40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1498 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1498  lipoprotein, putative  100 
 
 
235 aa  481  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  1.76994e-07  normal  0.35232 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2878  putative lipoprotein  100 
 
 
235 aa  481  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.89272e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2521  putative lipoprotein  67.37 
 
 
236 aa  336  2e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.43848  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2861  putative lipoprotein  66.1 
 
 
235 aa  329  2e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  2.31875e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3007  putative lipoprotein  66.38 
 
 
235 aa  325  5e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000100687  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3157  putative lipoprotein  65.68 
 
 
236 aa  325  5e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1395  putative lipoprotein  63.45 
 
 
236 aa  319  3e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.19041  normal  0.0366327 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1342  putative lipoprotein  62.61 
 
 
236 aa  313  2e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028358 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1407  putative lipoprotein  61.76 
 
 
236 aa  309  2e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3012  putative lipoprotein  38.26 
 
 
225 aa  164  8e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  2.8974e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1322  putative lipoprotein  36.96 
 
 
225 aa  161  8e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00089684  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2845  putative lipoprotein  34.21 
 
 
224 aa  149  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0274  putative lipoprotein  37.44 
 
 
221 aa  145  7e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00685  hypothetical protein  33.02 
 
 
224 aa  121  8e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0791  putative regulator  30.13 
 
 
234 aa  114  1e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  2.59284e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001789  hypothetical protein  30.99 
 
 
226 aa  113  2e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1222  group 4 capsule (G4C) polysaccharide, lipoprotein YmcC  28.76 
 
 
214 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  2.33631e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2329  group 4 capsule (G4C) polysaccharide, lipoprotein YmcC  28.76 
 
 
214 aa  100  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  2.55806e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2610  putative regulator  28.76 
 
 
214 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.283606 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00996  hypothetical protein  28.76 
 
 
214 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00989  predicted outer membrane lipoprotein  28.76 
 
 
214 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2657  group 4 capsule (G4C) polysaccharide, lipoprotein YmcC  28.76 
 
 
214 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112899  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1096  group 4 capsule (G4C) polysaccharide, lipoprotein YmcC  28.76 
 
 
214 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1102  group 4 capsule (G4C) polysaccharide, lipoprotein YmcC  28.76 
 
 
214 aa  100  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  2.92395e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4266  hypothetical protein  28.14 
 
 
222 aa  81.6  1e-14  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4480  hypothetical protein  28.7 
 
 
212 aa  80.9  1e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4414  hypothetical protein  28.7 
 
 
212 aa  80.9  1e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0127053 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4565  hypothetical protein  28.7 
 
 
212 aa  80.9  2e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.574864  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4575  hypothetical protein  27.71 
 
 
222 aa  80.9  2e-14  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4617  hypothetical protein  28.7 
 
 
212 aa  80.5  2e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.425687 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4565  hypothetical protein  28.7 
 
 
212 aa  80.1  3e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0399396 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0232  lipoprotein  28.7 
 
 
212 aa  79.7  4e-14  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.231954  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4488  hypothetical protein  28.51 
 
 
212 aa  79.7  4e-14  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3970  conserved hypothetical protein  28.05 
 
 
212 aa  77.8  1e-13  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03899  predicted lipoprotein  28.05 
 
 
212 aa  75.9  5e-13  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4003  hypothetical protein  28.05 
 
 
212 aa  75.9  5e-13  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.401316 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03859  hypothetical protein  28.05 
 
 
212 aa  75.9  5e-13  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5506  hypothetical protein  27.4 
 
 
212 aa  72.4  5e-12  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4532  hypothetical protein  27.94 
 
 
232 aa  71.6  9e-12  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3202  hypothetical protein  25.1 
 
 
224 aa  63.5  3e-09  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.210249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>