More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1811 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  100 
 
 		 183 aa  374  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  48.85 
 
 		 235 aa  167  6e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  46.99 
 
 		 184 aa  164  5e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  48.28 
 
 		 189 aa  162  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  47.46 
 
 		 186 aa  158  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  47.46 
 
 		 186 aa  158  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  46.89 
 
 		 191 aa  157  6e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  42.93 
 
 		 188 aa  157  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3170  resolvase domain-containing protein  47.19 
 
 		 200 aa  156  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430122 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  46.33 
 
 		 186 aa  155  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  46.33 
 
 		 186 aa  155  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  46.33 
 
 		 186 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  47.73 
 
 		 192 aa  155  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0166  Resolvase domain protein  46.89 
 
 		 188 aa  154  6e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  46.63 
 
 		 186 aa  153  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  46.02 
 
 		 186 aa  153  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  45.76 
 
 		 186 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  45.76 
 
 		 186 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  45.2 
 
 		 186 aa  150  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  44.63 
 
 		 205 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2179  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 188 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0190993  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2946  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 188 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0986415  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  44.07 
 
 		 188 aa  149  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  44.07 
 
 		 185 aa  148  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4598  Resolvase domain protein  44.07 
 
 		 188 aa  148  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2319  resolvase, putative  55.3 
 
 		 137 aa  147  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000512602  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  43.5 
 
 		 185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  43.5 
 
 		 185 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  43.5 
 
 		 185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  43.5 
 
 		 185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  43.5 
 
 		 185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  42.37 
 
 		 201 aa  143  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  42.37 
 
 		 201 aa  143  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1325  resolvase domain-containing protein  43.78 
 
 		 192 aa  142  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2264  resolvase-like protein  42.6 
 
 		 183 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0723164  hitchhiker  0.00531394 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  41.95 
 
 		 186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2803  putative resolvase  46.7 
 
 		 188 aa  138  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.545302  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1735  putative resolvase  46.7 
 
 		 188 aa  137  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  41.11 
 
 		 187 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  40.43 
 
 		 190 aa  132  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16170  resolvase  40.57 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.982528  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  39.78 
 
 		 190 aa  131  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  41.08 
 
 		 203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  43.09 
 
 		 186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  39.89 
 
 		 185 aa  127  9.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  38.25 
 
 		 184 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3523  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  44.63 
 
 		 184 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000257012  decreased coverage  0.00040401 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1312  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  43.78 
 
 		 187 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.183881 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6388  resolvase domain-containing protein  42.22 
 
 		 191 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  39.78 
 
 		 186 aa  124  7e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  38.3 
 
 		 205 aa  124  8.000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  38.3 
 
 		 205 aa  124  8.000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002227  resolvase  51.67 
 
 		 128 aa  124  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  36.07 
 
 		 189 aa  121  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  38.12 
 
 		 185 aa  121  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6517  resolvase domain-containing protein  40.88 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  38.67 
 
 		 187 aa  114  6e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  35.39 
 
 		 191 aa  112  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  35.39 
 
 		 191 aa  112  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  38.33 
 
 		 205 aa  107  8.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  34.64 
 
 		 183 aa  106  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  36.11 
 
 		 198 aa  105  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2381  Resolvase domain  36.93 
 
 		 196 aa  105  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  34.9 
 
 		 194 aa  104  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2027  resolvase domain-containing protein  35.68 
 
 		 185 aa  104  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  33.15 
 
 		 188 aa  104  7e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  35.96 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1579  transposon Tn3 resolvase  37.99 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.159821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  34.59 
 
 		 193 aa  102  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0938  site-specific recombinase  43.18 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1104  Resolvase domain  35.8 
 
 		 196 aa  100  8e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1647  resolvase domain protein  45.45 
 
 		 120 aa  100  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  32.4 
 
 		 201 aa  99  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04260  hypothetical protein  39.36 
 
 		 197 aa  98.6  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  40 
 
 		 185 aa  98.6  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  39.44 
 
 		 185 aa  98.6  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  39.44 
 
 		 185 aa  99  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  33.89 
 
 		 195 aa  98.2  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  34.04 
 
 		 188 aa  98.2  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  31.32 
 
 		 190 aa  97.8  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  31.87 
 
 		 193 aa  97.8  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  35.48 
 
 		 209 aa  97.8  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  36.52 
 
 		 181 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  31.91 
 
 		 193 aa  97.1  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  33.52 
 
 		 181 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  34.08 
 
 		 192 aa  95.1  4e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0096  resolvase domain-containing protein  34.08 
 
 		 185 aa  95.5  4e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5336  transposon Tn21 resolvase  42.62 
 
 		 129 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  34.25 
 
 		 182 aa  94.7  6e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  32.96 
 
 		 188 aa  94.4  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  33.52 
 
 		 180 aa  94.4  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  34.66 
 
 		 188 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  33.15 
 
 		 191 aa  94  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0222  transposon resolvase  34.97 
 
 		 199 aa  94  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000952158 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0216  transposon resolvase  34.97 
 
 		 199 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.159168 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0204  transposon resolvase  36.17 
 
 		 191 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000159954 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  30.73 
 
 		 185 aa  93.2  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  31.84 
 
 		 201 aa  93.2  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  31.67 
 
 		 203 aa  92.8  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  33.69 
 
 		 188 aa  92.8  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>