More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1783 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01878  excinuclease ABC subunit C  57.14 
 
 
588 aa  696    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000583054  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1733  excinuclease ABC, C subunit  57.05 
 
 
610 aa  724    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110405  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1783  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 
610 aa  1263    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0533171  hitchhiker  0.000000162173 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2109  excinuclease ABC subunit C  58.03 
 
 
610 aa  730    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0217985  hitchhiker  0.00000000000000291711 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2252  excinuclease ABC subunit C  58.69 
 
 
610 aa  731    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000034144  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2676  excinuclease ABC subunit C  99.51 
 
 
609 aa  1258    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00512611  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1174  excinuclease ABC subunit C  58.03 
 
 
610 aa  729    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000294093  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3270  excinuclease ABC subunit C  56.91 
 
 
639 aa  729    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0150435  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2599  excinuclease ABC subunit C  99.51 
 
 
609 aa  1259    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00115318  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1270  excinuclease ABC subunit C  57.05 
 
 
610 aa  724    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000021646  hitchhiker  0.000709379 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1861  excinuclease ABC subunit C  93.92 
 
 
609 aa  1197    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3023  excinuclease ABC, C subunit  50.66 
 
 
607 aa  637    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.623507  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2500  excinuclease ABC subunit C  56.93 
 
 
607 aa  711    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000123696  normal  0.60847 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2374  excinuclease ABC subunit C  52.3 
 
 
607 aa  656    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.483342  normal  0.0306932 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2011  excinuclease ABC subunit C  57.21 
 
 
610 aa  727    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000678771  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2685  excinuclease ABC subunit C  57.21 
 
 
610 aa  727    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000130785  normal  0.0663039 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2140  excinuclease ABC subunit C  58.91 
 
 
608 aa  723    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.604529  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3066  excinuclease ABC subunit C  51.64 
 
 
607 aa  642    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1040  excinuclease ABC subunit C  57.38 
 
 
610 aa  729    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000190411  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2454  excinuclease ABC subunit C  79.97 
 
 
609 aa  1033    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.263996  normal  0.543932 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1640  excinuclease ABC subunit C  96.72 
 
 
609 aa  1202    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00105988  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1954  excinuclease ABC subunit C  80.62 
 
 
609 aa  1037    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00983646  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25040  excinuclease ABC subunit C  51.97 
 
 
607 aa  647    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2151  excinuclease ABC subunit C  79.24 
 
 
609 aa  1024    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.054241  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1193  excinuclease ABC, C subunit  58.46 
 
 
609 aa  722    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1297  excinuclease ABC subunit C  57.87 
 
 
610 aa  729    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000512015  hitchhiker  0.00000387597 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1451  excinuclease ABC subunit C  56.89 
 
 
610 aa  711    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1519  excinuclease ABC subunit C  56.56 
 
 
610 aa  719    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0983209  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1437  excinuclease ABC subunit C  80 
 
 
609 aa  1020    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0535013  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2102  excinuclease ABC subunit C  58.03 
 
 
610 aa  730    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000495467  normal  0.0150424 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2161  excinuclease ABC subunit C  57.7 
 
 
610 aa  727    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138205  hitchhiker  0.0000000035589 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1825  excinuclease ABC subunit C  81.12 
 
 
609 aa  1046    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.088783  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  53.31 
 
 
609 aa  662    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2449  excinuclease ABC subunit C  58.21 
 
 
608 aa  726    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0823614  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2355  excinuclease ABC subunit C  58.43 
 
 
617 aa  731    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0361706  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003099  excinuclease ABC subunit C  57.56 
 
 
588 aa  696    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000908036  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1726  excinuclease ABC subunit C  57.21 
 
 
610 aa  726    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000100265  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0659  excinuclease ABC subunit C  56.51 
 
 
609 aa  708    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.25379  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2561  excinuclease ABC subunit C  99.18 
 
 
609 aa  1256    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00257936  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1548  excinuclease ABC subunit C  93.6 
 
 
609 aa  1191    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000704584  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1615  excinuclease ABC subunit C  93.43 
 
 
609 aa  1188    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000543557  normal  0.3636 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2648  excinuclease ABC subunit C  79.8 
 
 
610 aa  1010    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.473447  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3374  excinuclease ABC subunit C  51.22 
 
 
607 aa  641    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30660  excinuclease ABC subunit C  52.38 
 
 
608 aa  656    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.385406  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2668  excinuclease ABC subunit C  56.72 
 
 
610 aa  715    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0146387  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2053  excinuclease ABC subunit C  58.27 
 
 
617 aa  727    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000011478  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02747  excinuclease ABC subunit C  57.05 
 
 
588 aa  693    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1609  excinuclease ABC subunit C  93.43 
 
 
609 aa  1187    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000167064  normal  0.0818954 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2614  excinuclease ABC subunit C  52.22 
 
 
608 aa  654    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2146  excinuclease ABC subunit C  57.21 
 
