More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2014 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2449  hypothetical protein  99.7 
 
 
335 aa  693    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.861715  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2014  hypothetical protein  100 
 
 
335 aa  694    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00622676 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2332  hypothetical protein  99.4 
 
 
335 aa  691    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.946528  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2332  hypothetical protein  99.7 
 
 
335 aa  693    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.97863  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1912  hypothetical protein  94.04 
 
 
321 aa  629  1e-179  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2105  hypothetical protein  87.46 
 
 
335 aa  617  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1873  hypothetical protein  86.87 
 
 
335 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2451  hypothetical protein  86.27 
 
 
380 aa  610  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0704  hypothetical protein  76.05 
 
 
363 aa  548  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3286  hypothetical protein  75.82 
 
 
335 aa  546  1e-154  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3633  hypothetical protein  76.42 
 
 
350 aa  546  1e-154  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4260  hypothetical protein  74.03 
 
 
335 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00951955 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3595  hypothetical protein  74.25 
 
 
335 aa  533  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.222828  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3324  hypothetical protein  71.94 
 
 
353 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3598  hypothetical protein  51.92 
 
 
338 aa  333  3e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0070  hypothetical protein  51.41 
 
 
338 aa  331  1e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4815  hypothetical protein  49.11 
 
 
338 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195224  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4481  hypothetical protein  50 
 
 
338 aa  322  6e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4172  hypothetical protein  49.4 
 
 
338 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1491  hypothetical protein  35.23 
 
 
308 aa  124  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000879827  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1686  hypothetical protein  32.73 
 
 
305 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000452263  normal  0.0252505 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003801  methyltransferase  29.34 
 
 
310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2919  hypothetical protein  33.09 
 
 
303 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2359  hypothetical protein  31.9 
 
 
305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02689  methyltransferase  28.14 
 
 
310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2777  hypothetical protein  32.73 
 
 
305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00142049  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2680  hypothetical protein  32.73 
 
 
305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00757466  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1701  hypothetical protein  30.41 
 
 
302 aa  110  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000328328  normal  0.027964 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1143  hypothetical protein  31.03 
 
 
321 aa  110  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1214  hypothetical protein  28.08 
 
 
309 aa  109  6e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2701  hypothetical protein  32.36 
 
 
305 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000560458  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1551  hypothetical protein  33.09 
 
 
303 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0147626  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2890  hypothetical protein  32.95 
 
 
302 aa  107  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0038147  hitchhiker  0.00000713173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1545  hypothetical protein  33.82 
 
 
303 aa  107  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013291  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1486  hypothetical protein  33.93 
 
 
303 aa  105  7e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000118993  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2337  hypothetical protein  31.7 
 
 
320 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.166557  normal  0.623791 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2005  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  27.94 
 
 
701 aa  104  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.391349  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  30.9 
 
 
393 aa  103  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4665  hypothetical protein  24.78 
 
 
399 aa  103  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1464  hypothetical protein  27.86 
 
 
394 aa  103  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.926164  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1918  hypothetical protein  29.33 
 
 
318 aa  103  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  0.204639 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4650  hypothetical protein  24.48 
 
 
399 aa  103  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  30.22 
 
 
393 aa  101  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2745  putative RNA methylase  31.14 
 
 
426 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4368  PUA domain-containing protein  24.19 
 
 
399 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2385  hypothetical protein  30.66 
 
 
304 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000477017  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  27.41 
 
 
391 aa  101  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02010  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.82 
 
 
699 aa  100  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.347097  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2556  hypothetical protein  31.58 
 
 
302 aa  101  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3144  hypothetical protein  30.63 
 
 
402 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03498  oxidoreductase  29.32 
 
 
364 aa  100  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.906105  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0587  hypothetical protein  24.19 
 
 
399 aa  100  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4653  hypothetical protein  24.19 
 
 
399 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  27.83 
 
 
394 aa  100  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4274  methyltransferase  24.19 
 
 
399 aa  99.8  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.314948  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4285  methyltransferase  24.19 
 
 
399 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4666  hypothetical protein  24.19 
 
 
399 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1342  protein of unknown function Met10  26.19 
 
 
390 aa  100  5e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.425757  hitchhiker  0.0000000474621 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4435  hypothetical protein  23.89 
 
 
399 aa  99.8  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4780  hypothetical protein  23.89 
 
 
399 aa  99.8  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1666  hypothetical protein  30.77 
 
 
303 aa  99.8  6e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000201275  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  25.66 
 
 
389 aa  99.4  9e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2397  hypothetical protein  28.39 
 
 
305 aa  98.6  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00356323  normal  0.487755 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  31.01 
 
 
393 aa  99  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1865  hypothetical protein  32.13 
 
 
389 aa  99  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5127  hypothetical protein  29.56 
 
 
398 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.775226  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1049  hypothetical protein  30.45 
 
 
399 aa  98.2  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157301  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3530  hypothetical protein  32.74 
 
 
313 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.524505  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  28.35 
 
 
392 aa  97.1  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1849  methyltransferase small  33.04 
 
 
398 aa  97.1  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  29.39 
 
 
397 aa  96.7  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5177  hypothetical protein  29.56 
 
 
398 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5001  hypothetical protein  29.56 
 
 
398 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.397476  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2527  hypothetical protein  30.45 
 
 
320 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3236  PUA domain-containing protein  22.59 
 
 
399 aa  96.3  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.553903  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3577  SAM-dependent methyltransferase-like protein  30.97 
 
 
308 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.586441 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0338  hypothetical protein  30.63 
 
 
398 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1462  hypothetical protein  31.5 
 
 
318 aa  95.9  8e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.685404  normal  0.241812 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  29.5 
 
 
396 aa  95.9  9e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11313  hypothetical protein  25.53 
 
 
411 aa  95.9  9e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.493787  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41962  predicted protein  26.26 
 
 
493 aa  95.9  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0487312 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02370  methyltransferase  28.26 
 
 
397 aa  95.5  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3930  protein of unknown function Met10  28.04 
 
 
479 aa  95.5  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1761  oxidoreductase  28.82 
 
 
389 aa  95.5  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04640  hypothetical protein  32.68 
 
 
398 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03350  SAM-dependent methyltransferase  29.57 
 
 
397 aa  95.1  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  26.81 
 
 
391 aa  94  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  26.81 
 
 
396 aa  94  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3872  hypothetical protein  28.66 
 
 
308 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  26.81 
 
 
396 aa  94  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  26.81 
 
 
396 aa  94  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  26.81 
 
 
396 aa  94  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1828  hypothetical protein  28.47 
 
 
389 aa  94  3e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.929329  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0447  hypothetical protein  32.3 
 
 
398 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.368535  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00971  predicted methyltransferase  26.81 
 
 
367 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  31.42 
 
 
394 aa  93.6  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4764  hypothetical protein  28.63 
 
 
398 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.095661 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00978  hypothetical protein  26.81 
 
 
367 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.536136  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  30.95 
 
 
397 aa  93.6  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003408  hypothetical protein  28.36 
 
 
397 aa  93.6  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000270562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>