142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2594 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_2965  prophage LambdaSo, HK97 family portal protein  93.06 
 
 
432 aa  842  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2594  phage portal protein, HK97 family  100 
 
 
434 aa  897  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.601506  normal  0.257209 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1565  HK97 family phage portal protein  47.38 
 
 
431 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  6.49364e-05 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1337  HK97 family phage portal protein  46.91 
 
 
444 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1680  HK97 family phage portal protein  45.45 
 
 
416 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.905165  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1632  HK97 family phage portal protein  44.1 
 
 
429 aa  347  2e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543468  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4463  phage portal protein, HK97 family  40.1 
 
 
434 aa  289  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  6.79414e-05 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1602  phage portal protein, HK97 family  40.66 
 
 
434 aa  288  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3316  HK97 family phage portal protein  37.91 
 
 
416 aa  285  1e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2069  HK97 family phage portal protein  37.91 
 
 
416 aa  283  3e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0360  HK97 family phage portal protein  37.44 
 
 
445 aa  259  5e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0989  HK97 family phage portal protein  38.11 
 
 
445 aa  259  6e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1670  Phage portal protein, HK97  38.95 
 
 
407 aa  253  7e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1252  HK97 family phage portal protein  36.64 
 
 
420 aa  234  2e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2836  phage portal protein, HK97 family  37.06 
 
 
414 aa  232  8e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1630  HK97 family phage portal protein  35.05 
 
 
440 aa  230  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.506997  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0398  HK97 family phage portal protein  36.8 
 
 
414 aa  230  5e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1087  HK97 family portal protein , putative  33.65 
 
 
444 aa  221  2e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3396  HK97 family phage portal protein  36.21 
 
 
445 aa  219  7e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0697474  hitchhiker  6.93474e-09 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0647  Phage portal protein, HK97  37.23 
 
 
434 aa  218  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.239357  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1483  hypothetical protein  35.75 
 
 
421 aa  214  2e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0644  HK97 family phage portal protein  34.26 
 
 
401 aa  209  6e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1188  HK97 family phage portal protein  31.03 
 
 
413 aa  191  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  1.36411e-08 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2269  phage portal protein, HK97 family  31.03 
 
 
413 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  2.75865e-11 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2265  phage portal protein, HK97 family  31.03 
 
 
413 aa  191  3e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0612775 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5152  HK97 family phage portal protein  33.17 
 
 
412 aa  189  7e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1286  HK97 family phage portal protein  32.8 
 
 
384 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2273  phage portal protein, HK97 family  32.21 
 
 
425 aa  181  2e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1697  phage portal protein, HK97 family  32.21 
 
 
425 aa  181  2e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1313  phage portal protein, HK97 family  32.21 
 
 
425 aa  181  2e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3945  HK97 family phage portal protein  32.68 
 
 
404 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00231416  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7142  HK97 family phage portal protein  31.4 
 
 
524 aa  169  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  hitchhiker  0.00715135 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1657  phage portal protein, HK97 family  32.72 
 
 
408 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1721  HK97 family phage portal protein  31.34 
 
 
419 aa  165  1e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1544  Phage portal protein, HK97  30.7 
 
 
424 aa  164  4e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3972  HK97 family phage portal protein  32.69 
 
 
411 aa  160  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0869  HK97 family phage portal protein  33.06 
 
 
409 aa  160  5e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1996  phage portal protein, HK97 family  29.04 
 
 
473 aa  154  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0463  phage portal protein  28.99 
 
 
411 aa  153  5e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.390433 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1336  HK97 family phage portal protein  29 
 
 
417 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.352989  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2199  HK97 family portal protein , putative  39.42 
 
 
225 aa  141  2e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7331  phage portal protein, HK97 family  30.95 
 
 
428 aa  141  2e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3879  HK97 family phage portal protein  29.03 
 
 
423 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49861  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1469  HK97 family portal protein  26.87 
 
 
390 aa  137  4e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1751  HK97 family phage portal protein  28.49 
 
 
420 aa  132  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2595  HK97 family phage portal protein  27.23 
 
 
436 aa  131  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0014  phage portal protein, HK97 family  25.85 
 
 
409 aa  130  4e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2622  phage portal protein, HK97 family  26.62 
 
 
417 aa  128  2e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.830928  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0953  HK97 family phage portal protein  28.1 
 
 
404 aa  127  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6184  portal protein  28.98 
 
