142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1925 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1792  aromatic amino acid transporter  84.73 
 
 
395 aa  646  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2185  aromatic amino acid transporter  84.99 
 
 
395 aa  646  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135373  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1846  aromatic amino acid transporter  84.99 
 
 
395 aa  646  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.510263 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2544  aromatic amino acid transporter  99.24 
 
 
395 aa  766  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.487399  decreased coverage  0.00912111 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2065  tyrosine-specific transport protein  83.72 
 
 
395 aa  638  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1925  aromatic amino acid transporter  100 
 
 
395 aa  773  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00166231  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2186  aromatic amino acid transporter  96.2 
 
 
395 aa  714  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.338137  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2433  aromatic amino acid transporter  98.99 
 
 
395 aa  765  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.485869  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2426  aromatic amino acid transporter  98.48 
 
 
395 aa  762  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.392601  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0526  aromatic amino acid transporter  64.12 
 
 
400 aa  501  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.560578  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4434  aromatic amino acid transporter  65.65 
 
 
400 aa  502  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0511  putative tyrosine-specific transport protein  63.1 
 
 
400 aa  485  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0712  tyrosine-specific transport protein  55.98 
 
 
400 aa  399  1e-110  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1774  tyrosine-specific transport protein (tyrosine permease)  51.92 
 
 
390 aa  398  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2099  tyrosine-specific transport protein  50.76 
 
 
422 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  1.23753e-19 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1307  tyrosine-specific transport protein  50.76 
 
 
422 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  1.07929e-09 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2152  tyrosine-specific transport protein  50.76 
 
 
422 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  2.42218e-15 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2092  tyrosine-specific transport protein  51.02 
 
 
422 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0842051  hitchhiker  7.39999e-05 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1184  tyrosine-specific transport protein  50.51 
 
 
422 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.135204  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003573  tyrosine-specific transport protein  54.3 
 
 
380 aa  382  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1034  tyrosine-specific transport protein  50.76 
 
 
403 aa  379  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  3.11327e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1729  aromatic amino acid transporter  50.51 
 
 
403 aa  376  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000563721  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1276  tyrosine-specific transport protein  50.25 
 
 
403 aa  376  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.928e-05  hitchhiker  3.67731e-05 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2005  tyrosine-specific transport protein  50.51 
 
 
403 aa  376  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  5.29329e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2140  tyrosine-specific transport protein  50.51 
 
 
403 aa  376  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  5.92969e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01875  tyrosine transporter  50.51 
 
 
403 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0104717  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2647  tyrosine-specific transport protein  50.25 
 
 
403 aa  375  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.588852  hitchhiker  3.18595e-08 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01864  hypothetical protein  50.51 
 
 
403 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00693993  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1736  aromatic amino acid transporter  50.25 
 
 
403 aa  376  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.8039e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2774  tyrosine-specific transport protein  48.86 
 
 
402 aa  371  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2853  aromatic amino acid transporter  48.86 
 
 
402 aa  371  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1318  tyrosine-specific transport protein  48.86 
 
 
402 aa  371  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3276  aromatic amino acid transporter  50.89 
 
 
402 aa  365  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2489  aromatic amino acid transporter  49.75 
 
 
425 aa  362  9e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1118  aromatic amino acid transporter  49.62 
 
 
402 aa  358  1e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02530  hypothetical protein  52.12 
 
 
361 aa  355  7e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3197  aromatic amino acid transporter  49.37 
 
 
402 aa  353  4e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0780  tyrosine-specific transport protein  44.36 
 
 
403 aa  292  6e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  8.92482e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3389  aromatic amino acid permease  40.91 
 
 
395 aa  273  4e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1074  tyrosine-specific transport protein, putative  41.92 
 
 
395 aa  272  8e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0948  aromatic amino acid permease  41.98 
 
 
391 aa  270  3e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0522769 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3188  aromatic amino acid permease  38.69 
 
 
395 aa  269  5e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497864  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3026  aromatic amino acid permease  41.98 
 
 
391 aa  269  6e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3588  aromatic amino acid permease  40.97 
 
 
391 aa  269  6e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.281237  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0912  aromatic amino acid permease  41.73 
 
 
391 aa  269  7e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.231999  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3465  aromatic amino acid permease  40.97 
 
 
391 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.230898  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0897  aromatic amino acid permease  40.97 
 
 
391 aa  267  3e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3878  aromatic amino acid permease  40.56 
 
