45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1913 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2551  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  367  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0408424 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1913  protein of unknown function DUF1379  100 
 
 
177 aa  367  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0618258  normal  0.219466 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2438  hypothetical protein  99.44 
 
 
177 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2431  hypothetical protein  99.44 
 
 
177 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.146269  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2193  hypothetical protein  95.48 
 
 
177 aa  354  4e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1682  hypothetical protein  92.66 
 
 
177 aa  346  1e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0455206  normal  0.0971581 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1757  hypothetical protein  92.09 
 
 
177 aa  345  2e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0511465  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1787  hypothetical protein  92.09 
 
 
177 aa  345  3e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0844368  normal  0.271795 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2591  hypothetical protein  91.53 
 
 
177 aa  343  8e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1594  hypothetical protein  70.62 
 
 
177 aa  269  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  2.37237e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1811  hypothetical protein  66.67 
 
 
177 aa  258  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  2.37995e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2219  hypothetical protein  67.23 
 
 
177 aa  255  3e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2474  hypothetical protein  63.28 
 
 
177 aa  249  2e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.411375  hitchhiker  0.00395627 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2142  hypothetical protein  63.84 
 
 
181 aa  248  4e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.883221  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1731  hypothetical protein  63.28 
 
 
177 aa  241  5e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1944  hypothetical protein  62.01 
 
 
179 aa  237  6e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1111  hypothetical protein  31.76 
 
 
180 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  7.98367e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2172  hypothetical protein  31.76 
 
 
180 aa  85.1  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  7.20846e-10  normal  0.548871 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00957  hypothetical protein  31.76 
 
 
180 aa  85.1  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  4.3428e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1741  hypothetical protein  31.36 
 
 
182 aa  85.5  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0888818  normal  0.0230313 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2370  hypothetical protein  31.76 
 
 
192 aa  85.5  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  4.38094e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1062  hypothetical protein  31.76 
 
 
192 aa  85.5  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  4.04596e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1055  hypothetical protein  31.76 
 
 
192 aa  85.5  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.52866e-14  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2697  protein of unknown function DUF1379  31.76 
 
 
180 aa  85.1  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  4.57658e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2650  hypothetical protein  31.76 
 
 
180 aa  85.5  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  2.22204e-08  hitchhiker  0.00136169 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00950  hypothetical protein  31.76 
 
 
180 aa  85.1  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  4.81867e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1550  hypothetical protein  30.91 
 
 
196 aa  84.3  7e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.38662  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1134  hypothetical protein  30.77 
 
 
180 aa  83.2  2e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  9.82581e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1100  hypothetical protein  30.18 
 
 
180 aa  82  4e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  2.78688e-05  normal  0.979785 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1017  hypothetical protein  30.18 
 
 
180 aa  81.6  5e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  1.66456e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1121  hypothetical protein  30.18 
 
 
180 aa  81.6  5e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  2.0025e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1168  hypothetical protein  30.18 
 
 
180 aa  81.6  5e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  4.48874e-05  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1647  protein of unknown function DUF1379  29.82 
 
 
186 aa  80.9  8e-15  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.3362  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1458  hypothetical protein  29.59 
 
 
180 aa  80.1  2e-14  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00224961  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2062  protein of unknown function DUF1379  30.9 
 
 
195 aa  79.7  2e-14  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003437  hypothetical protein  30.3 
 
 
180 aa  79.3  3e-14  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1789  hypothetical protein  31.95 
 
 
195 aa  79.3  3e-14  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139649  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1985  hypothetical protein  29.41 
 
 
183 aa  78.6  5e-14  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2643  hypothetical protein  29.41 
 
 
183 aa  77.8  8e-14  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.284098  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2554  hypothetical protein  29.41 
 
 
183 aa  77.8  8e-14  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1678  protein of unknown function DUF1379  29.24 
 
 
184 aa  74.3  8e-13  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.439377  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02338  hypothetical protein  29.09 
 
 
180 aa  72.4  3e-12  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1097  hypothetical protein  29.94 
 
 
180 aa  68.6  4e-11  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183641  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2004  hypothetical protein  28.73 
 
 
178 aa  67  1e-10  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0401483  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2298  hypothetical protein  25.44 
 
 
188 aa  56.2  2e-07  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.75363  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>