More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2043 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_2041  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 
205 aa  415  1e-115  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  8.69116e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2420  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 
205 aa  415  1e-115  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  1.76513e-06  normal  0.0290514 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2043  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 
205 aa  415  1e-115  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  2.36908e-05  hitchhiker  6.23922e-08 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2304  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 
205 aa  415  1e-115  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00141893  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1938  Holliday junction DNA helicase RuvA  97.07 
 
 
205 aa  406  1e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00077844  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1956  Holliday junction DNA helicase RuvA  95.12 
 
 
205 aa  398  1e-110  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00381182  normal  0.897117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2077  Holliday junction DNA helicase RuvA  95.12 
 
 
205 aa  398  1e-110  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  4.33363e-05  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1901  Holliday junction DNA helicase RuvA  94.15 
 
 
205 aa  395  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  3.34634e-05  hitchhiker  0.000124168 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  93.66 
 
 
205 aa  393  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2033  Holliday junction DNA helicase RuvA  86.34 
 
 
205 aa  371  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00030841  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2076  Holliday junction DNA helicase RuvA  86.34 
 
 
205 aa  369  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.438835  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2181  Holliday junction DNA helicase RuvA  85.85 
 
 
205 aa  368  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.613402  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2572  Holliday junction DNA helicase RuvA  85.37 
 
 
205 aa  365  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0232474  hitchhiker  0.00151008 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2363  Holliday junction DNA helicase RuvA  81.95 
 
 
205 aa  356  1e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00132923  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1884  Holliday junction DNA helicase RuvA  83.9 
 
 
203 aa  350  7e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.425804  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1840  Holliday junction DNA helicase RuvA  80.98 
 
 
205 aa  345  4e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.175833 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01600  Holliday junction DNA helicase RuvA  64.59 
 
 
223 aa  265  4e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003923  holliday junction DNA helicase RuvA  64.42 
 
 
203 aa  265  5e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00197305  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0718  Holliday junction DNA helicase RuvA  59.9 
 
 
207 aa  263  1e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2945  Holliday junction DNA helicase RuvA  62.2 
 
 
209 aa  258  3e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.016551  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1437  Holliday junction DNA helicase RuvA  61.24 
 
 
204 aa  258  4e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.46819e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1954  Holliday junction DNA helicase RuvA  60.49 
 
 
203 aa  250  9e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.165373  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1771  Holliday junction DNA helicase RuvA  60.49 
 
 
203 aa  250  9e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0290161  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1888  Holliday junction DNA helicase RuvA  61.65 
 
 
206 aa  250  1e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.949715  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01820  hypothetical protein  60.49 
 
 
203 aa  249  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.22815  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01832  Holliday junction DNA helicase motor protein  60.49 
 
 
203 aa  249  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.263475  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2421  Holliday junction DNA helicase RuvA  60.98 
 
 
204 aa  248  3e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0480934  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2144  Holliday junction DNA helicase RuvA  60.98 
 
 
204 aa  248  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0379489  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2597  Holliday junction DNA helicase RuvA  60 
 
 
203 aa  248  3e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0957  Holliday junction DNA helicase RuvA  60 
 
 
203 aa  248  3e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00202612  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1779  Holliday junction DNA helicase RuvA  60 
 
 
203 aa  248  3e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00140889  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1325  Holliday junction DNA helicase RuvA  60 
 
 
203 aa  248  3e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2091  Holliday junction DNA helicase RuvA  60 
 
 
203 aa  248  3e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000143296  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2031  Holliday junction DNA helicase RuvA  60.98 
 
 
204 aa  248  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.38953e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2116  Holliday junction DNA helicase RuvA  60.19 
 
 
211 aa  248  4e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02691  Holliday junction DNA helicase motor protein  57.87 
 
 
206 aa  246  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  9.21844e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1229  Holliday junction DNA helicase RuvA  59.02 
 
 
203 aa  242  2e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0100145  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1353  Holliday junction DNA helicase RuvA  59.02 
 
 
203 aa  242  2e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  hitchhiker  0.00521266 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2109  Holliday junction DNA helicase RuvA  59.02 
 
 
203 aa  242  2e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.434147  normal  0.12473 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2054  Holliday junction DNA helicase RuvA  59.02 
 
 
203 aa  242  2e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  58.05 
 
 
203 aa  241  6e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0285195  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2049  Holliday junction DNA helicase RuvA  58.54 
 
