208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1900 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1900  Paraquat-inducible protein A  100 
 
 
210 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00104452  normal  0.195982 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2451  paraquat-inducible protein A  100 
 
 
210 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.356157  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2564  paraquat-inducible protein A  100 
 
 
210 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.794352  normal  0.0919283 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2444  paraquat-inducible protein A  100 
 
 
210 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0158328  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2206  paraquat-inducible protein A  93.81 
 
 
210 aa  407  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.502465  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1744  paraquat-inducible protein A  90.48 
 
 
211 aa  367  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.457122  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1774  paraquat-inducible protein A  90.52 
 
 
211 aa  367  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.233291  normal  0.160696 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1669  paraquat-inducible protein A  90 
 
 
211 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00177227  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1581  paraquat-inducible protein A  74.88 
 
 
215 aa  323  1e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.513887  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2232  paraquat-inducible protein A  69.71 
 
 
208 aa  317  1e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1798  paraquat-inducible protein A  70.05 
 
 
220 aa  314  7e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0764034  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2129  paraquat-inducible protein A  68.6 
 
 
208 aa  311  6e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00475203  normal  0.0456447 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1931  paraquat-inducible protein A  66.67 
 
 
209 aa  303  2e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.29845  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2487  paraquat-inducible protein A  69.08 
 
 
208 aa  293  9e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00109447  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1718  paraquat-inducible protein A  73.68 
 
 
209 aa  278  4e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  6.34197e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2604.1  hypothetical protein  86.88 
 
 
161 aa  258  3e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5398  PqiA family protein  30.2 
 
 
218 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0407212  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62040  putative paraquat-inducible protein  30.58 
 
 
235 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0218232 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0638  paraquat-inducible protein A  31.84 
 
 
219 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.205765 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0643  paraquat-inducible protein A  31.22 
 
 
219 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.766224  hitchhiker  0.00309021 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4782  paraquat-inducible protein A  32.84 
 
 
219 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4565  paraquat-inducible protein A  30.48 
 
 
219 aa  99  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.947001  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003427  paraquat-inducible protein A  28.08 
 
 
416 aa  97.1  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0651922  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1013  paraquat-inducible protein A  31.34 
 
 
219 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.473399  normal  0.115279 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1108  hypothetical protein  33.93 
 
 
419 aa  93.6  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000845315  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44080  PqiA family protein  29.81 
 
 
208 aa  92.4  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179105  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2221  paraquat-inducible protein A  31.61 
 
 
198 aa  89.4  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00681473  normal  0.119322 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3044  paraquat-inducible protein A  27.14 
 
 
204 aa  87  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.123343 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0258  paraquat-inducible protein A  26.26 
 
 
212 aa  86.7  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42470  Paraquat-inducible protein A  30.54 
 
 
219 aa  85.1  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1540  paraquat-inducible membrane protein A  28.8 
 
 
408 aa  80.9  1e-14  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.541735  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0401  paraquat-inducible protein A  26.63 
 
 
221 aa  79.7  3e-14  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3076  PqiA family integral membrane protein  25.13 
 
 
405 aa  79.3  3e-14  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3289  paraquat-inducible protein A  26.5 
 
 
214 aa  78.2  8e-14  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2581  paraquat-inducible protein A  25.5 
 
 
214 aa  77.4  1e-13  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.502508 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0039  putative paraquat-inducible protein  28.08 
 
 
220 aa  77  2e-13  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.355976  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6817  paraquat-inducible protein A  26.76 
 
 
215 aa  77  2e-13  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2678  paraquat-inducible protein A  28.99 
 
 
252 aa  77.4  2e-13  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1447  Paraquat-inducible protein A  29.67 
 
 
212 aa  76.6  2e-13  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.237229  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2440  paraquat-inducible protein A  25 
 
 
223 aa  76.3  3e-13  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1059  paraquat-inducible protein A  25.52 
 
 
417 aa  75.9  4e-13  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  5.08779e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00961  hypothetical protein  25.52 
 
 
417 aa  75.9  4e-13  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000262211  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2693  integral membrane protein, PqiA family  25.52 
 
 
417 aa  75.9  4e-13  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.098958  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00954  paraquat-inducible membrane protein A  25.52 
 
 
417 aa  75.9  4e-13  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000174021  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2367  paraquat-inducible protein A  25.52 
 
 
417 aa  75.9  4e-13  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.658309  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2646  PqiA family integral membrane protein  25.52 
 
 
417 aa  75.9  4e-13  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.00049713 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1065  paraquat-inducible protein A  25.52 
 
 
417 aa  75.9  4e-13  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  5.65994e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3375  paraquat-inducible protein A  28.21 
 
 
212 aa  75.5  5e-13  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0541727 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0402  paraquat-inducible protein A  28.22 
 
 
213 aa  75.5  5e-13  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3140  paraquat-inducible protein A  26.13 
 
 
209 aa  75.9  5e-13  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1571  paraquat-inducible protein A  24.38 
 
 
216 aa  75.5  6e-13  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0580  paraquat-inducible protein A  27.27 
 
 
249 aa  75.1  7e-13  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0166734  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1999  Paraquat-inducible protein A  26.21 
 
