163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2494 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2494  SirA family protein  100 
 
 		 77 aa  154  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.284005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1791  SirA family protein  100 
 
 		 77 aa  154  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1828  SirA family protein  100 
 
 		 77 aa  154  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.263187  normal  0.225214 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1784  SirA family protein  100 
 
 		 77 aa  154  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.832592  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1696  SirA family protein  79.22 
 
 		 77 aa  120  7e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1650  SirA family protein  74.03 
 
 		 77 aa  114  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2346  SirA family protein  72.73 
 
 		 77 aa  114  6e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.416048  decreased coverage  0.000000000487815 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2418  SirA family protein  74.03 
 
 		 77 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.753437  hitchhiker  0.000838905 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2868  hypothetical protein  68.42 
 
 		 77 aa  106  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2170  SirA family protein  59.72 
 
 		 73 aa  86.3  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44922  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1912  hypothetical protein  56.94 
 
 		 76 aa  84.7  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.862683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2436  SirA family protein  54.17 
 
 		 76 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00512226 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1972  SirA family protein  53.52 
 
 		 71 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1842  SirA family protein  50.68 
 
 		 73 aa  77  0.00000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.483322  normal  0.0895719 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1756  SirA family protein  52.05 
 
 		 73 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.807618  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1648  hypothetical protein  44.44 
 
 		 72 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.282998  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  32.35 
 
 		 75 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0648  SirA family protein  38.24 
 
 		 82 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.900816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1694  SirA family protein  42.31 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.304124  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  30.88 
 
 		 75 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  33.33 
 
 		 76 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  29.58 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2086  SirA family protein  38.71 
 
 		 81 aa  50.8  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204116  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  34.29 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  30.43 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0740  hypothetical protein  30.43 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0137112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0688  hypothetical protein  30.43 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.301237  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  30.43 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0778  hypothetical protein  30.43 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0872  hypothetical protein  30.43 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000063042 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4106  SirA family protein  37.93 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.185078  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1718  SirA family protein  40 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  30.43 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1968  SirA-like  40.35 
 
 		 82 aa  47.4  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000028775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  27.94 
 
 		 76 aa  47.8  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  30.43 
 
 		 75 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  34.48 
 
 		 76 aa  47.8  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2083  SirA family protein  32.35 
 
 		 79 aa  47  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  33.33 
 
 		 75 aa  47  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  33.33 
 
 		 75 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  33.33 
 
 		 75 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  33.33 
 
 		 75 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  30.43 
 
 		 75 aa  47  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  33.33 
 
 		 75 aa  47  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  27.94 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3614  SirA family protein  40.74 
 
 		 76 aa  46.2  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3117  hypothetical protein  39.22 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3129  SirA-like  31.43 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.445608  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2600  hypothetical protein  39.22 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2715  SirA family protein  39.22 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000196179 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2228  SirA family protein  39.22 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  27.94 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000689982  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3188  hypothetical protein  39.68 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.107398  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1571  hypothetical protein  36.99 
 
 		 74 aa  45.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000229644  normal  0.442778 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  33.33 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  33.33 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3940  redox protein regulator of disulfide bond formation-like protein  36.11 
 
 		 74 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00180546  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0920  hypothetical protein  35.19 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1839  hypothetical protein  35.19 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2640  hypothetical protein  35.19 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863392  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1873  SirA-like  30.99 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.265759  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1593  SirA family protein  35.19 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1453  hypothetical protein  35.19 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0429  hypothetical protein  35.19 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0594568  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1662  hypothetical protein  35.19 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0398143  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1684  hypothetical protein  35.19 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109756  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0734  hypothetical protein  35.19 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1982  hypothetical protein  26.23 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.948606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2377  SirA-like  36 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0972982  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  33.33 
 
 		 189 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  29.41 
 
 		 76 aa  45.1  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1138  SirA family protein  38.46 
 
 		 77 aa  45.1  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0574042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2542  SirA-like protein  32.2 
 
 		 81 aa  45.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000362525  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1094  Ferredoxin--nitrite reductase  30 
 
 		 796 aa  44.7  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.268202  normal  0.0850268 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1989  SirA family protein  40 
 
 		 75 aa  44.7  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000867317 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1189  SirA family protein  30 
 
 		 81 aa  44.3  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  32.65 
 
 		 77 aa  44.3  0.0005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  38 
 
 		 75 aa  43.9  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1367  SirA-like  27.54 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  35.19 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1028  SirA family protein  37.04 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.399081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1455  SirA family protein  26.76 
 
 		 74 aa  44.3  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.316855  normal  0.421643 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1352  hypothetical protein  33.8 
 
 		 74 aa  43.9  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1233  SirA family protein  32.69 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4185  SirA family protein  32.69 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1860  SirA family protein  30.88 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000771633  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1263  SirA family protein  32.69 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.600838  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  37.1 
 
 		 75 aa  43.9  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0354  SirA family protein  30.88 
 
 		 79 aa  43.9  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1743  hypothetical protein  42 
 
 		 78 aa  43.5  0.0009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2945  hypothetical protein  28.07 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.91003  hitchhiker  0.00000000000335476 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0440  SirA family protein  31.88 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.860171  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1628  SirA family protein  28.07 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.241969 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  29.41 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4280  SirA-like  34.62 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.277621  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2429  SirA-like  30.99 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  28.99 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1780  hypothetical protein  36 
 
 		 200 aa  43.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0463262  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2150  hypothetical protein  28.07 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2303  hypothetical protein  28.07 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>