109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1546 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1546  protein of unknown function DUF606  100 
 
 
144 aa  277  3e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2830  hypothetical protein  98.61 
 
 
144 aa  274  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2955  hypothetical protein  97.92 
 
 
144 aa  272  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0533653 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1093  hypothetical protein  78.32 
 
 
144 aa  229  7.000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.962371  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2578  protein of unknown function DUF606  79.72 
 
 
144 aa  212  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0049  hypothetical protein  74.83 
 
 
144 aa  191  3e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0539536  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1328  hypothetical protein  74.83 
 
 
144 aa  191  3e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.880561 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3766  hypothetical protein  62.6 
 
 
162 aa  153  7e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0823  hypothetical protein  57.98 
 
 
142 aa  131  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0048  hypothetical protein  39.26 
 
 
154 aa  96.7  9e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0915956  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1547  protein of unknown function DUF606  35.42 
 
 
149 aa  92.8  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1329  hypothetical protein  38.41 
 
 
154 aa  92  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.886868 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0822  hypothetical protein  39.02 
 
 
160 aa  91.3  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2829  hypothetical protein  34.72 
 
 
149 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2954  hypothetical protein  34.72 
 
 
149 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0533653 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2509  protein of unknown function DUF606  35 
 
 
144 aa  90.9  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2811  hypothetical protein  33.33 
 
 
149 aa  86.7  9e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.989638  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3765  hypothetical protein  35.61 
 
 
151 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2577  protein of unknown function DUF606  33.33 
 
 
183 aa  84.3  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1092  hypothetical protein  37.72 
 
 
163 aa  79  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3699  hypothetical protein  31.25 
 
 
146 aa  75.5  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1459  protein of unknown function DUF606  34.65 
 
 
149 aa  63.5  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3434  protein of unknown function DUF606  31.34 
 
 
148 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0036  hypothetical protein  30.43 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0814  protein of unknown function DUF606  28.57 
 
 
148 aa  61.6  0.000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2693  hypothetical protein  34.75 
 
 
137 aa  60.8  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.320662  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4070  hypothetical protein  34.27 
 
 
145 aa  60.5  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000215234  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0268  hypothetical protein  34.46 
 
 
146 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4141  hypothetical protein  35.56 
 
 
156 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0326  hypothetical protein  34.88 
 
 
132 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.845681  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0378  protein of unknown function DUF606  31.29 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.918224 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7394  hypothetical protein  35.56 
 
 
156 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0620055  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2825  hypothetical protein  27.89 
 
 
172 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1974  hypothetical protein  40.26 
 
 
176 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4323  hypothetical protein  35.9 
 
 
163 aa  57.4  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313057  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1865  protein of unknown function DUF606  35.9 
 
 
144 aa  57  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.522195 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2679  hypothetical protein  35.21 
 
 
145 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2636  hypothetical protein  30.28 
 
 
145 aa  56.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000297964  normal  0.681431 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0252  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20760  hypothetical protein  26.24 
 
 
147 aa  55.5  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000416993  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5702  hypothetical protein  34.75 
 
 
161 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2952  protein of unknown function DUF606  26.81 
 
 
146 aa  54.3  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0202  protein of unknown function DUF606  28.99 
 
 
142 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6654  protein of unknown function DUF606  33.33 
 
 
160 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776475  normal  0.0686008 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4040  protein of unknown function DUF606  30.41 
 
 
148 aa  54.7  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000995458 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0200  hypothetical protein  34.29 
 
 
153 aa  54.3  0.0000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3013  protein of unknown function DUF606  32.17 
 
 
146 aa  53.9  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.442084  normal  0.195062 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0521  protein of unknown function DUF606  30.77 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00661501  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5246  hypothetical protein  30.6 
 
 
184 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.197347 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2381  protein of unknown function DUF606  32.14 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1923  protein of unknown function DUF606  32.41 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000281356  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1394  hypothetical protein  38.26 
 
 
170 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  hitchhiker  0.00247418 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3639  hypothetical protein  33.06 
 
 
174 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0326  hypothetical protein  31.82 
 
 
144 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.649286  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1669  protein of unknown function DUF606  38.83 
 
 
178 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.304547  normal  0.52087 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1162  hypothetical protein  34.67 
 
 
151 aa  51.2  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3721  hypothetical protein  30.77 
 
 
148 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.230408  normal  0.105166 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0418  protein of unknown function DUF606  26.39 
 
 
146 aa  50.4  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.47239 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3609  hypothetical protein  27.93 
 
 
176 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2345  hypothetical protein  30.22 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.785933  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2001  hypothetical protein  31.06 
 
 
318 aa  49.7  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3106  hypothetical protein  27.93 
 
 
172 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3039  protein of unknown function DUF606  28.12 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1317  hypothetical protein  32.89 
 
 
162 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3239  hypothetical protein  28.21 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2306  hypothetical protein  27.93 
 
 
172 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385132  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6145  hypothetical protein  25.89 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6155  hypothetical protein  27.7 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0012  protein of unknown function DUF606  32.84 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0262  protein of unknown function DUF606  27.27 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1161  hypothetical protein  37.65 
 
 
164 aa  48.5  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.275769  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2106  protein of unknown function DUF606  33.33 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0923123 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0736  hypothetical protein  28.26 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300113  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3163  hypothetical protein  28.99 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.539939  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0370  hypothetical protein  28.38 
 
 
163 aa  47.8  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0091  hypothetical protein  27.97 
 
 
148 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5229  hypothetical protein  31.03 
 
 
147 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274596  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0276  hypothetical protein  30.43 
 
 
297 aa  47.4  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0196948  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1920  hypothetical protein  30.25 
 
 
147 aa  47.8  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3563  protein of unknown function DUF606  28.21 
 
 
148 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.452592  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0641  hypothetical protein  35.21 
 
 
309 aa  47.4  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0656  hypothetical protein  35.21 
 
 
309 aa  47.4  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.473315  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1137  hypothetical protein  29.66 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206431  normal  0.232987 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2916  hypothetical protein  29.11 
 
 
151 aa  46.2  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1919  hypothetical protein  29.73 
 
 
307 aa  46.6  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0176  hypothetical protein  36.5 
 
 
172 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3312  hypothetical protein  29.89 
 
 
167 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.92145  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21090  hypothetical protein  27.27 
 
 
151 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.577572  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5055  hypothetical protein  29.89 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0485  hypothetical protein  27.27 
 
 
178 aa  45.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.482808  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0320  hypothetical protein  39.76 
 
 
146 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0539  protein of unknown function DUF606  29.49 
 
 
147 aa  45.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.907326  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0835  hypothetical protein  28.09 
 
 
317 aa  44.7  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3455  hypothetical protein  28.67 
 
 
140 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.229376  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0608  hypothetical protein  31.03 
 
 
147 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1800  hypothetical protein  30.86 
 
 
151 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0761  hypothetical protein  30.58 
 
 
151 aa  43.9  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3229  membrane-spanning protein  27.46 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000183039  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3482  hypothetical protein  27.46 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0187664  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1793  hypothetical protein  29.37 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>