278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1981 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2261  hypothetical protein  90.91 
 
 
330 aa  635  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  1.01343e-05  normal  0.473461 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2378  hypothetical protein  99.7 
 
 
334 aa  692  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  3.17317e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2366  hypothetical protein  99.1 
 
 
334 aa  689  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  5.82492e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1760  hypothetical protein  91.52 
 
 
330 aa  639  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0425355  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1981  hypothetical protein  100 
 
 
334 aa  694  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  8.99017e-08  hitchhiker  9.57074e-08 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2130  hypothetical protein  93.66 
 
 
334 aa  654  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2481  hypothetical protein  99.4 
 
 
334 aa  691  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  1.92331e-06  hitchhiker  0.000621581 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1838  hypothetical protein  89.79 
 
 
333 aa  633  1e-180  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.287908  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2290  hypothetical protein  88.52 
 
 
333 aa  624  1e-178  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1535  hypothetical protein  83.44 
 
 
350 aa  583  1e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242379  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2100  hypothetical protein  82.21 
 
 
326 aa  573  1e-162  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1781  hypothetical protein  82.54 
 
 
326 aa  559  1e-158  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1973  rhodanese domain-containing protein  80.24 
 
 
332 aa  557  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  1.37009e-05  normal  0.0153994 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2660  rhodanese domain-containing protein  81.85 
 
 
326 aa  550  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.918905  normal  0.0411957 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2535  rhodanese domain-containing protein  75.23 
 
 
331 aa  528  1e-149  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.848457  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2524  rhodanese domain-containing protein  75.77 
 
 
327 aa  530  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0964  hypothetical protein  69.82 
 
 
336 aa  485  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0370  hypothetical protein  68.71 
 
 
352 aa  482  1e-135  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0394  hypothetical protein  69.33 
 
 
337 aa  483  1e-135  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.845819  hitchhiker  1.14431e-06 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4798  hypothetical protein  66.98 
 
 
341 aa  479  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0411  hypothetical protein  67.48 
 
 
352 aa  474  1e-133  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0878  hypothetical protein  69.59 
 
 
332 aa  469  1e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  3.30025e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3407  rhodanese domain-containing protein  66.36 
 
 
328 aa  465  1e-130  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0216  hypothetical protein  70.45 
 
 
326 aa  466  1e-130  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32074  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3012  rhodanese domain-containing protein  64.58 
 
 
339 aa  464  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06657  hypothetical protein  67.18 
 
 
326 aa  461  1e-128  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001128  rhodanese domain protein  67.4 
 
 
326 aa  455  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  3.31641e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01937  hypothetical protein  65.63 
 
 
323 aa  452  1e-126  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00833582  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1312  hypothetical protein  67.55 
 
 
309 aa  442  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.406056 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2319  rhodanese-like protein  63.4 
 
 
323 aa  426  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  1.29535e-08  hitchhiker  0.00245583 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1758  hypothetical protein  64.86 
 
 
310 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.172624  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3956  hypothetical protein  64.19 
 
 
310 aa  418  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.765325  normal  0.0181852 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1693  hypothetical protein  63.11 
 
 
312 aa  421  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.782277  normal  0.169861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1349  hypothetical protein  64.19 
 
 
310 aa  417  1e-115  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1365  hypothetical protein  63.18 
 
 
310 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137534  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4090  hypothetical protein  61.51 
 
 
313 aa  410  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4661  hypothetical protein  61.24 
 
 
312 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0559413  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53180  hypothetical protein  61.24 
 
 
312 aa  408  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1734  rhodanese-like domain protein  61.36 
 
 
317 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.668839  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3658  hypothetical protein  61.69 
 
 
317 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.451808  normal  0.392635 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0088  hypothetical protein  60 
 
 
314 aa  404  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3401  Rhodanese domain protein  59.47 
 
 
309 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0500445 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3699  Rhodanese domain protein  58.8 
 
 
309 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3823  hypothetical protein  59.93 
 
 
314 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.455102  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0115  rhodanese domain-containing protein  59.66 
 
 
306 aa  372  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1961  rhodanese-like protein  57.19 
 
 
319 aa  364  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4255  rhodanese domain-containing protein  58.86 
 
 
305 aa  361  9e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2782  rhodanese domain-containing protein  57.67 
 
 
315 aa  361  1e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1939  rhodanese domain-containing protein  55.02 
 
 
316 aa  360  2e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0081  rhodanese family protein  58.86 
 
