More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2005 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_2353  DNA-directed DNA polymerase  99.29 
 
 
424 aa  879    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2458  DNA-directed DNA polymerase  99.29 
 
 
424 aa  881    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2342  DNA-directed DNA polymerase  99.06 
 
 
424 aa  878    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2005  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 
424 aa  883    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000515421 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1982  DNA-directed DNA polymerase  56.9 
 
 
423 aa  518  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.84718  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1908  DNA-directed DNA polymerase  56.43 
 
 
420 aa  478  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2158  DNA polymerase V subunit UmuC  54.74 
 
 
422 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.512063  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2162  DNA polymerase V subunit UmuC  54.98 
 
 
422 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.229342 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2212  DNA polymerase V subunit UmuC  54.98 
 
 
422 aa  472  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0650836 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2606  DNA-directed DNA polymerase  55.64 
 
 
422 aa  474  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.4458 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2215  DNA polymerase V subunit UmuC  54.74 
 
 
422 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69246  normal  0.844364 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01159  DNA polymerase V subunit UmuC  55.21 
 
 
422 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000022565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2464  DNA-directed DNA polymerase  55.21 
 
 
422 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050901  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1287  DNA polymerase V subunit UmuC  55.21 
 
 
422 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000534988  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2441  DNA polymerase V subunit UmuC  55.21 
 
 
422 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000365295  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01169  hypothetical protein  55.21 
 
 
422 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000148835  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1965  DNA polymerase V subunit UmuC  55.45 
 
 
422 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000119892  normal  0.867639 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1329  DNA polymerase V subunit UmuC  55.21 
 
 
422 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024147  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1671  DNA polymerase V subunit UmuC  54.98 
 
 
422 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0525212  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0002  DNA polymerase V subunit UmuC  52.13 
 
 
423 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0036  DNA polymerase V subunit UmuC  51.66 
 
 
424 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0503759 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4000  DNA-directed DNA polymerase  50.83 
 
 
430 aa  424  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0053  mutagenesis and repair protein MucB  49.16 
 
 
421 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000259717  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2106  DNA-directed DNA polymerase  49.29 
 
 
421 aa  405  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1279  DNA-directed DNA polymerase  49.17 
 
 
423 aa  402  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1751  umuC protein  47.98 
 
 
427 aa  364  1e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0886  DNA-directed DNA polymerase  50 
 
 
439 aa  362  5.0000000000000005e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2761  DNA-directed DNA polymerase  45.86 
 
 
426 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0282343 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5030  DNA-directed DNA polymerase  46.32 
 
 
426 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2745  DNA-directed DNA polymerase  46.21 
 
 
424 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1425  DNA-directed DNA polymerase  45.31 
 
 
426 aa  348  9e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0055  hypothetical protein  42.72 
 
 
425 aa  346  4e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.352875  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0705  DNA-directed DNA polymerase  41.61 
 
 
450 aa  344  1e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2950  DNA-directed DNA polymerase  46.21 
 
 
424 aa  344  1e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1668  hypothetical protein  43.84 
 
 
418 aa  342  8e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1040  hypothetical protein  42.55 
 
 
425 aa  340  2e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1005  hypothetical protein  42.55 
 
 
425 aa  340  2e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4341  DNA-directed DNA polymerase  44.47 
 
 
432 aa  340  2e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1662  hypothetical protein  43.84 
 
 
418 aa  340  2.9999999999999998e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2378  DNA-directed DNA polymerase  42.89 
 
 
425 aa  340  2.9999999999999998e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1369  DNA-directed DNA polymerase  41.81 
 
 
426 aa  335  9e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.772919  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1550  DNA-directed DNA polymerase  43.1 
 
 
418 aa  333  3e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0477659 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1369  DNA-directed DNA polymerase  41.08 
 
 
426 aa  328  8e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0052  DNA-directed DNA polymerase  41.5 
 
 
449 aa  326  5e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154189 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1434  DNA-directed DNA polymerase  43.62 
 
 
497 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0012  SOS mutagenesis protein RulB  42.18 
 
 
418 aa  319  5e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374057  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3752  DNA-directed DNA polymerase  41.81 
 
 
420 aa  318  7.999999999999999e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0459  DNA-directed DNA polymerase  45.63 
 
 
423 aa  318  1e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.204967  normal  0.799613 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1031  DNA-directed DNA polymerase  42.14 
 
 
426 aa  318  1e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0759  DNA-directed DNA polymerase  40.33 
 
 
423 aa  316  5e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4414  DNA-repair protein  41.94 
 
