More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2167 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4516  ferric vibriobactin receptor  81.46 
 
 		 685 aa  1155    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3484  TonB-dependent receptor  98.98 
 
 		 685 aa  1379    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379022  hitchhiker  0.00105156 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0330  TonB-dependent receptor  82.77 
 
 		 685 aa  1170    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2167  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 685 aa  1391    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00521843  hitchhiker  0.00163603 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0621  TonB-dependent receptor  67.64 
 
 		 686 aa  983    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.119281  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3727  TonB-dependent receptor  80.44 
 
 		 685 aa  1164    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3798  TonB-dependent receptor  80.73 
 
 		 685 aa  1141    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3923  TonB-dependent receptor  81.02 
 
 		 685 aa  1143    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0343  TonB-dependent receptor plug  32.75 
 
 		 686 aa  301  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.926534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1803  ferric vibriobactin receptor  29.54 
 
 		 687 aa  261  4e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0977  TonB-dependent siderophore receptor  30.99 
 
 		 707 aa  260  6e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.138127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3007  TonB-dependent siderophore receptor  30.71 
 
 		 692 aa  252  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0304198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2312  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 		 719 aa  233  9e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00576546  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1801  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 694 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0471088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3671  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 705 aa  226  9e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3345  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 705 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3472  TonB-dependent receptor  29.97 
 
 		 705 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.280502  normal  0.0143409 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10200  putative TonB-dependent receptor protein  28.65 
 
 		 694 aa  223  9e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.965249 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2695  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 711 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.316002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3527  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 694 aa  222  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4087  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 694 aa  217  5e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3147  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 711 aa  216  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.116125  hitchhiker  0.00000946048 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2495  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 712 aa  207  7e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.237347 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2744  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 686 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.339912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7293  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 835 aa  169  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.607537  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 700 aa  134  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 764 aa  134  6.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 695 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 713 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  23.01 
 
 		 737 aa  122  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 690 aa  122  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 730 aa  120  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 690 aa  120  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 794 aa  120  7e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 747 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  34.17 
 
 		 776 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 779 aa  115  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 732 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4253  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 713 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.90601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2064  TonB-dependent receptor  23.08 
 
 		 697 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.969634  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  25.88 
 
 		 695 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 		 720 aa  112  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  22.72 
 
 		 728 aa  112  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2310  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 732 aa  111  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0299343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  23.27 
 
 		 702 aa  111  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0067  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 726 aa  109  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1526  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 733 aa  109  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208571  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 758 aa  109  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0779  TonB-dependent receptor  22.83 
 
 		 757 aa  107  8e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.756258  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 780 aa  106  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  23.42 
 
 		 802 aa  107  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1828  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 712 aa  105  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000226653  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1886  TonB-dependent receptor plug  24.8 
 
 		 729 aa  104  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270024  normal  0.821548 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2752  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 736 aa  104  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000933457  normal  0.355865 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1841  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 743 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000217461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1794  TonB-dependent receptor  23.29 
 
 		 744 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000583553  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  23.61 
 
 		 739 aa  103  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 851 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 		 704 aa  102  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1735  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 713 aa  102  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00374581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 853 aa  102  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  23.18 
 
 		 710 aa  102  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  22.86 
 
 		 703 aa  101  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1344  TonB-dependent receptor  23.41 
 
 		 687 aa  100  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0341297  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  21.94 
 
 		 749 aa  100  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0393  TonB-dependent receptor  22.87 
 
 		 670 aa  100  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.431607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  23.78 
 
 		 666 aa  99.8  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3405  outer membrane protein  23.73 
 
 		 714 aa  99.4  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.411389  normal  0.175669 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 738 aa  99.4  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1802  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 		 743 aa  97.8  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  23.16 
 
 		 758 aa  97.8  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  23.4 
 
 		 755 aa  97.8  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0007  TonB-dependent receptor  22.49 
 
 		 641 aa  97.4  8e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 743 aa  96.7  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0231  TonB-dependent siderophore receptor  25.1 
 
 		 771 aa  96.7  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0414  TonB-dependent receptor  21.81 
 
 		 783 aa  97.1  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  22.85 
 
 		 687 aa  96.7  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02805  TonB-dependent receptor  22.5 
 
 		 696 aa  95.1  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00354555  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  22.43 
 
 		 729 aa  95.5  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  21.78 
 
 		 771 aa  94.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 728 aa  94.4  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  33.47 
 
 		 896 aa  94.4  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  23.18 
 
 		 736 aa  93.2  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 		 758 aa  93.6  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2440  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 688 aa  93.2  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0489256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1458  TonB-dependent receptor  22.65 
 
 		 694 aa  92.4  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.552636  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  21.26 
 
 		 773 aa  92  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 		 784 aa  91.3  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 773 aa  91.3  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  21.86 
 
 		 773 aa  90.9  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0190  TonB-dependent receptor  23.42 
 
 		 710 aa  90.9  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  22.7 
 
 		 753 aa  90.1  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  22.95 
 
 		 715 aa  90.1  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  22.58 
 
 		 759 aa  90.5  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3466  TonB-dependent receptor  22.54 
 
 		 718 aa  90.5  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  22.15 
 
 		 722 aa  89  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  24.88 
 
 		 663 aa  88.2  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  24.88 
 
 		 663 aa  88.2  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2040  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 815 aa  88.2  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  24.88 
 
 		 663 aa  87.8  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>