More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1457 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3868  chemotaxis protein CheA  61.72 
 
 
748 aa  638    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146228  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4338  CheA signal transduction histidine kinase  60.98 
 
 
747 aa  635    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505907  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1522  chemotaxis protein CheA  62.63 
 
 
714 aa  872    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  51.99 
 
 
719 aa  723    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3207  chemotaxis protein  82.39 
 
 
758 aa  1180    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2556  CheA signal transduction histidine kinase  82.98 
 
 
741 aa  1191    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3434  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  57.09 
 
 
758 aa  773    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223836  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1381  CheA signal transduction histidine kinase  73.04 
 
 
741 aa  1072    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1457  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
746 aa  1493    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0417438  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1566  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  56.29 
 
 
754 aa  766    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396525  normal  0.0694076 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  55.71 
 
 
745 aa  781    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1386  CheA signal transduction histidine kinase  76.86 
 
 
746 aa  1075    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.524056  normal  0.224897 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3046  CheA signal transduction histidine kinase  73.42 
 
 
733 aa  1050    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0699777 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02867  chemotaxis protein cheA  63.82 
 
 
751 aa  889    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03141  hypothetical protein  61.6 
 
 
744 aa  815    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2906  CheA signal transduction histidine kinase  99.2 
 
 
747 aa  1402    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  57.54 
 
 
767 aa  793    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1638  CheA signal transduction histidine kinase  72.67 
 
 
733 aa  1050    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002835  chemotaxis protein CheA  61.5 
 
 
744 aa  836    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.758012  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1529  CheA signal transduction histidine kinase  55.97 
 
 
747 aa  775    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407348  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1346  ATP-binding region, ATPase-like protein  75.99 
 
 
734 aa  1057    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2287  chemotaxis protein CheA  62.63 
 
 
723 aa  855    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2802  CheA signal transduction histidine kinase  57.01 
 
 
737 aa  764    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.787874  normal  0.174869 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3664  CheA signal transduction histidine kinase  57.37 
 
 
739 aa  782    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.297315  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2916  CheA signal transduction histidine kinase  98.13 
 
 
747 aa  1389    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  61.75 
 
 
754 aa  873    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1302  CheA signal transduction histidine kinases  81.72 
 
 
760 aa  1207    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.345231  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1369  CheA signal transduction histidine kinases  81.38 
 
 
762 aa  1178    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.743418  normal  0.202802 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0988  CheA signal transduction histidine kinases  52.21 
 
 
734 aa  713    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.581275 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  79.26 
 
 
736 aa  1132    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3048  CheA signal transduction histidine kinase  97.18 
 
 
738 aa  1335    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  56.53 
 
 
691 aa  728    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1651  chemotaxis protein CheA  58.09 
 
 
785 aa  810    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.770594  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45590  putative two-component sensor  61.3 
 
 
753 aa  635    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.267862 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1362  CheA signal transduction histidine kinases  80.34 
 
 
762 aa  1163    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0955234 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3907  CheA signal transduction histidine kinase  55.34 
 
 
743 aa  789    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.408292  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  75.29 
 
 
759 aa  1082    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1972  CheA signal transduction histidine kinase  57.01 
 
 
709 aa  771    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1982  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  61.23 
 
 
748 aa  634  1e-180  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  46.97 
 
 
650 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00954  chemotaxis protein CheA  55 
 
 
552 aa  419  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.32491  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06212  chemotaxis protein CheA  55 
 
 
552 aa  419  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.186307  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 
687 aa  409  1.0000000000000001e-112  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 
713 aa  397  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  45.01 
 
 
770 aa  380  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  42.48 
 
 
769 aa  381  1e-104  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  42.92 
 
 
770 aa  379  1e-104  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  38.98 
 
 
769 aa  379  1e-103  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  41.88 
 
 
769 aa  378  1e-103  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  46.59 
 
 
783 aa  374  1e-102  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  34 
 
 
697 aa  371  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  41.53 
 
 
785 aa  367  1e-100  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  42.51 
 
 
803 aa  369  1e-100  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  42.69 
 
 
774 aa  367  1e-100  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  48.79 
 
 
681 aa  368  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  46.84 
 
 
770 aa  367  1e-100  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  43.59 
 
 
701 aa  361  3e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 
694 aa  359  9.999999999999999e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  41.09 
 
 
604 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  45.14 
 
 
677 aa  353  5e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  45.01 
 
 
639 aa  352  1e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  41.83 
 
 
598 aa  351  3e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  45.78 
 
 
606 aa  350  7e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  44.67 
 
 
691 aa  350  7e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  45.18 
 
 
601 aa  350  8e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  40.67 
 
 
603 aa  346  1e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  44.58 
 
 
610 aa  345  2e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2364  CheA signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 
724 aa  345  2e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219649  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  43.57 
 
 
673 aa  345  2.9999999999999997e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  43.75 
 
 
666 aa  344  2.9999999999999997e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2218  CheA signal transduction histidine kinases  33.11 
 
 
704 aa  343  7e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  46.55 
 
 
696 aa  343  7e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  33.25 
 
 
724 aa  343  9e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  44.09 
 
 
671 aa  343  9e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2247  CheA signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
728 aa  342  2e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.390749  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  45.43 
 
 
673 aa  342  2e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  41.27 
 
 
607 aa  341  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3221  CheA signal transduction histidine kinase  45.39 
 
 
635 aa  340  4e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  39.75 
 
 
685 aa  339  9.999999999999999e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  42.26 
 
 
652 aa  339  9.999999999999999e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0933  CheA signal transduction histidine kinase  43.25 
 
 
674 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  43.57 
 
 
671 aa  336  1e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  43.58 
 
 
695 aa  334  3e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  42.43 
 
 
675 aa  334  4e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1518  chemotaxis protein  31.06 
 
 
667 aa  333  7.000000000000001e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1728  chemotaxis protein CheA  31.06 
 
 
667 aa  333  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4224  CheA signal transduction histidine kinases  44.5 
 
 
801 aa  333  7.000000000000001e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.424073  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2940  CheA signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 
708 aa  333  1e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0174  CheA signal transduction histidine kinase  40.92 
 
 
919 aa  332  1e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00798527  normal  0.714787 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1728  CheA signal transduction histidine kinase  41.06 
 
 
919 aa  333  1e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 
695 aa  332  1e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  43.29 
 
 
660 aa  331  2e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1696  chemotaxis protein CheA  30.7 
 
 
672 aa  331  3e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  32.98 
 
 
715 aa  330  5.0000000000000004e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  43.56 
 
 
1089 aa  330  7e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  40.29 
 
 
728 aa  330  8e-89  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  45.26 
 
 
655 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1282  CheA signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 
697 aa  328  3e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000564887 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  32.93 
 
 
669 aa  327  5e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0868  CheA signal transduction histidine kinase  42.76 
 
 
1063 aa  327  5e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>