71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2011 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_1874  major facilitator transporter  75.14 
 
 
524 aa  795    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322942  normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2347  major facilitator transporter  99.09 
 
 
551 aa  1116    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1657  major facilitator transporter  70.29 
 
 
518 aa  731    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2458  transporter, putative  86.83 
 
 
529 aa  929    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2336  major facilitator transporter  99.82 
 
 
551 aa  1120    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1925  major facilitator transporter  84.92 
 
 
531 aa  914    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2452  major facilitator transporter  100 
 
 
551 aa  1123    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2011  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
551 aa  1123    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000990966  hitchhiker  0.000202625 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2202  major facilitator transporter  72.69 
 
 
551 aa  807    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000401875 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1776  major facilitator transporter  77.93 
 
 
519 aa  813    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0516559  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2003  major facilitator transporter  75 
 
 
530 aa  787    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2108  major facilitator transporter  85.11 
 
 
531 aa  912    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1870  major facilitator transporter  85.11 
 
 
531 aa  912    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2187  major facilitator transporter  59.96 
 
 
502 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1403  major facilitator transporter  58.5 
 
 
505 aa  597  1e-169  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206645  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0599  transporter, putative  61.88 
 
 
501 aa  595  1e-169  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870524  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05075  putative sugar transporter  57.46 
 
 
507 aa  585  1e-166  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0544446  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1021  major facilitator superfamily MFS_1  60.96 
 
 
495 aa  563  1.0000000000000001e-159  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1015  major facilitator transporter  54.4 
 
 
502 aa  538  1e-151  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2738  major facilitator transporter  53.11 
 
 
510 aa  526  1e-148  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.934726  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4087  major facilitator transporter  58.85 
 
 
514 aa  521  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1886  major facilitator transporter  51.15 
 
 
501 aa  482  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.156331  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0596  major facilitator transporter  49.08 
 
 
500 aa  431  1e-119  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.377823  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0975  hypothetical protein  39.4 
 
 
498 aa  390  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.798408  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1089  major facilitator superfamily MFS_1  37.17 
 
 
509 aa  331  3e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01889  sugar transporter  36.23 
 
 
493 aa  304  2.0000000000000002e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.660327  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1500  major facilitator transporter  50.71 
 
 
448 aa  271  2e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.21091 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5086  major facilitator superfamily MFS_1  51.16 
 
 
457 aa  266  5.999999999999999e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0501179  normal  0.911731 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0864  major facilitator transporter  51.15 
 
 
441 aa  254  3e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01240  sugar transporter  34.02 
 
 
428 aa  247  4.9999999999999997e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.686511  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0994  major facilitator superfamily permease  31.69 
 
 
450 aa  240  4e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.211502  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3953  major facilitator superfamily MFS_1  40.85 
 
 
457 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0053  major facilitator transporter  40.25 
 
 
449 aa  175  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000090495  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1877  major facilitator transporter  37.64 
 
 
458 aa  172  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0893  major facilitator superfamily permease  33.33 
 
 
450 aa  171  2e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2441  transporter, putative  39.53 
 
 
453 aa  169  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0973262  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0041  major facilitator superfamily permease  31.48 
 
 
471 aa  168  2e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000141077  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0898  major facilitator superfamily permease  33.82 
 
 
454 aa  168  2.9999999999999998e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1614  major facilitator transporter  37.39 
 
 
448 aa  164  3e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000115723  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0087  major facilitator transporter  35.9 
 
 
457 aa  161  3e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000315537  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0832  major facilitator superfamily permease  39.66 
 
 
453 aa  159  1e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000561592  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0084  major facilitator transporter  34.54 
 
 
461 aa  154  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380135  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02413  sugar transporter  40.3 
 
 
443 aa  153  5.9999999999999996e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01510  conserved hypothetical protein  31.13 
 
 
459 aa  77  0.0000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02289  sucrose transporter, putative (Eurofung)  26.9 
 
 
635 aa  72.4  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1599  major facilitator transporter  26.49 
 
 
421 aa  62.4  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2049  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  27.32 
 
 
469 aa  59.7  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0200  major facilitator superfamily MFS_1  23.68 
 
 
415 aa  58.2  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0454  major facilitator superfamily MFS_1  30.97 
 
 
404 aa  57  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0523  major facilitator transporter  32.59 
 
 
416 aa  55.1  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02710  Major Facilitator Superfamily transporter  23.86 
 
 
428 aa  53.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199882  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2885  major facilitator transporter  23.58 
 
 
432 aa  52.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00035649  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0034  major facilitator superfamily MFS_1  31.73 
 
 
435 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  23.31 
 
 
411 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0575  major facilitator transporter  29.1 
 
 
461 aa  48.9  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1406  major facilitator transporter  24.16 
 
 
401 aa  48.5  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000773977  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0846  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  26.83 
 
 
416 aa  48.1  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0353  major facilitator transporter  27.27 
 
 
464 aa  48.1  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.939472  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1610  major facilitator transporter  27 
 
 
404 aa  47  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  26.75 
 
 
411 aa  47.4  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01690  conserved hypothetical protein  21.12 
 
 
674 aa  46.6  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.887535  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0805  major facilitator family transporter  26.11 
 
 
417 aa  46.6  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.03228  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0269  major facilitator transporter  25.93 
 
 
506 aa  46.6  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41542  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0290  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.44 
 
 
472 aa  46.6  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000222424  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0248  major facilitator transporter  34.85 
 
 
486 aa  46.2  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.135747  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0427  major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 
426 aa  46.2  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0729  major facilitator transporter  27.07 
 
 
420 aa  46.2  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.463384  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3554  major facilitator transporter  30.85 
 
 
423 aa  44.3  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2052  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.98 
 
 
471 aa  44.3  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  29.7 
 
 
471 aa  43.9  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2622  sugar transporter, glycoside-pentoside-hexuronide  36.92 
 
 
479 aa  43.5  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>