31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1951 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1951  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  689  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  7.71271e-08  normal  0.269497 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2396  hypothetical protein  98.5 
 
 
333 aa  682  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  1.13685e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2407  hypothetical protein  97.9 
 
 
333 aa  679  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  9.06332e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2512  hypothetical protein  98.2 
 
 
333 aa  681  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00018403  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2159  hypothetical protein  75.07 
 
 
336 aa  530  1e-149  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.133255  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1729  hypothetical protein  67.35 
 
 
343 aa  462  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.113297  normal  0.414715 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2290  hypothetical protein  68.33 
 
 
341 aa  461  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000825064  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2254  hypothetical protein  68.17 
 
 
332 aa  460  1e-128  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1809  hypothetical protein  67.25 
 
 
342 aa  454  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.688217  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2400  hypothetical protein  44.72 
 
 
330 aa  269  5e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  1.4454e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1673  hypothetical protein  42.11 
 
 
382 aa  251  1e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  1.17038e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2834  hypothetical protein  43.26 
 
 
315 aa  249  4e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  5.62067e-08  hitchhiker  0.000583548 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1810  hypothetical protein  40.74 
 
 
312 aa  242  8e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  1.00473e-07  normal  0.0432271 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1542  hypothetical protein  40.07 
 
 
335 aa  235  8e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  5.0026e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1629  hypothetical protein  38.44 
 
 
312 aa  222  7e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  4.1783e-08  normal  0.218366 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1329  hypothetical protein  34.2 
 
 
394 aa  175  8e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.50236  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003995  hypothetical protein  36.04 
 
 
243 aa  119  6e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.910417  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01527  hypothetical protein  32.39 
 
 
242 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1477  hypothetical protein  35.75 
 
 
266 aa  107  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.235152  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0697  hypothetical protein  27.38 
 
 
296 aa  99  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.147007  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2205  hypothetical protein  23.93 
 
 
254 aa  95.1  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0128362  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1724  hypothetical protein  26.8 
 
 
475 aa  90.5  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0634806  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2138  putative lipoprotein  38.54 
 
 
565 aa  74.3  3e-12  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129956  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02438  hypothetical protein  34.65 
 
 
509 aa  67.8  2e-10  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.477602  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1357  hypothetical protein  28.76 
 
 
246 aa  57  4e-07  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1258  hypothetical protein  23.1 
 
 
268 aa  57  4e-07  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1801  hypothetical protein  28.48 
 
 
222 aa  53.5  5e-06  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1795  hypothetical protein  25.37 
 
 
344 aa  53.1  6e-06  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00014706  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1778  hypothetical protein  25.57 
 
 
184 aa  51.2  2e-05  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1777  hypothetical protein  25.57 
 
 
184 aa  51.2  2e-05  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1167  hypothetical protein  29.76 
 
 
208 aa  45.8  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  6.81695e-06  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>