 
610 aa  727    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000023615  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1849  excinuclease ABC subunit C  57.38 
 
 
610 aa  720    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109871  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1595  excinuclease ABC subunit C  56.56 
 
 
610 aa  716    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.31766  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0834  excinuclease ABC subunit C  58.27 
 
 
610 aa  728    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000370037  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1608  excinuclease ABC subunit C  77.85 
 
 
606 aa  1003    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00130294  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2896  excinuclease ABC subunit C  50.33 
 
 
607 aa  632  1e-180  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.189646  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1766  excinuclease ABC subunit C  50.08 
 
 
607 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0738607  decreased coverage  0.000573829 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4098  excinuclease ABC subunit C  50.08 
 
 
607 aa  628  1e-178  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125966  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02086  excinuclease ABC subunit C  53.68 
 
 
544 aa  612  9.999999999999999e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000899057  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3671  excinuclease ABC subunit C  50.26 
 
 
585 aa  608  1e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159711  hitchhiker  0.0000000375345 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  50.58 
 
 
607 aa  607  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  47.88 
 
 
611 aa  603  1.0000000000000001e-171  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1334  excinuclease ABC subunit C  48.42 
 
 
609 aa  600  1e-170  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000285239  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3241  excinuclease ABC, C subunit  50.91 
 
 
607 aa  599  1e-170  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0161382  hitchhiker  0.00210477 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1681  excinuclease ABC, C subunit  48.92 
 
 
626 aa  596  1e-169  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2133  excinuclease ABC subunit C  49.51 
 
 
604 aa  593  1e-168  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00985622  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1276  excinuclease ABC subunit C  47.93 
 
 
609 aa  593  1e-168  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00138903  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  47.12 
 
 
599 aa  590  1e-167  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  48.17 
 
 
613 aa  591  1e-167  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1192  excinuclease ABC, C subunit  49.18 
 
 
619 aa  587  1e-166  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0751579  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  49.26 
 
 
599 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2038  excinuclease ABC subunit C  48.68 
 
 
603 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331579  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2053  excinuclease ABC subunit C  47.27 
 
 
612 aa  574  1.0000000000000001e-162  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.747011 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2698  excinuclease ABC subunit C  48.43 
 
 
618 aa  571  1e-161  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2570  excinuclease ABC subunit C  48.27 
 
 
618 aa  568  1e-161  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  46.85 
 
 
613 aa  570  1e-161  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1410  excinuclease ABC subunit C  47.2 
 
 
621 aa  568  1e-161  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00582  excinuclease ABC subunit C  47.04 
 
 
618 aa  567  1e-160  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1316  excinuclease ABC subunit C  47.04 
 
 
627 aa  567  1e-160  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.235211  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1803  excinuclease ABC, C subunit  47.9 
 
 
657 aa  556  1e-157  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0340936  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1403  excinuclease ABC subunit C  46.53 
 
 
614 aa  551  1e-155  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.252536  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0205  excinuclease ABC subunit C  47.18 
 
 
614 aa  547  1e-154  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0351181  normal  0.308964 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2306  excinuclease ABC subunit C  46.7 
 
 
605 aa  546  1e-154  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.391453  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2013  excinuclease ABC subunit C  47.57 
 
 
614 aa  538  1e-151  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.117598  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1271  excinuclease ABC subunit C  47.2 
 
 
606 aa  535  1e-150  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2316  excinuclease ABC subunit C  46.54 
 
 
645 aa  531  1e-149  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.682688  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0853  excinuclease ABC, C subunit  44.41 
 
 
608 aa  520  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0701  excinuclease ABC subunit C  45.94 
 
 
598 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.233077 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0979  excinuclease ABC, C subunit  44.54 
 
 
623 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0363417 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0936  excinuclease ABC subunit C  43.28 
 
 
657 aa  514  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.581594  normal  0.110547 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1001  excinuclease ABC subunit C  43.75 
 
 
657 aa  514  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.73532  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1071  excinuclease ABC subunit C  42.61 
 
 
654 aa  503  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.00000538512  normal  0.216036 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2161  excinuclease ABC subunit C  40.69 
 
 
674 aa  486  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.263968 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4255  excinuclease ABC subunit C  40.36 
 
 
677 aa  484  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.27889  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1627  excinuclease ABC subunit C  42.14 
 
 
649 aa  479  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2244  excinuclease ABC subunit C  41.04 
 
 
663 aa  477  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2410  excinuclease ABC subunit C  40.74 
 
 
673 aa  477  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.308713  hitchhiker  0.000953685 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1019  excinuclease ABC subunit C  40.09 
 
 
684 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114773  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1783  excinuclease ABC subunit C  41.84 
 
 
653 aa  478  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1932  excinuclease ABC subunit C  41.42 
 
 
692 aa  474  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0596454 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1101  excinuclease ABC subunit C  39.62 
 
 
682 aa  475  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>