150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2959 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_1822  TonB-dependent receptor, plug  68.87 
 
 
756 aa  1096  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000398859  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3503  TonB-dependent receptor  65.74 
 
 
754 aa  1019  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216173  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0143  TonB-dependent receptor plug  49.25 
 
 
864 aa  659  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556848  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1434  TonB-dependent receptor  63.03 
 
 
753 aa  1012  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000294975  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2959  TonB-dependent receptor  100 
 
 
761 aa  1545  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.404716 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0977  TonB-dependent receptor  60.86 
 
 
757 aa  953  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0305  TonB-dependent receptor  36.82 
 
 
786 aa  434  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.301005 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04790  TonB-dependent receptor  34.16 
 
 
793 aa  414  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0241337  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 
866 aa  263  9e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0068  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 
798 aa  251  4e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00237309  hitchhiker  0.00396946 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0063  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 
798 aa  251  5e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0128619  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0067  outer membrane insertion C-terminal signal  28.38 
 
 
798 aa  250  8e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00013463  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4286  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 
798 aa  248  3e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  1.8092e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0066  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 
798 aa  238  4e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000206959  hitchhiker  1.55765e-08 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0064  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 
798 aa  238  4e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00224959  unclonable  4.16662e-05 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0068  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 
798 aa  238  4e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.21546e-05  unclonable  2.40632e-10 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3961  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 
835 aa  234  3e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3988  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 
798 aa  233  7e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  2.35152e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01250  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 
882 aa  233  9e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02415  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 
814 aa  229  1e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4077  cyclic nucleotide-binding protein  26.49 
 
 
959 aa  211  6e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02625  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 
836 aa  210  7e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107636  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3963  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 
812 aa  181  4e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  3.86767e-06  normal  0.0993256 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3957  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 
870 aa  177  8e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03378  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 
798 aa  165  4e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0156374  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1484  TonB-dependent receptor plug  33.83 
 
 
831 aa  141  5e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.135772  normal  0.425755 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0866  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 
879 aa  138  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.250778  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0334  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 
815 aa  137  6e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  6.17894e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3229  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 
875 aa  128  4e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3280  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 
923 aa  115  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322049  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1881  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 
838 aa  113  1e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.490789  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 
779 aa  64.7  6e-09  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  29.36 
 
 
680 aa  62  4e-08  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  29.55 
 
 
634 aa  58.9  4e-07  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  27.47 
 
 
792 aa  57.8  7e-07  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  22.52 
 
 
742 aa  57.8  8e-07  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 
751 aa  57.4  1e-06  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  8.75615e-10  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0110  TonB dependent receptor  24.56 
 
 
693 aa  56.6  2e-06  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 
758 aa  55.5  3e-06  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  22.87 
 
 
738 aa  55.5  3e-06  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  8.35907e-06  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 
764 aa  53.5  1e-05  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  25 
 
 
703 aa  52.8  2e-05  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0109  TonB-dependent siderophore receptor  21.38 
 
 
703 aa  52.4  3e-05  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 
730 aa  52.4  3e-05  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  7.05013e-05 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  23.35 
 
 
742 aa  52.8  3e-05  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  1.85534e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 
764 aa  51.6  5e-05  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  3.45148e-11  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 
737 aa  50.8  8e-05  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 
740 aa  51.2  8e-05  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  30.23 
 
 
708 aa  50.8  9e-05  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  23.53 
 
 
701 aa  50.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  20.75 
 
 
752 aa  50.4  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0106  TonB-dependent siderophore receptor  26.47 
 
 
728 aa  50.4  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2813  molybdate ABC transporter permease  23.61 
 
 
743 aa  50.8  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  1.03561e-06  decreased coverage  4.63153e-07 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  23.53 
 
 
701 aa  50.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1443  TonB-dependent siderophore receptor  24.67 
 
 
743 aa  50.8  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281605  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  29.02 
 
 
623 aa  50.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 
948 aa  50.1  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 
720 aa  49.3  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  23.31 
 
 
714 aa  48.9  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0825  TonB-dependent siderophore receptor  30.5 
 
 
759 aa  48.9  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000404003  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1139  TonB-dependent siderophore receptor  27.44 
 
 
736 aa  49.3  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.489697 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  25.35 
 
 
655 aa  48.9  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2169  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25 
 
 
694 aa  48.1  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.108589 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1142  TonB-dependent siderophore receptor  21.1 
 
 
711 aa  48.5  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.634377  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4773  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 
624 aa  48.1  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.386912  normal  0.53176 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1059  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 
777 aa  48.1  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000502668  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  23.11 
 
 
701 aa  48.1  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  23.6 
 
 
771 aa  48.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2040  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 
815 aa  48.1  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  23.86 
 
 
771 aa  47.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0252  TonB-dependent receptor  41.27 
 
 
663 aa  48.1  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.945527  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0604  TonB-dependent outer membrane receptor  26.15 
 
 
682 aa  47.8  0.0008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  22.03 
 
 
729 aa  47.8  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  24.88 
 
 
634 aa  47.8  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  2.11979e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3385  TonB-dependent siderophore receptor  27.4 
 
 
730 aa  47.8  0.0009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 
769 aa  47  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  22.04 
 
 
715 aa  47  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0485  TonB-dependent receptor  22.89 
 
 
702 aa  47.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.517963  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  28.07 
 
 
646 aa  47  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.08252e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4135  ferrioxamine B receptor precursor protein  25.09 
 
 
726 aa  47  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156472  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1045  TonB-dependent siderophore receptor  22.54 
 
 
699 aa  47.4  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616371  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 
723 aa  47  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 
724 aa  47  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  24.44 
 
 
613 aa  47.4  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 
724 aa  47  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 
749 aa  47  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  3.58025e-10  decreased coverage  1.02915e-05 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 
720 aa  46.2  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  21.79 
 
 
798 aa  46.6  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  3.08376e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3466  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 
718 aa  46.2  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  24.42 
 
 
720 aa  46.6  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 
758 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  23.43 
 
 
729 aa  46.2  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2993  TonB-dependent receptor  23.74 
 
 
705 aa  46.6  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.162079  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05640  hypothetical protein  26.77 
 
 
730 aa  46.6  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1973  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  26.11 
 
 
783 aa  46.6  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41369  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3000  TonB-dependent receptor  33.59 
 
 
854 aa  46.6  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.249213  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 
780 aa  46.2  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2953  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 
700 aa  46.2  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.191776  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3807  TonB-dependent receptor plug  24.14 
 
 
655 aa  46.2  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  25 
 
 
715 aa  46.6  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>