More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2363 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2363  P4 family phage/plasmid primase  100 
 
 		 900 aa  1886    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  32.48 
 
 		 717 aa  280  7e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2797  P4 family phage/plasmid primase  32.64 
 
 		 782 aa  278  3e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  32.08 
 
 		 717 aa  277  8e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  32.15 
 
 		 717 aa  276  1.0000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1367  P4 family phage/plasmid primase  33.4 
 
 		 524 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.357272  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3115  P4 family phage/plasmid primase  33.77 
 
 		 695 aa  245  3e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00327339  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  31.14 
 
 		 746 aa  235  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  31.14 
 
 		 746 aa  235  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  29.06 
 
 		 798 aa  228  3e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2199  P4 family phage/plasmid primase  30.22 
 
 		 554 aa  226  1e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  30 
 
 		 749 aa  217  7e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  33.82 
 
 		 755 aa  213  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  35.78 
 
 		 760 aa  212  3e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  29.3 
 
 		 738 aa  210  8e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  31.21 
 
 		 765 aa  210  9e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  34.49 
 
 		 759 aa  204  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4888  P4 family phage/plasmid primase  34.55 
 
 		 697 aa  203  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100684  normal  0.121248 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0490  phage/plasmid primase, P4 family  28.99 
 
 		 882 aa  202  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.958319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3437  hypothetical protein  31.05 
 
 		 462 aa  202  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3426  P4 family phage/plasmid primase  28.45 
 
 		 857 aa  202  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00902831  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1180  P4 family phage/plasmid primase  28.57 
 
 		 843 aa  191  5e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000898776  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1160  hypothetical protein  28.24 
 
 		 842 aa  190  1e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104949  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8782  hypothetical protein  30.22 
 
 		 482 aa  189  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242638  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0874  nucleoside triphosphatase, D5 family  30.39 
 
 		 774 aa  189  3e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1465  hypothetical protein  28.64 
 
 		 770 aa  182  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.237309  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1354  hypothetical protein  34.13 
 
 		 470 aa  182  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0809995  normal  0.479035 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1000  Phage/plasmid primase P4-like  27.09 
 
 		 723 aa  181  4.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.760681  hitchhiker  0.00622147 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6606  putative Phage / plasmid primase P4  26.32 
 
 		 624 aa  177  8e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1166  hypothetical protein  29.66 
 
 		 467 aa  174  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7040  hypothetical protein  33.82 
 
 		 450 aa  172  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.445259 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0353  P4 family phage/plasmid primase  25.59 
 
 		 613 aa  171  7e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.764732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0983  P4 family phage/plasmid primase  27.22 
 
 		 612 aa  169  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1974  hypothetical protein  28.6 
 
 		 485 aa  168  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0842  hypothetical protein  28.69 
 
 		 526 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464315  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1323  hypothetical protein  28.69 
 
 		 526 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  28.69 
 
 		 955 aa  164  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1475  phage DNA polymerase  27.14 
 
 		 788 aa  163  1e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3729  P4 family phage/plasmid primase  25.5 
 
 		 874 aa  161  6e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2662  Phage/plasmid primase P4-like protein  28.87 
 
 		 632 aa  161  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3780  P4 family phage/plasmid primase  25.5 
 
 		 874 aa  161  6e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0072  phage/plasmid DNA primase, putative  26.33 
 
 		 757 aa  157  6e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.612885  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5167  hypothetical protein  31.05 
 
 		 472 aa  154  8.999999999999999e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  26.72 
 
 		 725 aa  153  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2911  P4 family phage/plasmid primase  27.7 
 
 		 769 aa  140  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0135  hypothetical protein  35.92 
 
 		 479 aa  139  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5359  P4 family phage/plasmid primase  29.03 
 
 		 531 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00485157  hitchhiker  0.00000000000000190106 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0642  Phage or plasmid primase P4-like  25.99 
 
 		 540 aa  126  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0349968  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1052  plasmid/phage primase  27.71 
 
