More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1545 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_2831  LysR family transcriptional regulator  99.36 
 
 		 312 aa  643    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2956  LysR family transcriptional regulator  99.36 
 
 		 312 aa  643    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2813  LysR family transcriptional regulator  99.36 
 
 		 312 aa  643    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1545  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 312 aa  647    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.813324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2579  transcriptional regulator, LysR family  60.13 
 
 		 311 aa  418  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1094  LysR family transcriptional regulator  61.49 
 
 		 317 aa  416  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0050  LysR family transcriptional regulator  59.87 
 
 		 311 aa  404  1e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.142799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1327  LysR family transcriptional regulator  59.55 
 
 		 311 aa  403  1e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.893209 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3767  LysR family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 311 aa  317  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0824  LysR family transcriptional regulator  41.64 
 
 		 309 aa  233  3e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2043  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 304 aa  189  5e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0465  LysR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 306 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0491  LysR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 306 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.631121  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2614  LysR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 306 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00915901  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3581  LysR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 306 aa  186  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 305 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1861  LysR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.836857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3853  LysR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0876219  normal  0.133098 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2131  LysR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0617506  normal  0.31287 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1471  LysR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.580459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1436  LysR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 317 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.634744  normal  0.320614 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6129  LysR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 305 aa  183  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11490  Transcriptional regulator, LysR family  34.67 
 
 		 327 aa  182  8.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.135778  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01682  transcription regulator protein  30.9 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1356  LysR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 301 aa  179  4e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3995  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 318 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000135296  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15310  transcriptional regulatory protein, LysR family  34.11 
 
 		 318 aa  179  7e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.313751  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2408  LysR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 294 aa  179  7e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0423159  normal  0.525947 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4204  LysR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0225  transcriptional regulator, LysR family  31.58 
 
 		 309 aa  176  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4232  carbonate dehydratase  32.76 
 
 		 289 aa  176  6e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232431 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1211  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159802  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  33.56 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1682  putative transcriptional regulator  30.59 
 
 		 308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177927  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1939  transcriptional regulator, LysR family  33.57 
 
 		 292 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.775483 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5648  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 304 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0393  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 298 aa  172  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00156411  normal  0.514567 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0449  transcriptional regulator, LysR family  33.99 
 
 		 298 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2192  LysR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 293 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.257142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2420  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 292 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1390  LysR family transcriptional regulator  32.01 
 
 		 322 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2695  LysR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 313 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1149  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 305 aa  172  9e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.181713  normal  0.966665 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2250  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2307  putative transcriptional regulator  32.89 
 
 		 318 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2527  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 292 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.618648 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4560  LysR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.788363  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5398  transcriptional regulator, LysR family  32.53 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187721  normal  0.0384441 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1785  LysR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 293 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  34.58 
 
 		 299 aa  170  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4581  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 315 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3498  LysR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 298 aa  170  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00180927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2409  LysR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 292 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.687274  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0816  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 289 aa  170  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 295 aa  170  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2053  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 291 aa  170  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0493  transcriptional regulator, LysR family  33.77 
 
 		 298 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3222  LysR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 305 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4938  LysR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 305 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1919  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 307 aa  169  4e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2175  LysR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 292 aa  169  4e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 302 aa  169  6e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1836  LysR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 293 aa  169  7e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.471013 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06921  transcriptional regulator  32.08 
 
 		 289 aa  169  8e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1970  LysR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 299 aa  169  8e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27250  LysR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 339 aa  168  9e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0388  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 304 aa  168  9e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6421  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 305 aa  168  9e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5774  LysR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1277  LysR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 299 aa  168  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.927239  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0719  LysR family transcriptional regulator  34.49 
 
 		 303 aa  168  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5917  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5552  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1422  transcriptional regulator, LysR family  32.87 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1499  transcriptional regulator, LysR family  32.99 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456019 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0165  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 289 aa  167  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.705858  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0372  LysR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 292 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2679  transcriptional regulator, LysR family  31.88 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3768  LysR, substrate-binding  31.8 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5534  LysR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0321  transcriptional regulator, LysR family  33.44 
 
 		 298 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3612  transcriptional regulator, LysR family  32.55 
 
 		 307 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.155028 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4660  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 298 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.727682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3621  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 298 aa  166  4e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3440  transcriptional regulator, LysR family protein  30.93 
 
 		 289 aa  166  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2456  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 313 aa  166  5e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.161377  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 296 aa  166  5e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0266  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  33.01 
 
 		 302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2531  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3681  LysR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0791735  normal  0.203208 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2533  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0678  LysR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.569354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2666  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4209  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 		 304 aa  163  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>