22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2018 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2018  hypothetical protein  100 
 
 
271 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00140757  hitchhiker  0.00602396 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2328  hypothetical protein  95.2 
 
 
267 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2444  hypothetical protein  92.62 
 
 
263 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2328  hypothetical protein  90.41 
 
 
255 aa  488  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.645597  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1916  hypothetical protein  55.56 
 
 
245 aa  285  4e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2449  hypothetical protein  57.46 
 
 
251 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2101  hypothetical protein  52.4 
 
 
280 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.102691  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1932  hypothetical protein  51.71 
 
 
274 aa  271  7e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.482923  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1877  hypothetical protein  51.88 
 
 
280 aa  266  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.591711  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1357  hypothetical protein  47.21 
 
 
239 aa  229  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2945  hypothetical protein  49.23 
 
 
245 aa  228  5e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2668  hypothetical protein  41.54 
 
 
242 aa  196  4.0000000000000005e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1400  hypothetical protein  41.53 
 
 
234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2403  hypothetical protein  41.42 
 
 
283 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2722  hypothetical protein  41.73 
 
 
235 aa  189  4e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0155766  hitchhiker  0.000528217 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1811  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  43.68 
 
 
235 aa  189  5.999999999999999e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.183017 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0340  hypothetical protein  42.39 
 
 
217 aa  180  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0562312  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0578  hypothetical protein  39.22 
 
 
241 aa  163  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1557  hypothetical protein  27.76 
 
 
264 aa  68.2  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.275394  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0997  SAM-dependent methyltransferase  28.95 
 
 
231 aa  48.9  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219057  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1316  hypothetical protein  23.86 
 
 
234 aa  48.5  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00516293  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0357  hypothetical protein  26.46 
 
 
221 aa  42.7  0.007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.298514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>