24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1856 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2608  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0307419  decreased coverage  0.000510715 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2488  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.216175  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1856  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0849639  decreased coverage  1.66193e-09 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2495  hypothetical protein  98.84 
 
 
259 aa  521  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2249  hypothetical protein  89.19 
 
 
259 aa  451  1e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1730  hypothetical protein  87.64 
 
 
259 aa  439  1e-122  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0608955  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2650  hypothetical protein  86.49 
 
 
259 aa  435  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1661  hypothetical protein  86.87 
 
 
259 aa  434  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.100464  unclonable  1.62352e-05 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1586  hypothetical protein  86.87 
 
 
259 aa  434  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0274454  normal  0.0602505 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1323  hypothetical protein  76.95 
 
 
257 aa  394  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.104999 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1804  hypothetical protein  74.9 
 
 
257 aa  393  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.389393  hitchhiker  0.0035838 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1449  hypothetical protein  77.18 
 
 
259 aa  390  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  8.35814e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2097  hypothetical protein  76.69 
 
 
259 aa  382  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.308927  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1623  hypothetical protein  74.69 
 
 
258 aa  375  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.199092  normal  0.0571919 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2840  hypothetical protein  76.86 
 
 
257 aa  372  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0776012  hitchhiker  1.64508e-06 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1536  hypothetical protein  69.17 
 
 
258 aa  346  2e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0198685  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1690  hypothetical protein  32.44 
 
 
254 aa  160  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.278449  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01943  hypothetical protein  35.12 
 
 
250 aa  142  5e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0504708  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1622  hypothetical protein  32.39 
 
 
255 aa  140  2e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1199  hypothetical protein  36.59 
 
 
256 aa  135  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01792  hypothetical protein  30.65 
 
 
254 aa  123  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1499  hypothetical protein  29.67 
 
 
262 aa  123  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  4.80676e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003884  DNA repair ATPase  30.58 
 
 
232 aa  117  2e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1768  hypothetical protein  23.27 
 
 
256 aa  42.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>