 
418 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000291737  decreased coverage  0.00359939 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1178  DNA-directed DNA polymerase  42.12 
 
 
424 aa  315  9.999999999999999e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0736762  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4598  DNA-repair protein  41.94 
 
 
418 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000181511  normal 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4570  DNA-repair protein  41.94 
 
 
418 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0175  DNA-directed DNA polymerase  42.42 
 
 
423 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2200  DNA-directed DNA polymerase  44.08 
 
 
424 aa  313  3.9999999999999997e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0920  DNA-directed DNA polymerase  40.71 
 
 
423 aa  310  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.21788  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2171  DNA-directed DNA polymerase  41.82 
 
 
417 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08269  DNA-directed DNA polymerase  40.38 
 
 
418 aa  310  2.9999999999999997e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1966  DNA-directed DNA polymerase  39.1 
 
 
446 aa  309  6.999999999999999e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.577995  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0859  DNA-directed DNA polymerase  39.33 
 
 
450 aa  306  3e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2973  DNA-directed DNA polymerase  41.72 
 
 
492 aa  306  6e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0296388  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3536  DNA-repair protein  42.55 
 
 
418 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10658  putative RumB/ImpB like DNA repair protein  39.39 
 
 
422 aa  304  2.0000000000000002e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2605  DNA-directed DNA polymerase  39.81 
 
 
418 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.733552  normal  0.0235112 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7046  UMUC domain protein DNA-repair protein  40.47 
 
 
442 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1832  DNA-repair protein  41.88 
 
 
418 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.375325 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6848  DNA-directed DNA polymerase  39.58 
 
 
422 aa  303  4.0000000000000003e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.615058  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1964  DNA-directed DNA polymerase  40.05 
 
 
418 aa  302  7.000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3235  DNA-directed DNA polymerase  39.1 
 
 
418 aa  302  8.000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0898  DNA-directed DNA polymerase  40.28 
 
 
437 aa  302  9e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.694521 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3210  DNA-directed DNA polymerase  40.05 
 
 
418 aa  301  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000012227 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2196  DNA-directed DNA polymerase  40.66 
 
 
418 aa  300  3e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1492  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  37.77 
 
 
420 aa  297  2e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00564635  decreased coverage  0.000128837 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2344  DNA-directed DNA polymerase  37.97 
 
 
421 aa  295  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1200  DNA-directed DNA polymerase  42.18 
 
 
432 aa  294  2e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3453  DNA-directed DNA polymerase  38.39 
 
 
418 aa  291  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00650413  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1292  DNA-directed DNA polymerase  39.9 
 
 
424 aa  290  4e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.355097  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0315  DNA-directed DNA polymerase  39.81 
 
 
443 aa  289  6e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.639091 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3553  DNA-directed DNA polymerase  39.81 
 
 
418 aa  289  8e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6255  DNA-directed DNA polymerase  39.72 
 
 
442 aa  289  8e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.983679 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07071  putative UmuC protein  39.48 
 
 
422 aa  289  8e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.109713 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4983  UMUC-like DNA-repair protein  41.01 
 
 
432 aa  287  2.9999999999999996e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000315583 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3517  DNA-directed DNA polymerase  39.76 
 
 
478 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4321  DNA-directed DNA polymerase  40.19 
 
 
428 aa  286  7e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.466657 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2682  umuC protein  36.97 
 
 
418 aa  285  9e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.261647  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3075  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  39.48 
 
 
419 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0220  DNA-directed DNA polymerase  42.33 
 
 
436 aa  282  8.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1335  DNA-directed DNA polymerase  40.24 
 
 
419 aa  281  1e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3841  DNA-directed DNA polymerase  41.61 
 
 
437 aa  279  8e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2040  DNA-directed DNA polymerase  40 
 
 
418 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.939043  normal  0.0886472 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4498  DNA-directed DNA polymerase  41.27 
 
 
426 aa  278  1e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15961  putative UmuC protein  39.29 
 
 
424 aa  277  3e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4407  DNA-directed DNA polymerase  39.76 
 
 
418 aa  276  5e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4268  DNA-directed DNA polymerase  39.76 
 
 
418 aa  276  5e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2195  DNA-directed DNA polymerase  36.49 
 
 
417 aa  275  8e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.147122  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2466  DNA-repair protein  39.86 
 
 
417 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0312138  normal  0.965014 
 
 
-
 
NC_002950  PG1338  umuC protein  35.41 
 
 
432 aa  274  3e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09231  putative UmuC protein  34.92 
 
 
428 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.986725  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1636  umuC protein  34.69 
 
 
417 aa  263  6e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>