 
391 aa  266  4e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00957771  hitchhiker  2.85867e-06 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0683  aromatic amino acid permease  43.72 
 
 
399 aa  261  2e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.205009  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1166  tyrosine-specific transport protein  42.86 
 
 
405 aa  260  3e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3298  tyrosine-specific transport protein  40.46 
 
 
388 aa  259  9e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3938  aromatic amino acid permease  39.95 
 
 
392 aa  258  1e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176846  normal  0.472237 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0574  aromatic amino acid permease  39.95 
 
 
400 aa  257  3e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0916  aromatic amino acid permease  42.13 
 
 
395 aa  255  1e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2939  tyrosine-specific transport protein, putative  41.92 
 
 
395 aa  253  4e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121322  normal  0.0322125 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0641  aromatic amino acid permease  38.42 
 
 
399 aa  248  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4601  tryptophan-specific transport protein  35.26 
 
 
414 aa  243  5e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4108  aromatic amino acid transporter  34.84 
 
 
418 aa  239  6e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4307  aromatic amino acid transporter  34.84 
 
 
418 aa  239  6e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4176  aromatic amino acid transporter  34.84 
 
 
418 aa  239  8e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3787  aromatic amino acid transporter  34.59 
 
 
418 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0158  aromatic amino acid transporter  34.84 
 
 
418 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3987  aromatic amino acid transporter  34.59 
 
 
418 aa  237  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3860  aromatic amino acid transporter  34.59 
 
 
418 aa  237  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3513  aromatic amino acid transport protein  34.5 
 
 
417 aa  236  7e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3778  aromatic amino acid transporter  34.02 
 
 
418 aa  234  2e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0262  aromatic amino acid transporter  34.74 
 
 
418 aa  231  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3995  aromatic amino acid transporter  34.24 
 
 
418 aa  225  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3479  aromatic amino acid transport protein  35.25 
 
 
418 aa  224  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0182  aromatic amino acid transporter  32.41 
 
 
418 aa  220  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1031  aromatic amino acid transporter  33.93 
 
 
425 aa  220  4e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0991  tryptophan permease  33.08 
 
 
424 aa  219  7e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3531  aromatic amino acid transporter  33.58 
 
 
418 aa  218  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2697  tryptophan-specific transport protein  32.67 
 
 
414 aa  217  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6222  tryptophan permease  33.33 
 
 
467 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2776  aromatic amino acid transporter  32.67 
 
 
414 aa  217  3e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1562  tryptophan-specific transport protein  34.22 
 
 
416 aa  217  3e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  3.04843e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71710  tryptophan permease  33.25 
 
 
417 aa  217  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.268423  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0755  tryptophan permease  32.82 
 
 
424 aa  215  9e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0202  aromatic amino acid transporter  33.25 
 
 
418 aa  215  1e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0097  aromatic amino acid transporter  35.08 
 
 
419 aa  212  1e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.103921  normal  0.507347 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1511  tryptophan-specific transport protein  32.42 
 
 
412 aa  210  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3236  aromatic amino acid transporter  31.17 
 
 
414 aa  209  9e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  3.6044e-05 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001420  tyrosine-specific transport protein  39.29 
 
 
385 aa  208  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06320  hypothetical protein  38.78 
 
 
385 aa  204  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0691  hypothetical protein  35.38 
 
 
398 aa  200  3e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1337  tyrosine-specific transport protein (tyrosine permease)  38.4 
 
 
384 aa  199  5e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0448  tyrosine-specific transport protein  37.03 
 
 
426 aa  199  8e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1723  tryptophan/tyrosine permease family protein  37.03 
 
 
424 aa  199  9e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0709  hypothetical protein  35.38 
 
 
398 aa  199  9e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0710  hypothetical protein  33.67 
 
 
396 aa  196  5e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0692  hypothetical protein  33.67 
 
 
396 aa  196  6e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1135  aromatic amino acid transporter  32.32 
 
 
409 aa  186  5e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.55679  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3535  tryptophan permease  28.69 
 
 
414 aa  176  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3572  tryptophan permease  29.01 
 
 
414 aa  176  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4258  aromatic amino acid transporter  29.15 
 
 
415 aa  174  3e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3466  tryptophan permease  28.42 
 
 
414 aa  173  4e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03593  tryptophan transporter of low affinity  29.15 
 
 
415 aa  173  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03537  hypothetical protein  29.15 
 
 
415 aa  173  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4218  tryptophan permease TnaB  29.15 
 
 
415 aa  173  5e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>