 
414 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3865  HK97 family phage portal protein  28.29 
 
 
429 aa  123  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00272242 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1624  Phage portal protein, HK97  26.26 
 
 
428 aa  122  2e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0210145  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1045  head portal protein  27.86 
 
 
460 aa  120  4e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.326172  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1617  HK97 family phage portal protein  27.47 
 
 
426 aa  120  7e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.709388  normal  0.287703 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0862  phage portal protein, HK97 family  23.88 
 
 
389 aa  119  1e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  5.55494e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1682  phage phi-105 ORF25-like protein  26.84 
 
 
407 aa  117  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.844077 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4004  phage portal protein, HK97 family  26.83 
 
 
413 aa  115  2e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1586  HK97 family phage portal protein  25.75 
 
 
415 aa  113  7e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00170734  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2502  phage portal protein, HK97 family  26.92 
 
 
420 aa  111  2e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.160981  normal 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4251  phage portal protein, HK97 family  28.19 
 
 
544 aa  110  7e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3975  phage portal protein, HK97 family  27.55 
 
 
398 aa  109  9e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1457  phage portal protein, HK97 family  25.46 
 
 
417 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0625  phage portal protein, HK97 family  24.59 
 
 
413 aa  108  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2492  Phage portal protein, HK97  27.51 
 
 
395 aa  105  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2472  phage portal protein, HK97 family  25 
 
 
542 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5506  phage portal protein, HK97 family  25 
 
 
408 aa  104  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.709326  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4979  hypothetical protein  23.86 
 
 
436 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5358  hypothetical protein  23.86 
 
 
436 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1303  phage portal protein, HK97 family  28.41 
 
 
437 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1968  hypothetical protein  27.2 
 
 
435 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2238  phage portal protein, HK97 family  27.1 
 
 
389 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0330088  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3805  hypothetical protein  26.83 
 
 
404 aa  97.1  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4093  hypothetical protein  26.83 
 
 
389 aa  97.1  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2600  HK97 family phage portal protein  24.28 
 
 
408 aa  96.7  8e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0555  phage portal protein, HK97 family  24.32 
 
 
448 aa  95.9  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0158159  hitchhiker  0.0015106 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5463  hypothetical protein  23.3 
 
 
412 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2245  putative phage portal protein, HK97 family  25 
 
 
859 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  1.40812e-05 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5065  phage portal protein, HK97 family  27.37 
 
 
455 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2891  putative phage portal protein, HK97 family  24.93 
 
 
833 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  6.39413e-05 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1540  putative phage portal protein, HK97 family  24.93 
 
 
833 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.533039 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2236  HK97 family phage portal protein  26.5 
 
 
447 aa  94.7  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.759812  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2360  head HK97 family portal protein  24.78 
 
 
397 aa  94.4  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4078  phage portal protein, HK97 family  27.72 
 
 
457 aa  94  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333282  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2997  putative head portal protein  27.92 
 
 
408 aa  93.2  8e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.429219  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1648  hypothetical protein  25.21 
 
 
422 aa  92.8  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.117092  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4113  HK97 family phage portal protein  25 
 
 
455 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0243  HK97 family phage portal protein  24.94 
 
 
441 aa  90.5  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1898  HK97 family phage portal protein  25.28 
 
 
416 aa  87.8  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1080  HK97 family phage portal protein  23.42 
 
 
412 aa  87  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1060  HK97 family phage portal protein  23.42 
 
 
412 aa  87  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1717  Phage portal protein, HK97  25.81 
 
 
406 aa  85.5  2e-15  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2027  phage portal protein  24.93 
 
 
406 aa  83.2  9e-15  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0339  Phage portal protein, HK97  25.27 
 
 
407 aa  81.6  2e-14  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0482575  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1334  phage portal protein HK97 family  25.69 
 
 
400 aa  81.6  2e-14  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00597949  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0671  HK97 family phage portal protein  23.37 
 
 
372 aa  82  2e-14  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2959  phage portal protein, HK97 family  21.77 
 
 
415 aa  77.8  4e-13  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2611  phage portal protein, HK97 family  24.35 
 
 
454 aa  77  7e-13  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4284  phage portal protein, HK97 family  24.35 
 
 
454 aa  77  7e-13  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0858  phage lambdaBa02, DNA replication protein  23.59 
 
 
408 aa  75.9  1e-12  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4384  phage portal protein, HK97 family  24.22 
 
 
264 aa  73.6  7e-12  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>