 		 828 aa  108  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0990831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3752  primase P4-like protein  26.24 
 
 		 799 aa  103  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0217  P4 family phage/plasmid primase  26.24 
 
 		 486 aa  101  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.01089  unclonable  0.0000111311 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3095  P4 family phage/plasmid primase  23.42 
 
 		 486 aa  97.4  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406256  normal  0.59304 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1224  DNA primase  25.83 
 
 		 564 aa  95.9  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.533717  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1684  hypothetical protein  23.08 
 
 		 606 aa  86.3  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521904  hitchhiker  0.00120785 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  28.23 
 
 		 613 aa  84.7  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1315  Phage/plasmid primase P4-like  22.74 
 
 		 771 aa  82  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0825  DNA primase  27.65 
 
 		 655 aa  81.3  0.00000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.263135  hitchhiker  0.0000451849 
 
 
-
 
NC_002936  DET0552  DNA primase  27.03 
 
 		 590 aa  80.9  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0527  DNA primase  27.79 
 
 		 588 aa  79.7  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_492  DNA primase  26.51 
 
 		 590 aa  79.7  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0123236  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0572  DNA primase  28.41 
 
 		 629 aa  79.3  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.26895  normal  0.474628 
 
 
-
 
NC_013749  Htur_5275  phage/plasmid primase, P4 family  24.79 
 
 		 1285 aa  77.8  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.413265  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  24.53 
 
 		 611 aa  76.3  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  24.8 
 
 		 588 aa  75.5  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07990  DNA primase, catalytic core  25.07 
 
 		 642 aa  75.1  0.000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.160485 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0819  phage DNA polymerase  24.91 
 
 		 501 aa  74.3  0.000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.020371  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  25.59 
 
 		 600 aa  74.3  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  25.19 
 
 		 604 aa  73.2  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  24.88 
 
 		 599 aa  73.2  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  24.16 
 
 		 600 aa  72.8  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  25.89 
 
 		 604 aa  72  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3149  phage/plasmid primase, P4 family  22.92 
 
 		 1061 aa  71.6  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1464  DNA primase  26.51 
 
 		 639 aa  70.5  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1734  P4 family phage/plasmid primase  23.39 
 
 		 624 aa  69.3  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3106  DNA primase  24.31 
 
 		 641 aa  68.9  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0861  DNA primase  24.91 
 
 		 609 aa  68.9  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0925176  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2739  DNA primase  24.5 
 
 		 641 aa  68.6  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7022  DNA primase  24.67 
 
 		 700 aa  68.6  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210771  normal  0.1359 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  24.8 
 
 		 571 aa  68.6  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  24.8 
 
 		 598 aa  68.2  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  24.8 
 
 		 598 aa  68.6  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  24.8 
 
 		 598 aa  68.6  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  24.8 
 
 		 598 aa  68.6  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  24.8 
 
 		 598 aa  68.2  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  24.8 
 
 		 598 aa  68.2  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1239  DNA primase  24.7 
 
 		 639 aa  67.8  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  25.82 
 
 		 626 aa  67.8  0.0000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3240  DNA primase  22.49 
 
 		 452 aa  67.8  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6776  DNA primase  27.91 
 
 		 627 aa  67.4  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  24.45 
 
 		 599 aa  67.4  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3034  DNA primase  24.43 
 
 		 619 aa  67  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.514313  normal  0.0365839 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  24.54 
 
 		 598 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0587  DNA primase  26.56 
 
 		 642 aa  67  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.356346  normal  0.0328717 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0799  DNA primase  23.2 
 
 		 579 aa  66.2  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.7446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  24.54 
 
 		 598 aa  66.6  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0533  phage DNA primase-like protein  23.48 
 
 		 636 aa  67  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0606801  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  24.22 
 
 		 601 aa  66.6  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0622  DNA primase  27.56 
 
 		 641 aa  65.9  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.156261 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  26.71 
 
 		 584 aa  65.9  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  24.88 
 
 		 684 aa  65.9  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>