More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2650 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2650  integrase family protein  100 
 
 		 410 aa  845    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0205154  hitchhiker  0.00000395125 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3273  phage integrase family protein  52.58 
 
 		 401 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0956673  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3410  integrase family protein  52.58 
 
 		 401 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134022  hitchhiker  0.000868318 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2845  phage integrase family protein  43.24 
 
 		 409 aa  351  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  0.121401 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3013  phage integrase family site specific recombinase  42.62 
 
 		 419 aa  333  3e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2942  phage integrase family protein  32.5 
 
 		 392 aa  184  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000983731 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1571  site-specific recombinase, phage integrase family  32.05 
 
 		 409 aa  179  9e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0359454  decreased coverage  0.000000698249 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2292  phage integrase family protein  30.79 
 
 		 393 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.919949  normal  0.20238 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1639  phage integrase family protein  31.07 
 
 		 403 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0427266  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2626  phage integrase family protein  29.02 
 
 		 393 aa  172  6.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000269871  normal  0.0831358 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2668  phage integrase family site specific recombinase  29.98 
 
 		 411 aa  169  7e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3754  integrase family protein  29.33 
 
 		 407 aa  164  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.290204  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0948  putative integrase  31.19 
 
 		 385 aa  161  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3579  integrase  31.13 
 
 		 389 aa  161  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000745226 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0939  phage integrase family site specific recombinase  29.09 
 
 		 406 aa  161  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.456123  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  28.09 
 
 		 414 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  27.85 
 
 		 414 aa  152  8.999999999999999e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2015  phage integrase family site specific recombinase  30 
 
 		 390 aa  147  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  28.68 
 
 		 413 aa  142  9e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0388  phage integrase family site specific recombinase  29.38 
 
 		 429 aa  138  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  29.16 
 
 		 432 aa  137  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  29.16 
 
 		 439 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  27.48 
 
 		 406 aa  136  8e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  29.58 
 
 		 425 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  30.84 
 
 		 420 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  28.78 
 
 		 410 aa  130  6e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0809  phage integrase family site specific recombinase  30.15 
 
 		 419 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0463  phage integrase family protein  28.16 
 
 		 420 aa  117  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0356989 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4162  integrase family protein  26.65 
 
 		 422 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806899  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0393  integrase family protein  28.36 
 
 		 403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451154 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  30.15 
 
 		 403 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0054  phage integrase family site specific recombinase  25.92 
 
 		 422 aa  113  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1859  phage integrase family protein  25.81 
 
 		 427 aa  112  9e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0222826  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  25.99 
 
 		 439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  26.49 
 
 		 420 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0718  integrase family protein  28.18 
 
 		 419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3878  integrase family protein  29.14 
 
 		 421 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0871  integrase family protein  28.66 
 
 		 419 aa  110  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4662  site-specific recombinase, phage integrase family protein  29.14 
 
 		 334 aa  110  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3540  phage integrase family site specific recombinase  28.35 
 
 		 411 aa  110  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000292707  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0747  integrase family protein  29.14 
 
 		 420 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0631504 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3314  site-specific recombinase, phage integrase family protein  28.81 
 
 		 420 aa  109  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.426306  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3082  phage integrase family protein  26.3 
 
 		 437 aa  107  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  26.17 
 
 		 405 aa  107  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4753  phage integrase family site specific recombinase  27.47 
 
 		 421 aa  107  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  27.75 
 
 		 396 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2709  putative prophage integrase  25.93 
 
 		 418 aa  106  8e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4051  phage integrase family site specific recombinase  27.44 
 
 		 419 aa  106  9e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4773  integrase  25.69 
 
 		 449 aa  106  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.368119  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1097  putative phage integrase  27.8 
 
 		 643 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0408493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4272  site-specific recombinase, phage integrase family protein  28.86 
 
 		 421 aa  104  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.451693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  27.44 
 
 		 402 aa  104  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  24.5 
 
 		 419 aa  104  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3676  integrase family protein  27.74 
 
 		 421 aa  104  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329272  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  26.28 
 
 		 394 aa  104  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4160  phage integrase family protein  26.51 
 
 		 419 aa  103  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0690268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02760  hypothetical protein  28.43 
 
 		 319 aa  103  7e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000757589  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  24.41 
 
 		 449 aa  102  9e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1340  phage integrase family protein  27.19 
 
 		 487 aa  102  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.680009  normal  0.929089 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1597  integrase family protein  25.4 
 
 		 602 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.754785  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0697  integrase family protein  26.13 
 
 		 618 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  24.94 
 
 		 440 aa  100  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  24.15 
 
 		 433 aa  100  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  25.12 
 
 		 393 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  27.1 
 
 		 402 aa  100  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3717  integrase family protein  24.74 
 
 		 419 aa  100  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3554  integrase family protein  24.74 
 
 		 419 aa  100  6e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  25.57 
 
 		 410 aa  100  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2119  integrative genetic element Gsu56, integrase  24.34 
 
 		 453 aa  99.8  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3540  phage integrase family protein  25.43 
 
 		 420 aa  99.4  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.216413  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4836  integrase  26.73 
 
 		 421 aa  99.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.712135 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2875  phage integrase family protein  27.71 
 
 		 422 aa  98.6  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.698524  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3466  integrase family protein  27.48 
 
 		 644 aa  98.2  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3266  site-specific recombinase, phage integrase family  26.97 
 
 		 367 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  25.92 
 
 		 404 aa  97.8  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0317  phage integrase  24.74 
 
 		 404 aa  96.3  8e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2104  phage integrase family site specific recombinase  26.22 
 
 		 420 aa  96.3  9e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000885987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3563  integrase family protein  25.34 
 
 		 418 aa  95.9  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1172  integrase family protein  25.34 
 
 		 418 aa  95.9  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3537  integrase family protein  26.99 
 
 		 419 aa  95.1  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3702  integrase family protein  26.91 
 
 		 418 aa  94.7  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1514  integrase family protein  27.63 
 
 		 423 aa  94.7  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04136  predicted integrase  26.5 
 
 		 396 aa  94  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04100  hypothetical protein  26.5 
 
 		 396 aa  94  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0447  integrase family protein  28.13 
 
 		 419 aa  94  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3727  integrase family protein  26.5 
 
 		 396 aa  94  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2526  Phage integrase  30.89 
 
 		 481 aa  93.6  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000237436  normal  0.0434699 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4935  integrase family protein  26.1 
 
 		 439 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.020057  hitchhiker  0.000000122122 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  26.41 
 
 		 414 aa  93.2  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  24.19 
 
 		 439 aa  93.2  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  25 
 
 		 400 aa  93.2  8e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  25.71 
 
 		 413 aa  93.2  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3412  integrase family protein  26.44 
 
 		 424 aa  93.2  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2489  putative integrase protein  24.53 
 
 		 417 aa  92.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  24.6 
 
 		 426 aa  91.7  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  26.15 
 
 		 409 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  26.41 
 
 		 409 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0813  integrase family protein  25.47 
 
 		 427 aa  91.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000471518 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  24.75 
 
 		 400 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000770896  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  26.38 
 
 		 409 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>