 
203 aa  240  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774525  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0269  Holliday junction DNA helicase RuvA  56.67 
 
 
204 aa  234  5e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1819  Holliday junction DNA helicase RuvA  58.05 
 
 
205 aa  229  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.180722  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  57.21 
 
 
205 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2255  Holliday junction DNA helicase RuvA  57.07 
 
 
205 aa  228  3e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2103  Holliday junction DNA helicase RuvA  58.05 
 
 
205 aa  228  5e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  55.07 
 
 
202 aa  227  8e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  56.04 
 
 
205 aa  227  9e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  56.04 
 
 
205 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  56.04 
 
 
205 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  57.07 
 
 
202 aa  225  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  56.59 
 
 
202 aa  225  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1271  Holliday junction DNA helicase RuvA  55.39 
 
 
202 aa  224  6e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0682991  normal  0.630495 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4542  Holliday junction DNA helicase RuvA  54.63 
 
 
201 aa  224  7e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51790  Holliday junction DNA helicase RuvA  54.63 
 
 
201 aa  224  7e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  4.65402e-05 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2777  Holliday junction DNA helicase RuvA  60 
 
 
203 aa  223  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115521  normal  0.0296247 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2146  Holliday junction DNA helicase RuvA  56.67 
 
 
204 aa  221  8e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.233451  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2235  Holliday junction DNA helicase RuvA  54.63 
 
 
201 aa  214  5e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1705  Holliday junction DNA helicase RuvA  51.64 
 
 
209 aa  210  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.275173  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1754  Holliday junction DNA helicase RuvA  52.2 
 
 
200 aa  210  1e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000623811  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0420  Holliday junction DNA helicase RuvA  52.2 
 
 
200 aa  210  1e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0139  Holliday junction DNA helicase RuvA  51.71 
 
 
199 aa  208  4e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2534  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  51.9 
 
 
207 aa  206  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.416621  normal  0.292409 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36700  Holliday junction DNA helicase RuvA  52.45 
 
 
204 aa  206  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2189  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.32 
 
 
200 aa  204  6e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000251944  normal  0.355786 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1847  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  53.4 
 
 
206 aa  203  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0445343  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0313  Holliday junction DNA helicase RuvA  50.73 
 
 
196 aa  204  1e-51  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.178792  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2494  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.8 
 
 
208 aa  201  4e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1222  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.79 
 
 
201 aa  195  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.550433  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0893  Holliday junction DNA helicase RuvA  49.52 
 
 
200 aa  187  1e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000557116  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0530  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.85 
 
 
206 aa  186  3e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2212  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.33 
 
 
204 aa  180  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.33 
 
 
199 aa  179  3e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.33 
 
 
199 aa  179  3e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01557  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.06 
 
 
194 aa  175  5e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214116  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3126  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.9 
 
 
197 aa  173  2e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.735644  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4062  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.08 
 
 
192 aa  170  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1226  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.03 
 
 
190 aa  169  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0061  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.18 
 
 
193 aa  167  7e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2720  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.45 
 
 
197 aa  167  7e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0062  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.18 
 
 
193 aa  167  7e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.23532  normal  0.677868 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0684  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.67 
 
 
207 aa  167  9e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.801169  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1061  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.46 
 
 
194 aa  166  2e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0709  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.76 
 
 
207 aa  166  3e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0528487  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3236  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.06 
 
 
192 aa  165  4e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2353  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.24 
 
 
194 aa  164  8e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.547794 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0942  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.95 
 
 
194 aa  164  9e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4068  Holliday junction DNA helicase RuvA  49.14 
 
 
191 aa  162  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.851819 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4665  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.1 
 
 
190 aa  162  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3831  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.2 
 
 
200 aa  157  9e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0181  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.26 
 
 
202 aa  154  7e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.595877  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4725  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.38 
 
 
202 aa  154  9e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4240  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.61 
 
 
190 aa  153  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.215143 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3953  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.9 
 
 
191 aa  152  3e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0761943 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0510  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.12 
 
 
192 aa  152  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3345  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.67 
 
 
193 aa  151  6e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238137 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0484  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.22 
 
 
193 aa  150  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0616  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.18 
 
 
193 aa  150  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2213  DNA recombination protein, RuvA  38.24 
 
 
191 aa  150  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0140161 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>