 aa  124  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3964  transporter, putative  27.6 
 
 
407 aa  124  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  5.23123e-10  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00677  transporter, putative  25.93 
 
 
405 aa  123  5e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00179637  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3819  major facilitator transporter  27.14 
 
 
425 aa  123  7e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  5.6973e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0067  major facilitator transporter  26.92 
 
 
406 aa  119  8e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37883  hitchhiker  0.00294151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0062  major facilitator transporter  26.44 
 
 
406 aa  118  2e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.7183  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0066  major facilitator superfamily MFS_1  26.99 
 
 
406 aa  118  2e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.574631  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4287  major facilitator transporter  26.92 
 
 
406 aa  116  6e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  5.04378e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0063  major facilitator transporter  29.22 
 
 
406 aa  112  1e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0580428  unclonable  3.12687e-05 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0067  major facilitator transporter  29.22 
 
 
406 aa  112  2e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.700351  unclonable  8.55622e-11 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  26.92 
 
 
415 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0065  major facilitator transporter  29.12 
 
 
406 aa  110  4e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.596651  decreased coverage  7.29069e-08 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4329  major facilitator superfamily MFS_1  25.8 
 
 
420 aa  86.3  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0005  major facilitator transporter  25.63 
 
 
421 aa  80.1  7e-14  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0753564  normal  0.228788 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2076  major facilitator superfamily MFS_1  23.45 
 
 
419 aa  67  7e-10  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0068  transporter, putative  22.12 
 
 
391 aa  64.7  3e-09  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0065  major facilitator family transporter  22.12 
 
 
388 aa  64.7  3e-09  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0563  major facilitator transporter  24.66 
 
 
425 aa  61.2  3e-08  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  23.2 
 
 
395 aa  59.7  9e-08  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  23.99 
 
 
408 aa  55.8  1e-06  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  4.42276e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  23.74 
 
 
408 aa  56.2  1e-06  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0838  major facilitator family transporter  32 
 
 
397 aa  55.1  2e-06  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0222  major facilitator superfamily MFS_1  25.21 
 
 
388 aa  54.7  3e-06  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.153836  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28819  predicted protein  20.35 
 
 
505 aa  52  2e-05  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00143526 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6584  major facilitator superfamily MFS_1  26.4 
 
 
420 aa  51.6  3e-05  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0694  transporter, major facilitator family protein  25.29 
 
 
393 aa  49.7  9e-05  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6949  L-fucose transporter  21.88 
 
 
457 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0419  major facilitator transporter  22.57 
 
 
394 aa  49.7  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.664236  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08768  conserved hypothetical protein  23.64 
 
 
433 aa  49.3  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0863373  normal  0.186532 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2947  major facilitator superfamily MFS_1  24.72 
 
 
432 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1540  L-fucose permease  21.52 
 
 
457 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1434  major facilitator transporter  24.94 
 
 
432 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6289  L-fucose transporter  21.52 
 
 
457 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.642767 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1407  major facilitator transporter  24.61 
 
 
447 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  23.68 
 
 
395 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  22.95 
 
 
426 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  23.41 
 
 
435 aa  46.6  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45095  conserved hypothetical membrane protein  24.46 
 
 
433 aa  46.2  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.562888 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1068  major facilitator transporter  24.48 
 
 
395 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0309  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
394 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  0.0116051 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6905  L-fucose permease  21.78 
 
 
457 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3905  major facilitator transporter  39.29 
 
 
416 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.187616  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3116  major facilitator superfamily MFS_1  23.79 
 
 
430 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  1.15925e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0439  major facilitator transporter  20.95 
 
 
394 aa  45.1  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.116076  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1398  major facilitator transporter  24.34 
 
 
432 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1015  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
479 aa  44.3  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.449105 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  25.81 
 
 
424 aa  44.3  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0130  major facilitator transporter  22.46 
 
 
398 aa  44.3  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.453953  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  22.61 
 
 
426 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2967  major facilitator transporter  23.92 
 
 
392 aa  43.1  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>