17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1599 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1599  hypothetical protein  100 
 
 
66 aa  132  2e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00429236  hitchhiker  0.000564563 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2777  hypothetical protein  95.38 
 
 
66 aa  124  4e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.627073  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2759  hypothetical protein  95.38 
 
 
66 aa  124  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2854  hypothetical protein  95.24 
 
 
64 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00061048 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2458  hypothetical protein  76.92 
 
 
66 aa  101  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1409  hypothetical protein  47.54 
 
 
86 aa  70.9  6e-12  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000729116 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1474  hypothetical protein  47.54 
 
 
86 aa  70.9  6e-12  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.385484  normal  0.0620683 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3087  hypothetical protein  54.55 
 
 
69 aa  69.7  1e-11  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1462  hypothetical protein  44.62 
 
 
69 aa  68.9  2e-11  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.46268e-05 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2166  hypothetical protein  54.55 
 
 
81 aa  58.5  3e-08  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.449488  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2675  hypothetical protein  44.44 
 
 
70 aa  56.2  2e-07  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2424  hypothetical protein  38.6 
 
 
68 aa  56.2  2e-07  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.13368 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2597  hypothetical protein  41.27 
 
 
65 aa  51.2  4e-06  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3025  hypothetical protein  44.64 
 
 
68 aa  50.8  6e-06  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.256458  normal  0.331353 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1531  hypothetical protein  38.71 
 
 
66 aa  50.1  1e-05  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1630  hypothetical protein  40.91 
 
 
74 aa  47.8  6e-05  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.97673  normal  0.0442479 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02699  hypothetical protein  35.29 
 
 
65 aa  41.6  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>