78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1815 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2428  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  87.08 
 
 
596 aa  1113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457746  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2219  sulfatase  86.58 
 
 
596 aa  1108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.198637  normal  0.459897 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1555  hypothetical protein  61.51 
 
 
594 aa  766  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000146731  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2651  sulfatase  99.5 
 
 
595 aa  1238  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.131342  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1815  sulfatase  100 
 
 
595 aa  1243  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000588334  normal  0.040327 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2337  sulfatase  66.56 
 
 
604 aa  863  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  9.69509e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2493  sulfatase  65.66 
 
 
596 aa  830  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0120701  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1808  sulfatase  68.78 
 
 
594 aa  879  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00146351  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1763  sulfatase  62.92 
 
 
594 aa  825  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2536  sulfatase  99.5 
 
 
595 aa  1238  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.120182  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2787  sulfatase  64.66 
 
 
595 aa  823  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00415644  normal  0.904543 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2175  hypothetical protein  85.23 
 
 
596 aa  1090  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1470  sulfatase  64.32 
 
 
595 aa  821  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00214736  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2529  sulfatase  99.83 
 
 
595 aa  1241  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.370551  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2290  sulfatase  86.05 
 
 
592 aa  1100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  7.57379e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2295  sulfatase  86.91 
 
 
596 aa  1112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0407912  normal  0.745937 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03028  hypothetical protein  34.05 
 
 
602 aa  362  8e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002922  putative sulfatase  34.39 
 
 
602 aa  360  3e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1626  hypothetical protein  33.61 
 
 
600 aa  353  4e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  3.82415e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1057  putative sulfatase  33.33 
 
 
601 aa  340  3e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2723  sulfatase family protein  30.93 
 
 
598 aa  293  7e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223832  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2487  sulfatase family protein  31.41 
 
 
586 aa  293  7e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0306153  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1484  sulfatase family protein  30.93 
 
 
598 aa  293  7e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.15625  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2798  sulfatase  30.93 
 
 
598 aa  293  7e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000743938  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0769  sulfatase family protein  31.63 
 
 
586 aa  292  1e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.442835  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1459  sulfatase  31.25 
 
 
586 aa  291  2e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.741497  normal  0.82887 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2338  sulfatase family protein  31.25 
 
 
586 aa  291  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0980627  normal  0.0832613 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02118  predicted hydrolase, inner membrane  31.25 
 
 
586 aa  291  2e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0693117  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2327  sulfatase family protein  31.25 
 
 
586 aa  291  2e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.194972  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1469  sulfatase  31.25 
 
 
586 aa  291  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00665277  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02077  hypothetical protein  31.25 
 
 
586 aa  291  2e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0973017  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3327  sulfatase family protein  31.25 
 
 
586 aa  291  2e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388602  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3257  sulfatase  31.58 
 
 
593 aa  290  7e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  8.74848e-06  normal  0.913435 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2269  sulfatase  30.31 
 
 
595 aa  289  8e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00312087  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2377  inner membrane protein YejM  31.32 
 
 
586 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2579  inner membrane protein YejM  31.16 
 
 
586 aa  287  3e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal  0.0355426 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2467  inner membrane protein YejM  31.17 
 
 
586 aa  288  3e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.437197  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2465  hypothetical protein  31.16 
 
 
586 aa  287  3e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.124553  hitchhiker  0.000929959 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2422  inner membrane protein YejM  31.16 
 
 
586 aa  287  3e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.223864 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2784  sulfatase  30.69 
 
 
586 aa  282  1e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.879948  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0230  hypothetical protein  29.78 
 
 
580 aa  280  5e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2447  sulfatase  29.93 
 
 
590 aa  268  2e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00465294  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1632  sulfatase  28.88 
 
 
582 aa  265  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258504  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1903  sulfatase  28.97 
 
 
582 aa  262  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.959252  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2361  sulfatase  27.93 
 
 
590 aa  252  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0181  membrane associated sulfatase  28.24 
 
 
617 aa  226  1e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.630405  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0242  membrane associated sulfatase  28.24 
 
 
617 aa  226  1e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3889  sulfatase  28.81 
 
 
613 aa  215  2e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0014  sulfatase  28.64 
 
 
615 aa  214  3e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3036  sulfatase  27.93 
 
 
611 aa  197  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3482  sulfatase  28.08 
 
 
609 aa  193  9e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.531027  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2178  hypothetical protein  26.45 
 
 
622 aa  190  6e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.41433e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2021  phosphoglycerol transferase MdoB-like protein, alkaline phosphatase superfamily  24.25 
 
 
647 aa  181  4e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.886133  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0173  sulfatase  24.65 
 
 
638 aa  180  6e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.317367  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03303  hypothetical protein  27.26 
 
 
607 aa  178  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0352  sulfatase  25 
 
 
600 aa  178  3e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0469507  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002683  predicted hydrolase  26.87 
 
 
607 aa  177  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1271  hypothetical protein  24.96 
 
 
637 aa  172  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2610  hypothetical protein  26.67 
 
 
586 aa  172  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2835  sulfatase  26.81 
 
 
625 aa  169  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.181831  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1272  hypothetical protein  24.04 
 
 
637 aa  169  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0170  sulfatase  25.52 
 
 
635 aa  156  9e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2024  phosphoglycerol transferase MdoB-like protein, alkaline phosphatase superfamily  25.52 
 
 
638 aa  155  2e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3380  alkaline phosphatase superfamily hydrolase  30.12 
 
 
509 aa  150  9e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.99522  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01909  Membrane-associated hydrolase of alkaline phosphatase superfamily protein  29.47 
 
 
508 aa  135  1e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.558956  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1723  putative sulfatase  26.17 
 
 
624 aa  127  8e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010962  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52300  hypothetical protein  25.19 
 
 
642 aa  110  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.640238 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2101  sulfatase  26.77 
 
 
614 aa  101  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.102341  normal  0.0551221 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4586  hypothetical protein  22.95 
 
 
641 aa  92  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445083  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0174  sulfatase  21.96 
 
 
621 aa  73.2  1e-11  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0183  sulfatase  21.99 
 
 
621 aa  71.2  5e-11  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0194  sulfatase  21.74 
 
 
621 aa  68.6  3e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0192  sulfatase  24.17 
 
 
630 aa  65.5  3e-09  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.30718 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2135  sulfatase  23.71 
 
 
429 aa  58.5  3e-07  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2974  hypothetical protein  23.37 
 
 
550 aa  45.4  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3581  hypothetical protein  21.79 
 
 
700 aa  44.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.377432  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42670  hypothetical protein  21.79 
 
 
700 aa  43.9  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4108  sulfatase  22.68 
 
 
697 aa  43.9  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.526454 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>