 
215 aa  75.1  8e-13  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4089  paraquat-inducible protein A  27.27 
 
 
423 aa  74.7  9e-13  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645916  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1114  paraquat-inducible protein A  25 
 
 
417 aa  74.3  1e-12  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0100863  normal  0.917256 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2169  paraquat-inducible protein A  25 
 
 
417 aa  74.3  1e-12  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  3.94614e-05  normal  0.228835 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0808  paraquat-inducible protein A  27.11 
 
 
229 aa  74.3  1e-12  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1462  PqiA family integral membrane protein  24.86 
 
 
417 aa  73.6  2e-12  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.103115  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02655  integral membrane protein, PqiA family  27.16 
 
 
380 aa  72.8  3e-12  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.399105  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1998  Paraquat-inducible protein A  27.05 
 
 
209 aa  72.4  4e-12  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0329  Paraquat-inducible protein A  25.85 
 
 
210 aa  72  6e-12  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2673  paraquat-inducible protein A  24.88 
 
 
209 aa  71.6  8e-12  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.44394  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1651  integral membrane protein, PqiA family  25.65 
 
 
422 aa  71.2  1e-11  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2933  PqiA family integral membrane protein  24.06 
 
 
423 aa  71.2  1e-11  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0518  Paraquat-inducible protein A  24.32 
 
 
245 aa  71.2  1e-11  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1104  paraquat-inducible protein A  24.71 
 
 
417 aa  70.5  2e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.163733 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1126  Pqi5  25.43 
 
 
417 aa  70.9  2e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.865331  normal  0.906807 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1172  paraquat-inducible protein A  24.71 
 
 
417 aa  70.5  2e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.718604  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1021  paraquat-inducible protein A  24.71 
 
 
417 aa  70.5  2e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00323586  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1138  paraquat-inducible protein A  24.71 
 
 
417 aa  70.5  2e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.946739  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1324  integral membrane protein, PqiA family  24.62 
 
 
489 aa  69.7  3e-11  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153858  normal  0.426119 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5397  paraquat-inducible protein A  22.89 
 
 
206 aa  69.7  3e-11  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3243  Paraquat-inducible protein A  26.89 
 
 
212 aa  69.3  4e-11  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2550  paraquat-inducible protein A  25 
 
 
428 aa  68.9  5e-11  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.731619  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1989  paraquat-inducible protein A  25 
 
 
428 aa  68.9  5e-11  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2639  PqiA family integral membrane protein  25 
 
 
428 aa  68.9  5e-11  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42460  Paraquat-inducible protein A  22.93 
 
 
207 aa  68.6  6e-11  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1743  paraquat-inducible protein A  22.97 
 
 
205 aa  68.2  9e-11  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917956  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1668  paraquat-inducible protein A  22.97 
 
 
205 aa  68.2  9e-11  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00504081  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1773  paraquat-inducible protein A  23.22 
 
 
205 aa  67.8  1e-10  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.23148  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0531  Paraquat-inducible protein A  24.32 
 
 
245 aa  67.8  1e-10  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2101  integral membrane protein, PqiA family  27.75 
 
 
427 aa  67  2e-10  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  2.68144e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1745  PqiA family integral membrane protein  23.76 
 
 
414 aa  67  2e-10  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0758068  hitchhiker  3.36386e-05 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0639  paraquat-inducible protein A  21.46 
 
 
207 aa  67  2e-10  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62030  paraquat-inducible protein A-like protein  23.12 
 
 
206 aa  67  2e-10  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2062  PqiA family integral membrane protein  27.27 
 
 
427 aa  67.4  2e-10  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000156697  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1799  PqiA family integral membrane protein  27.27 
 
 
427 aa  67.4  2e-10  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.617144  normal  0.0501575 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3510  hypothetical protein  24.35 
 
 
464 aa  66.6  2e-10  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.21998  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0650  PqiA family integral membrane protein  24.28 
 
 
449 aa  66.6  2e-10  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0149918  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1570  paraquat-inducible protein A  24.15 
 
 
204 aa  66.6  2e-10  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2534  paraquat-inducible protein A  25 
 
 
224 aa  67  2e-10  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01804  conserved inner membrane protein  27.27 
 
 
427 aa  67.4  2e-10  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01792  hypothetical protein  27.27 
 
 
427 aa  67.4  2e-10  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36030  paraquat-inducible protein A  22.54 
 
 
206 aa  66.2  3e-10  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  1.03971e-09 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1793  integral membrane protein, PqiA family  23.04 
 
 
458 aa  66.2  3e-10  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1446  Paraquat-inducible protein A  27.92 
 
 
207 aa  66.2  3e-10  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.257026  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0604  paraquat-inducible protein A  24.26 
 
 
220 aa  65.9  4e-10  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816957  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6818  paraquat-inducible protein A  25.13 
 
 
215 aa  65.9  4e-10  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2066  integral membrane protein, PqiA family  23.04 
 
 
448 aa  65.9  4e-10  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2672  paraquat-inducible protein A  24.4 
 
 
221 aa  66.2  4e-10  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167309  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>