 
305 aa  360  2e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.919299  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0086  rhodanese family protein  58.86 
 
 
308 aa  360  3e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2362  Rhodanese domain protein  55.18 
 
 
304 aa  359  4e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2412  Rhodanese domain protein  55.52 
 
 
302 aa  357  1e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.579673  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0682  Rhodanese domain protein  57.88 
 
 
294 aa  357  1e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2825  rhodanese-like protein  56.16 
 
 
305 aa  356  3e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal  0.124761 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2937  rhodanese-like protein  54.05 
 
 
316 aa  354  1e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.751975  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3659  rhodanese domain-containing protein  53.59 
 
 
322 aa  345  7e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.245407  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0011  rhodanese-like protein  54.7 
 
 
301 aa  343  2e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.921465 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1091  rhodanese-like domain-containing protein  55.59 
 
 
305 aa  342  6e-93  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.96607  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3418  rhodanese domain-containing protein  54.1 
 
 
317 aa  341  9e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0529326  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1677  rhodanese domain-containing protein  52.49 
 
 
311 aa  337  1e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0239386 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2550  rhodanese domain-containing protein  48.81 
 
 
555 aa  328  6e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0850  rhodanese domain-containing protein  50.99 
 
 
322 aa  328  1e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3348  rhodanese domain protein  53.38 
 
 
313 aa  322  6e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.305803  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10921  sulfurtransferase  48.31 
 
 
320 aa  315  7e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.261279 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3429  rhodanese-like protein  50.51 
 
 
299 aa  310  2e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.59768  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1235  rhodanese domain-containing protein  49.17 
 
 
312 aa  304  1e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0119154 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1635  rhodanese-like protein  45 
 
 
327 aa  301  1e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3915  rhodanese domain-containing protein  57.09 
 
 
257 aa  298  7e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09971  sulfurtransferase  48.97 
 
 
310 aa  296  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14861  sulfurtransferase  46.94 
 
 
319 aa  295  8e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.612505 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1395  rhodanese-like protein  45.21 
 
 
305 aa  293  4e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0654  rhodanese-like  45.92 
 
 
319 aa  290  2e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.597958  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11851  sulfurtransferase  48.33 
 
 
310 aa  290  3e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.403922  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2897  hypothetical protein  53.36 
 
 
254 aa  284  1e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2750  hypothetical protein  52.94 
 
 
254 aa  279  5e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2196  hypothetical protein  55.27 
 
 
255 aa  278  8e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1078  rhodanese-like protein  55.27 
 
 
255 aa  276  5e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0473759  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2998  rhodanese-like sulfurtransferase  52.7 
 
 
255 aa  269  4e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.317205  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1105  rhodanese-like protein  43.48 
 
 
310 aa  255  6e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12011  sulfurtransferase  42.47 
 
 
310 aa  253  2e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.303044  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12001  sulfurtransferase  42.14 
 
 
310 aa  249  4e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.982527  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1892  rhodanese-like protein  43.75 
 
 
269 aa  249  4e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0917169  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0147  rhodanese-like protein  51.07 
 
 
242 aa  249  4e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.744417  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0206  rhodanese-like protein  46.54 
 
 
274 aa  246  3e-64  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1135  rhodanese domain-containing protein  43.98 
 
 
275 aa  239  4e-62  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2969  pseudouridine synthase, RluA family  40.75 
 
 
623 aa  234  2e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26565  predicted protein  41.64 
 
 
346 aa  231  1e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.460392  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0896  rhodanese domain-containing protein  44.83 
 
 
275 aa  230  3e-59  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.259251  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2009  rhodanese superfamily protein  43.8 
 
 
287 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807914  normal  0.757941 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2404  rhodanese superfamily protein  43.8 
 
 
287 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.954244  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2535  rhodanese superfamily protein  42.96 
 
 
282 aa  223  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574303  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0753  rhodanese superfamily protein  43.48 
 
 
282 aa  221  2e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2206  rhodanese superfamily protein  42.75 
 
 
282 aa  219  5e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0255  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 
302 aa  209  4e-53  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.297273  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1702  rhodanese superfamily protein  40.71 
 
 
334 aa  205  9e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2314  rhodanese superfamily protein  41.16 
 
 
284 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2337  rhodanese superfamily protein  41.09 
 
 
284 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.933613  normal  0.0128371 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2233  rhodanese superfamily protein  39.64 
 
 
284 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2353  rhodanese superfamily protein  39.64 
 
 
284 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0478331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>