More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1935 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  84.95 
 
 
661 aa  1164  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  90.26 
 
 
653 aa  1205  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  100 
 
 
662 aa  1360  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  97.89 
 
 
662 aa  1313  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  90.03 
 
 
649 aa  1192  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  52.53 
 
 
648 aa  658  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  98.49 
 
 
680 aa  1338  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  52.11 
 
 
657 aa  657  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  98.19 
 
 
662 aa  1335  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  88.94 
 
 
649 aa  1182  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  44.15 
 
 
640 aa  529  1e-149  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  36.81 
 
 
649 aa  387  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  3.09269e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  34.91 
 
 
659 aa  329  1e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  34.71 
 
 
663 aa  328  2e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  34.71 
 
 
663 aa  328  2e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  34.71 
 
 
663 aa  327  3e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  34.71 
 
 
663 aa  327  3e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.351325 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  34.71 
 
 
663 aa  327  3e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  34.71 
 
 
663 aa  327  4e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  35.33 
 
 
650 aa  326  8e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  35.33 
 
 
650 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  35.33 
 
 
650 aa  326  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  35.18 
 
 
650 aa  324  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  35.18 
 
 
650 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  35.11 
 
 
641 aa  323  4e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  34.48 
 
 
656 aa  323  5e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  33.28 
 
 
653 aa  302  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  32.4 
 
 
635 aa  286  6e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  31.38 
 
 
663 aa  286  6e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  31.23 
 
 
663 aa  282  1e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  30.9 
 
 
652 aa  280  6e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  5.07235e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.36 
 
 
656 aa  280  6e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  31.52 
 
 
666 aa  275  2e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  31.52 
 
 
666 aa  275  2e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  31.52 
 
 
666 aa  275  3e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  8.97059e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  31.22 
 
 
666 aa  274  4e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  31.59 
 
 
698 aa  274  5e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  31.42 
 
 
666 aa  271  3e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  31.88 
 
 
650 aa  265  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  31.52 
 
 
698 aa  263  1e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  31.52 
 
 
698 aa  263  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  30.53 
 
 
700 aa  262  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  31.52 
 
 
698 aa  263  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  30.23 
 
 
681 aa  261  3e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  30.46 
 
 
653 aa  259  1e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 
713 aa  258  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3075  outer membrane receptor FepA  30.53 
 
 
724 aa  254  4e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203578  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2919  outer membrane receptor FepA  30.95 
 
 
724 aa  253  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.91274  normal  0.0854265 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2889  outer membrane receptor FepA  31 
 
 
724 aa  253  7e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2972  outer membrane receptor FepA  30.8 
 
 
724 aa  253  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0370731 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2953  outer membrane receptor FepA  30.86 
 
 
724 aa  253  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246738  hitchhiker  7.36095e-10 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  31.93 
 
 
696 aa  252  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  29.53 
 
 
655 aa  252  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  29.32 
 
 
732 aa  252  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  31.7 
 
 
696 aa  252  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  32.61 
 
 
702 aa  249  9e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  30.58 
 
 
652 aa  249  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  31.58 
 
 
695 aa  248  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  30.78 
 
 
680 aa  248  3e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 
665 aa  248  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1450  outer membrane receptor FepA  29.06 
 
 
740 aa  247  6e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1839  outer membrane receptor FepA  28.98 
 
 
703 aa  246  8e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228059  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 
799 aa  244  5e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  30.02 
 
 
665 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  30.02 
 
 
665 aa  241  2e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  30.02 
 
 
665 aa  242  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 
740 aa  241  3e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 
658 aa  241  3e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4233  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 
799 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 
799 aa  238  3e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  29.66 
 
 
676 aa  232  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  30.22 
 
 
665 aa  233  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 
726 aa  231  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3494  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 
715 aa  227  7e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  27.94 
 
 
746 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  29.19 
 
 
744 aa  223  9e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  27.8 
 
 
698 aa  223  9e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  29.78 
 
 
714 aa  222  1e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  28.36 
 
 
744 aa  223  1e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1648  ferric receptor CfrA  28.4 
 
 
696 aa  219  9e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1522  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  28.74 
 
 
744 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37020  outer membrane receptor FepA  28.41 
 
 
746 aa  217  6e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145193  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4579  outer membrane receptor FepA  28.24 
 
 
742 aa  216  1e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 
743 aa  216  1e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0847  ferric receptor CfrA  27.99 
 
 
696 aa  214  3e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1261  ferric receptor CfrA  28.05 
 
 
702 aa  215  3e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  29.62 
 
 
739 aa  211  5e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52230  outer membrane receptor FepA  27.94 
 
 
742 aa  210  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.267722 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1195  outer membrane receptor FepA  28.55 
 
 
749 aa  204  4e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0821218  normal  0.246562 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3743  outer membrane receptor FepA  25.8 
 
 
766 aa  204  6e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.325826  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37010  outer membrane receptor FepA  27.47 
 
 
757 aa  203  8e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0110447  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  29.16 
 
 
634 aa  200  7e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01120  iron-regulated outer membrane virulence protein  30.14 
 
 
572 aa  196  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3964  outer membrane receptor FepA  26.59 
 
 
746 aa  195  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29350  outer membrane receptor FepA  26.46 
 
 
746 aa  195  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.93217  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1485  outer membrane receptor FepA  27.36 
 
 
777 aa  193  9e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0839984  normal  0.152216 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1099  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 
664 aa  186  1e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  27.93 
 
 
704 aa  184  5e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  27.7 
 
 
697 aa  182  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0680  outer membrane receptor FepA  26.51 
 
 
783 aa  182  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0125648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>