85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1988 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_2371  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  292  1e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  5.4432e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2358  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  292  1e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000446127  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1988  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  292  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  8.1199e-09  hitchhiker  7.73885e-10 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2474  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  292  1e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  2.41237e-08  normal  0.0265077 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1643  hypothetical protein  66.18 
 
 
137 aa  180  5e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00917227  normal  0.51587 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0342  hypothetical protein  50.74 
 
 
138 aa  149  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  3.22969e-06  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0340  hypothetical protein  48.25 
 
 
141 aa  138  2e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  4.66882e-09  normal  0.179324 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01733  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  48.91 
 
 
135 aa  135  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00119694  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0606  hypothetical protein  52.54 
 
 
136 aa  135  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3219  hypothetical protein  50 
 
 
136 aa  134  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00997135  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0132  hypothetical protein  46.67 
 
 
141 aa  131  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3076  hypothetical protein  50.85 
 
 
136 aa  130  5e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127053  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0621  hypothetical protein  48.51 
 
 
135 aa  128  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1301  hypothetical protein  50 
 
 
136 aa  127  5e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0515359  normal  0.898737 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3066  hypothetical protein  50 
 
 
136 aa  126  9e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0730491  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01220  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  45.93 
 
 
139 aa  117  4e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2857  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  36.69 
 
 
147 aa  109  1e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1305  hypothetical protein  40 
 
 
143 aa  101  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3646  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  39.13 
 
 
137 aa  101  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.432193  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2821  hypothetical protein  36.84 
 
 
134 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2333  hypothetical protein  43.07 
 
 
131 aa  96.7  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0104783  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0483  hypothetical protein  37.61 
 
 
142 aa  89  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1422  hypothetical protein  35.88 
 
 
142 aa  85.5  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3514  hypothetical protein  33.08 
 
 
135 aa  82.4  2e-15  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.888189  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1598  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  41.46 
 
 
132 aa  82  3e-15  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  4.83764e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0582  hypothetical protein  32.14 
 
 
142 aa  79.7  1e-14  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00151271  hitchhiker  0.00238722 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2871  hypothetical protein  31.71 
 
 
145 aa  76.6  1e-13  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3761  hypothetical protein  33.33 
 
 
148 aa  75.1  3e-13  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4120  hypothetical protein  27.52 
 
 
141 aa  74.3  4e-13  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0525047  normal  0.115459 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02210  hypothetical protein  31.34 
 
 
159 aa  72.8  1e-12  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3366  hypothetical protein  31.9 
 
 
140 aa  72.8  1e-12  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.745172  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0287  hypothetical protein  32.76 
 
 
166 aa  72.4  2e-12  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3456  hypothetical protein  30.89 
 
 
136 aa  72  3e-12  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1955  hypothetical protein  30 
 
 
149 aa  72  3e-12  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1996  hypothetical protein  30.25 
 
 
146 aa  70.1  8e-12  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  4.5203e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1998  hypothetical protein  32.06 
 
 
146 aa  69.3  1e-11  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.001435  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1107  hypothetical protein  30.51 
 
 
135 aa  70.1  1e-11  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.977512  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0431  hypothetical protein  32.03 
 
 
145 aa  69.3  2e-11  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2582  hypothetical protein  26.61 
 
 
148 aa  67.4  7e-11  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2532  hypothetical protein  29.17 
 
 
143 aa  66.6  1e-10  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2033  hypothetical protein  36.21 
 
 
136 aa  65.9  2e-10  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0317  hypothetical protein  34.74 
 
 
160 aa  64.3  5e-10  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173375  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1149  hypothetical protein  29.66 
 
 
153 aa  61.2  4e-09  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003638  hypothetical protein  29.82 
 
 
158 aa  60.5  7e-09  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4505  hypothetical protein  30.43 
 
 
136 aa  60.5  8e-09  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.646006  normal  0.20017 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3229  hypothetical protein  30.33 
 
 
146 aa  60.1  1e-08  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01494  hypothetical protein  28.06 
 
 
139 aa  58.5  3e-08  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02670  hypothetical protein  26.61 
 
 
134 aa  57.8  6e-08  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0058  hypothetical protein  25.62 
 
 
139 aa  56.2  1e-07  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0807  hypothetical protein  31.43 
 
 
165 aa  55.1  3e-07  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4139  hypothetical protein  28.69 
 
 
137 aa  52.4  2e-06  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.384863 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00063  hypothetical protein  24.26 
 
 
157 aa  52  3e-06  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3977  hypothetical protein  28.69 
 
 
137 aa  51.6  4e-06  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2118  phosphate ABC transporter, extracellular solute-binding protein  31.09 
 
 
273 aa  49.7  1e-05  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  27.97 
 
 
283 aa  48.9  2e-05  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0603  extracellular solute-binding protein, putative  30.51 
 
 
276 aa  49.3  2e-05  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.924235  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4111  hypothetical protein  25 
 
 
139 aa  48.9  3e-05  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3503  phosphate binding protein  28.57 
 
 
286 aa  48.5  3e-05  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4113  hypothetical protein  25.49 
 
 
138 aa  47.4  6e-05  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.306478  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0617  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  29.66 
 
 
276 aa  47.4  7e-05  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.774542  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  31.09 
 
 
299 aa  47  8e-05  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0613  hypothetical protein  27.27 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.764284  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0610  hypothetical protein  27.59 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3097  hypothetical protein  26.83 
 
 
124 aa  46.2  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.312439  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4107  hypothetical protein  23.62 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  27.97 
 
 
279 aa  44.3  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  9.45137e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4109  hypothetical protein  25 
 
 
139 aa  43.9  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0781  phosphate binding protein  27.05 
 
 
278 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  30.51 
 
 
272 aa  43.9  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0615  hypothetical protein  25.22 
 
 
137 aa  43.9  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  28.57 
 
 
272 aa  43.5  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  30.25 
 
 
278 aa  42.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2488  phosphate binding protein  26.72 
 
 
280 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0950  hypothetical protein  29.33 
 
 
119 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000580743  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0456  phosphate binding protein  25.74 
 
 
292 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  27.73 
 
 
272 aa  42  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2834  phosphate binding protein  31.09 
 
 
307 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0570  hypothetical protein  24.43 
 
 
134 aa  42  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  28.81 
 
 
273 aa  41.2  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2997  hypothetical protein  28.47 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.469628  normal  0.623946 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  27.73 
 
 
218 aa  40.8  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  30.51 
 
 
281 aa  40.8  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1335  hypothetical protein  27.34 
 
 
131 aa  40.8  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0885608  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  27.73 
 
 
273 aa  40.4  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1908  OmpA/MotB domain protein  28.32 
 
 
519 aa  40.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.533887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>