More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2194 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 
124 aa  239  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 
124 aa  239  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  99.19 
 
 
124 aa  237  4e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  99.19 
 
 
124 aa  237  4e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  97.58 
 
 
124 aa  236  8e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  96.77 
 
 
124 aa  234  3e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  96.77 
 
 
124 aa  234  3e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  96.77 
 
 
124 aa  234  3e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  93.55 
 
 
124 aa  228  3e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  86.29 
 
 
124 aa  211  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  84.68 
 
 
124 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  83.06 
 
 
124 aa  209  7.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  80.65 
 
 
124 aa  204  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  79.84 
 
 
124 aa  203  6e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  72.58 
 
 
124 aa  183  5e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  76.42 
 
 
124 aa  173  6e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  53.91 
 
 
127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  55.74 
 
 
128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  50 
 
 
122 aa  105  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  47.83 
 
 
127 aa  103  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  48.33 
 
 
122 aa  102  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  48.65 
 
 
126 aa  101  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  46.96 
 
 
127 aa  99.4  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  45.69 
 
 
122 aa  99  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 
126 aa  99.4  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  46.15 
 
 
124 aa  98.6  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  46.96 
 
 
127 aa  97.8  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  43.22 
 
 
124 aa  97.8  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  50.42 
 
 
123 aa  97.8  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  46.15 
 
 
122 aa  97.1  8e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  47.86 
 
 
122 aa  96.7  9e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  44.8 
 
 
132 aa  96.7  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  45.3 
 
 
122 aa  95.9  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 
124 aa  94.7  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2756  camphor resistance protein CrcB  51.3 
 
 
133 aa  93.6  8e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  46.15 
 
 
128 aa  93.2  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 
124 aa  91.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  40.87 
 
 
126 aa  90.9  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  44.64 
 
 
124 aa  90.9  6e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  41.67 
 
 
121 aa  90.5  8e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  41.88 
 
 
140 aa  89  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  44.74 
 
 
134 aa  88.2  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  44.74 
 
 
134 aa  87.8  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  38.14 
 
 
124 aa  88.2  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  44.35 
 
 
137 aa  87  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 
124 aa  86.7  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  43.22 
 
 
131 aa  86.3  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  40.34 
 
 
122 aa  85.9  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2060  CrcB protein  50 
 
 
118 aa  84.7  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000119505  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  47.57 
 
 
228 aa  84.7  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  45.74 
 
 
126 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3635  camphor resistance protein CrcB  45.74 
 
 
126 aa  83.6  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  43.97 
 
 
124 aa  83.6  8e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  42.98 
 
 
127 aa  83.6  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3483  camphor resistance protein CrcB  46.81 
 
 
126 aa  83.6  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0423  CrcB protein  37.5 
 
 
123 aa  83.6  9e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  41.74 
 
 
128 aa  83.6  9e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  41.09 
 
 
133 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  42.5 
 
 
127 aa  82  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  42.5 
 
 
127 aa  82  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2292  CrcB protein  45.61 
 
 
117 aa  82  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0745  camphor resistance protein CrcB  46.15 
 
 
127 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311218  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0789  camphor resistance protein CrcB  46.15 
 
 
127 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136709  normal  0.909292 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  43.48 
 
 
132 aa  81.6  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0731  camphor resistance protein CrcB  46.15 
 
 
127 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0671  camphor resistance protein CrcB  46.15 
 
 
127 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00156465  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  41.8 
 
 
130 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0685  camphor resistance protein CrcB  46.15 
 
 
127 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  40.52 
 
 
129 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  46.73 
 
 
124 aa  81.3  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  43.75 
 
 
122 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 
127 aa  80.5  0.000000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5442  CrcB protein  39.02 
 
 
125 aa  80.5  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258176  normal  0.897038 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  43.43 
 
 
133 aa  80.5  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  43 
 
 
162 aa  79.7  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0812  camphor resistance protein CrcB  43 
 
 
123 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00673919  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1535  CrcB protein  40 
 
 
124 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235581  normal  0.972453 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 
125 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  40.91 
 
 
124 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  40.91 
 
 
124 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 
129 aa  78.2  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3001  CrcB protein  45.19 
 
 
127 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0511618  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  42.24 
 
 
119 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  41.38 
 
 
136 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1439  CrcB protein  41.88 
 
 
123 aa  77.8  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2285  camphor resistance CrcB protein  39.66 
 
 
125 aa  77.4  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0188123  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00594  camphor resistance protein CrcB  45.19 
 
 
127 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0676  camphor resistance protein CrcB  45.19 
 
 
127 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462452  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0649  camphor resistance protein CrcB  45.19 
 
 
127 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00715235  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0539  camphor resistance protein CrcB  45.19 
 
 
127 aa  77.4  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0713  camphor resistance protein CrcB  45.19 
 
 
127 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000937309  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0645  camphor resistance protein CrcB  45.19 
 
 
127 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119753  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00583  hypothetical protein  45.19 
 
 
127 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3020  camphor resistance protein CrcB  45.19 
 
 
127 aa  77.4  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00755665  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1007  CrcB protein  38.6 
 
 
126 aa  77  0.00000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.83695  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2182  CrcB protein  44.76 
 
 
139 aa  77  0.00000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  38.66 
 
 
123 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  39.42 
 
 
124 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  39.34 
 
 
126 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  39.47 
 
 
134 aa  76.3  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>