32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2592 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2963  prophage LambdaSo, HK97 family major capsid protein  85.61 
 
 		 396 aa  674    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2592  phage major capsid protein, HK97 family  100 
 
 		 396 aa  813    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.339104 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1682  HK97 family phage major capsid protein  57.4 
 
 		 418 aa  435  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1600  phage major capsid protein, HK97 family  51.37 
 
 		 433 aa  378  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0649  Phage major capsid protein, HK97  48.11 
 
 		 465 aa  351  2e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296668  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4465  phage major capsid protein, HK97 family  45.8 
 
 		 405 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000706363 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1634  major head protein  47.59 
 
 		 405 aa  326  4.0000000000000003e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1668  phage major capsid protein, HK97  46.82 
 
 		 403 aa  325  7e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1567  HK97 family phage major capsid protein  47.12 
 
 		 414 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.944174  decreased coverage  0.0000690857 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1339  HK97 family phage major capsid protein  46.19 
 
 		 418 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.124448 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0362  HK97 family phage major capsid protein  42.89 
 
 		 449 aa  310  4e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0991  HK97 family phage major capsid protein  42.89 
 
 		 449 aa  310  4e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3318  HK97 family phage major capsid protein  40.25 
 
 		 433 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0235436 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2067  prophage LambdaSo, HK97 family major capsid protein  40.25 
 
 		 433 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.023752  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0642  phage major head protein  44.58 
 
 		 403 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3394  HK97 family phage major capsid protein  34.45 
 
 		 397 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000537798 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3579  phage major capsid protein, HK97  39.34 
 
 		 411 aa  168  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.978109  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0461  major phage capsid subunit precursor  29.72 
 
 		 417 aa  154  2e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.561977 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3943  HK97 family phage major capsid protein  33.81 
 
 		 400 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.204605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3892  hypothetical protein  27.5 
 
 		 421 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0353742 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2917  HK97 family phage prohead protease  25.94 
 
 		 579 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595306  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3892  putative phage head  26.97 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5467  hypothetical protein  29.31 
 
 		 386 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0861  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  25.77 
 
 		 403 aa  56.6  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1086  HK97 family phage major capsid protein  25.83 
 
 		 400 aa  52.8  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0277  HK97 family phage major capsid protein  26.85 
 
 		 385 aa  50.1  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1895  HK97 family phage major capsid protein  26.42 
 
 		 389 aa  50.1  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1359  HK97 family phage major capsid protein  28.84 
 
 		 385 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.308637 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  25.89 
 
 		 397 aa  45.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3867  HK97 family phage major capsid protein  25.55 
 
 		 425 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292858 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0627  phage major capsid protein, HK97 family  22.22 
 
 		 368 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  25.45 
 
 		 397 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>