19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1689 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1689  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  297  4e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000207896  hitchhiker  0.00865349 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2774  hypothetical protein  99.31 
 
 
144 aa  295  2e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000243712  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2676  hypothetical protein  98.61 
 
 
144 aa  293  5e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000906467  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2695  hypothetical protein  98.61 
 
 
144 aa  293  5e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000059883  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1489  hypothetical protein  85.42 
 
 
144 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000234545  normal  0.878766 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1548  hypothetical protein  85.42 
 
 
144 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000222885  normal  0.0948256 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1554  hypothetical protein  84.72 
 
 
144 aa  237  4e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000459273  normal  0.148457 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2917  hypothetical protein  82.64 
 
 
143 aa  231  4.0000000000000004e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2383  hypothetical protein  84.03 
 
 
142 aa  228  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000246073  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2395  hypothetical protein  65.73 
 
 
143 aa  205  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000053326  normal  0.472241 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1703  hypothetical protein  65.47 
 
 
143 aa  203  6e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000496418  normal  0.011388 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1493  hypothetical protein  60.69 
 
 
145 aa  191  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000000411301  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1448  hypothetical protein  60.42 
 
 
150 aa  186  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000358509  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1667  hypothetical protein  54.9 
 
 
154 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000299322  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2411  hypothetical protein  65.22 
 
 
141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000163598  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2888  hypothetical protein  58.78 
 
 
131 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000122874  decreased coverage  0.00000058531 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2518  putative lipoprotein  27.21 
 
 
150 aa  57  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02169  putative lipoprotein  24.83 
 
 
152 aa  56.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2250  putative lipoprotein  23.13 
 
 
148 aa  54.7  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.77177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>