80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2447 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2447  sortase family protein  100 
 
 
234 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00927712  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1844  sortase family protein  96.58 
 
 
234 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0536686  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1830  sortase family protein  96.58 
 
 
232 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.27273  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1878  sortase family protein  94.87 
 
 
234 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0907818  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2276  sortase family protein  73.56 
 
 
213 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0587007  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2199  sortase family protein  74.26 
 
 
229 aa  315  5e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1740  sortase family protein  79.6 
 
 
204 aa  307  8e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482207  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2409  sortase family protein  75.66 
 
 
197 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0892648  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2196  LPXTG-site transpeptidase family protein  71.14 
 
 
228 aa  290  1e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2491  sortase family protein  60.44 
 
 
206 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0534452  normal  0.504186 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1626  sortase family protein  53.3 
 
 
208 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2125  sortase family protein  54.69 
 
 
201 aa  218  5e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217102  normal  0.0810323 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2515  sortase family protein  52.22 
 
 
229 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.348325  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1794  sortase family protein  53.85 
 
 
266 aa  205  4e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.32656  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2002  sortase (surface protein transpeptidase)-like protein  51.37 
 
 
214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.030888  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0123  sortase (surface protein transpeptidase)-like  36.67 
 
 
244 aa  145  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.592516  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3923  sortase family protein  40.91 
 
 
238 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2294  sortase family protein  42.25 
 
 
199 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3683  sortase family protein  41.58 
 
 
195 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4847  sortase family protein  38.1 
 
 
202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0663  hypothetical protein  38.8 
 
 
188 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0826254 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1394  sortase family protein  37.1 
 
 
203 aa  125  7e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2151  sortase family protein  35.82 
 
 
196 aa  124  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50243  normal  0.211474 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1399  sortase family protein  36.81 
 
 
207 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00830118 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2999  sortase family protein  33.17 
 
 
257 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0632399  normal  0.545839 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5162  sortase family protein  33.71 
 
 
196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2739  sortase family protein  34.04 
 
 
239 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.686756  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1674  sortase family protein  36.26 
 
 
207 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5133  peptidase C60 sortase A and B  35.96 
 
 
193 aa  105  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3380  putative sortase family protein  34.1 
 
 
185 aa  101  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583724  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0149  sortase family protein  38.53 
 
 
205 aa  71.2  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0301  LPXTG-site transpeptidase family protein  35.48 
 
 
206 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4938  LPXTG-site transpeptidase family protein  34.41 
 
 
206 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5069  LPXTG-site transpeptidase family protein  30.83 
 
 
198 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3139  sortase family protein  33.61 
 
 
200 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.211754  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4708  LPXTG-site transpeptidase family protein  30.83 
 
 
206 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4317  fimbria associated protein  30.97 
 
 
223 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4547  sortase  30.83 
 
 
206 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4933  LPXTG-site transpeptidase family protein  30.83 
 
 
206 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4953  LPXTG-site transpeptidase family protein  30 
 
 
206 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4565  sortase  30 
 
 
206 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4647  sortase family protein  32.26 
 
 
206 aa  55.5  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3291  sortase family protein  29.6 
 
 
209 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  30.1 
 
 
197 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0129  lpxtg-site transpeptidase sortase family protein  30.09 
 
 
233 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000402223 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5808  fimbria-associated protein  30.09 
 
 
233 aa  53.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0157  fimbria-associated protein  30.09 
 
 
236 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000951258  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4970  LPXTG-site transpeptidase family protein  29.17 
 
 
206 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0056  sortase family protein  27.75 
 
 
556 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.761592 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1902  sortase family protein  40 
 
 
350 aa  50.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102426  normal  0.943943 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2116  sortase family protein  33.06 
 
 
269 aa  50.1  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2301  sortase family protein  27.18 
 
 
220 aa  49.7  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206988  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2615  sortase family protein  27.18 
 
 
225 aa  49.7  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.209279  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4642  sortase family protein  31.82 
 
 
302 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.068472  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0578  sortase family protein  26.18 
 
 
210 aa  47.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.276833  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0051  sortase family protein  31.06 
 
 
521 aa  46.2  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447645  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  29.52 
 
 
192 aa  46.2  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1613  sortase family protein  37.08 
 
 
354 aa  45.8  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4617  LPXTG-site transpeptidase family protein  25.65 
 
 
210 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0891302  normal  0.0210172 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0719  LPXTG-site transpeptidase family protein  25.65 
 
 
210 aa  45.1  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0743  LPXTG-site transpeptidase family protein  25.65 
 
 
210 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000196785 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0755  LPXTG-site transpeptidase family protein  25.65 
 
 
210 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817669  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0035  sortase family protein  30.91 
 
 
251 aa  44.7  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0815  LPXTG-site transpeptidase family protein  25.65 
 
 
210 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0400761  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4206  peptidase C60, sortase A and B  35.14 
 
 
218 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  29.52 
 
 
249 aa  45.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0567  peptidase C60 sortase A and B  33.77 
 
 
321 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2383  peptidase C60, sortase A and B  29.82 
 
 
262 aa  45.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.480623  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0599  sortase family protein  25.65 
 
 
210 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0252782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0598  sortase family protein  25.65 
 
 
210 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000660576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0654  LPXTG-site transpeptidase family protein  25.65 
 
 
210 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000454419  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6133  sortase family protein  25.23 
 
 
312 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24310  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  37 
 
 
344 aa  44.3  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4282  peptidase C60, sortase A and B  35.37 
 
 
375 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0813218 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0688  LPXTG-site transpeptidase family protein  25.65 
 
 
233 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0017  sortase family protein  30.77 
 
 
260 aa  43.5  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000184176 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0937  peptidase C60 sortase A and B  36.59 
 
 
384 aa  43.5  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1805  sortase family protein  24.81 
 
 
269 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1859  sortase family protein  24.81 
 
 
265 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13700  sortase (surface protein transpeptidase)  30.77 
 
 
226 aa  42.4  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.808415 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>